Schizosaccharomyces pombe (fission yeast): 2539580
Help
Entry
2539580 CDS
T00076
Symbol
rgf1, SPOM_SPCC645.07
Name
(RefSeq) RhoGEF family guanine nucleotide exchange factor Rgf1
KO
K19842
RHO1 GDP-GTP exchange protein 1/2
Organism
spo
Schizosaccharomyces pombe (fission yeast)
Pathway
spo04011
MAPK signaling pathway - yeast
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
spo00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04011 MAPK signaling pathway - yeast
2539580 (rgf1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CNH
PH_5
RhoGEF
DEP
SOS1_NGEF_PH
PH
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
2539580
NCBI-ProteinID:
NP_588116
PomBase:
SPCC645.07
SPCC645.07.1
UniProt:
Q9Y7U6
LinkDB
All DBs
Position
III:join(1245263..1247944,1247991..1249313)
Genome browser
AA seq
1334 aa
AA seq
DB search
MDYRHPNALGVNESSRAYEEIFGAPRKREPARTVSTPAFMEPAPVSKKPLPPPTRRLPRK
PLPFRSTSLQPPSSQPPAPPTHQREASPVKNIEHSESFPSVFGTSNNHQIVPLTLKDGND
FGALYASLNTTPHFPQVSNHAPNNSNSPSLTWHTSSGDDSNQNPFFVRRQSQSSTSPVSD
SVDENLLSAVSSVTESVETNLHLDQNYPYGSPVRSSKNPFLSSNSRLPTDDSSHTVGSHS
FTSGTHPPIVSSNSAFTLPNAVTPAAQAPLIRSVSEYPANVSPPAQSLQLPKSTSNPADL
HLSIASASSHKNIFSGLDVFSNVFHGPSTTLRDREHDMRNRSFDHSTLAHYEAVKQQRLG
VEPTARSFTLSSYKSRASGNSLINDRSSTTTPTFVNSEASSPVHKNKRRRRIYAALLSRV
ASELLDRLQLGDITKDGLIYSNAFTGDHAVTVLMGIIHTSDRNLALLVGRSLDAQKFIHD
VTYDHRLRDSHREIYQLQGTGYRPFLRANDNASINNKNHHKELEDNESGTRISPSTLGDT
SFPNGIFTLLTHCYSPTCAKDHPCYSISCPRRLEQQHRLFAKMRANTEQSSSLAFDDKEQ
KLWIHSVPQEIAYSVSDRERKRQEVICEVIYTERDFVKDLEYLRDYWIKPLWASSCIPER
KKEKFIRTVFLNALEVQAVNSKLAEALTKRQNYKPIVDNIADIFLEHVPKFEPFIRYGAG
QLYGKYEFEKEKSSNPAFAKFVSDVERLKESRKLELNGYLTKPTTRLARYPLLLEAVLKY
TDEGNPDKQDIPKVINIVRGFLSRLNVESGKAENKFNLFHLNQQLVFKPGEHYDLHLLDA
NRQLIFKGPLKKRSAGSTSSESASDVTLFLFDHALLIVKPKTINKRELLKVFQRPIPLLL
LQLFLVDDNGLRIPYSSKQQLAAVSKAANGKPPSRFYPFSLQLLGRRGYEITLYATTEVS
RDKWLEHIDNQQTLLQHRNQWFESVTICSNFFVGDNKVNAIGVYDSGRRLLYGTDTGVYV
SLRKANSPLQFKPVRALNIPNISQLEVIEEYSLLLLLSDKVLYSYPLEMIDADTTQAPKK
ARKVSGHTTFFRVGICLGKVLVCAVKSSVLSATIKVFEPVTNYSKTRNMPSLKKFLTVNQ
DPLRIVKELYIPTESTSVHFLKNKLCVGCTRGFEVVSLDNLETQSLLDPADTSLEFVEKK
ENVKPIAIYRMNGGEFLLCYSQFAFYVNRDGWRSRPTWFVVWEGSPQNFALSYPYILAFE
PTFIEIRHVETSELIHVISGRNIRLLADGRGKLGDGGEIFYACDQRGENCETSVVCSLRL
TSAAAHAKEQHVDK
NT seq
4005 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattaccggcatccaaatgcactcggtgtgaatgagagctcgcgtgcttatgaggaa
atttttggtgctccaagaaaacgggagccggcgagaactgtaagtactcctgcgttcatg
gaaccggctccagtctcaaaaaaacctcttcctcctcccacgcgaaggcttcctcggaaa
cctttgccctttcgttccacgagtttgcagcctccatcgtctcaacctcctgcacctcca
actcatcagagagaagcatctcctgtgaaaaatattgagcacagtgaatcttttccttcc
gtttttggtacttcaaataatcaccagatcgtcccattgactcttaaagacggaaatgat
tttggtgctctatatgcatctttaaacaccacaccccattttcctcaggtatcgaatcat
gcgcccaataactctaattccccttctttgacttggcacacatcatccggtgatgattcc
aaccaaaatccttttttcgttcggcgtcagtctcagagtagcacgtctccggtttcggat
tcagtagatgagaacctcctttcagcagtctcttctgttacagagtccgtagaaacaaac
cttcatctcgatcaaaattatccttacggctctcctgttcgttcgtctaaaaatcccttt
ctctcttcaaattctcgattaccaactgatgattcttctcacactgttggttctcattca
tttacttcaggaactcacccacccattgtttcttctaattccgcctttacacttcccaat
gctgttactcctgcagctcaagcacctctcatacgtagtgttagtgaatatcctgctaac
gtttctccacctgcccagtcccttcagctaccaaaatctactagcaatcccgcggatctt
catttaagcatagcttctgctagcagccataagaatattttttctgggttggacgtcttt
tctaatgtctttcatggtccctctaccacattacgagacagagaacatgatatgcgaaat
cgctcatttgatcattctaccttggctcattatgaagcagttaagcagcagagacttggt
gttgaacctactgcaaggtcctttacgttgagctcttataagtcccgtgcaagtggaaat
tccctaattaatgatcgaagctctacaacaacgccgacgtttgttaattcggaagctagc
tcgcctgttcataaaaataaacgaagacgcagaatatatgctgccttactttctcgtgtt
gccagcgaattgttagatagactacagctaggtgatatcacgaaagacggtttaatttat
tctaatgcctttactggcgatcatgcagtcaccgtgctaatgggtattatacatacttct
gatagaaatctcgctttacttgtcggacgctctttagatgcacaaaaatttattcatgat
gttacctatgatcatcgtcttcgtgattctcatcgtgaaatatatcagcttcaaggtact
ggttatcgccccttcttacgcgcaaatgataatgcatccattaacaacaaaaaccatcat
aaggaattggaggacaatgagtcgggcactcgaatctcaccgtccacgttaggtgacact
tcttttccaaatggtatatttactttattgacgcattgttactctccaacatgtgcaaaa
gatcatccctgctattctatttcatgtcctcgacgattggaacagcagcacagactattt
gccaaaatgcgtgcaaacactgaacagtcttcctccctagcgtttgatgataaggaacaa
aaattgtggattcacagcgtaccccaggagattgcttatagtgtcagtgaccgggaaaga
aagcgtcaagaagtaatttgtgaggttatctatactgagcgagattttgttaaggatttg
gaatatcttcgggattattggattaaaccactatgggcttcatcttgtatacctgaacga
aaaaaagaaaaatttattcgtactgtgtttttaaatgctttagaggttcaagcagttaat
tctaaattggctgaagctcttactaaaagacaaaactataaacccattgtggataatatt
gcggatatatttttggagcacgttccaaaatttgagcctttcatacgatatggtgcaggc
caactctacggaaaatacgagtttgagaaggaaaagtcatctaatcctgcatttgctaag
tttgtcagtgacgttgaacgtctgaaagaatcacgaaagctagagctaaacggctatctg
actaaaccaactaccagattggctcgttatccattacttctagaagcggtattaaaatat
actgatgagggtaaccctgataaacaagacattccgaaggtcattaatatcgttagagga
tttctctcacgtcttaatgttgaaagcggaaaagcagaaaataagtttaacttgtttcat
ttgaatcaacagctggtctttaaacctggagaacattatgatttacatctgcttgatgcg
aacagacaattaatattcaaaggacccttgaagaaaagaagtgctggttccacttcttca
gagtctgcgtcggatgttactttgtttctctttgaccatgctttgttgatagtaaaacca
aagactattaataaacgtgaattattgaaagtttttcaaagacctattcctctattactt
cttcaactattccttgttgatgataatggattaagaatcccttattcaagtaagcaacaa
ctagcagctgtatcaaaagcagcgaatgggaagccaccttctagattttatccatttagc
ttacaacttttgggtcgtagagggtacgaaatcactctttatgcaaccactgaagttagt
agggataagtggttagagcatattgacaaccaacaaacattgctacaacatcgtaaccag
tggtttgagtctgttaccatttgctctaatttctttgttggtgataataaagtaaatgcg
ataggcgtttatgatagtggtcgtcgacttttatatgggactgacacaggtgtgtacgtc
tctcttcgaaaagcaaacagcccacttcaattcaagcctgtacgtgcgttaaatattccc
aacatttcacagcttgaggttattgaagagtatagtttattgctactgctttccgataag
gtgttatattcgtatcctttggaaatgattgatgcggatactactcaagcccctaaaaaa
gcaaggaaagtttctggtcatacaactttctttcgcgtaggaatttgtctgggtaaagtt
cttgtgtgtgctgtcaaaagttccgtcttgagtgctactataaaggtttttgaaccagtc
actaattactctaaaacacggaacatgccaagcttgaaaaaattccttactgttaaccaa
gacccattgaggattgtcaaagagctttatatacccacggaatcaacttcggttcacttc
ctgaagaataaactctgtgtcggatgtacgagaggttttgaggtggtcagtctcgataac
ctagagacgcagtctctactggatccagccgatacgtctcttgaatttgtggagaagaaa
gaaaatgttaaacctatcgctatctatcgtatgaatggcggtgaatttcttttatgctat
tcccaatttgctttttacgtaaatcgagatggatggcgttctcgtcctacatggtttgtt
gtttgggaaggaagtcctcaaaactttgccttaagttatccttatatattggcttttgaa
cccacttttattgaaatcagacatgttgaaacctctgaattgatccatgtcatttccggc
agaaacatccgtttgcttgctgatggaagaggaaagttaggggacggtggtgaaatattt
tatgcgtgcgatcaacgtggtgaaaattgtgagacaagtgttgtttgttcccttcgattg
acgagtgctgctgcccacgccaaagagcagcatgtagacaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
