Schizosaccharomyces pombe (fission yeast): 2543467
Help
Entry
2543467 CDS
T00076
Symbol
srb8, SPOM_SPAC688.08
Name
(RefSeq) mediator complex subunit Med12
KO
K15163
mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12, fungi type
Organism
spo
Schizosaccharomyces pombe (fission yeast)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
spo00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
spo03021
]
2543467 (srb8)
Transcription machinery [BR:
spo03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase II system
Mediator complex
CDK-module
2543467 (srb8)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Med12
Fip1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
2543467
NCBI-ProteinID:
NP_001417945
PomBase:
SPAC688.08
SPAC688.08.1
LinkDB
All DBs
Position
I:join(3123163..3125118,3125118..3126310,3126356..3126653)
Genome browser
AA seq
1148 aa
AA seq
DB search
MSNRDSANPPGFNDAVPLAICYIDSSTSSHDEYLTLLQSKVSAPDKNFRDETVDGAPFLA
GDAISKGHRYSPPVRSDRASAQGLLQQHLEKSSTLENLKRYSSTLLGRQNDAVIDEPFAP
FRPPPRVTLSESRRDRWLQGLSDPMVPLSSLIKTIPHGLWGEDILRMLVKFRVPFTRAIW
FIRCAGVNEARSFLRKVQTTDITEWVKNWTDVAAGFLISFISSFLNADIYSFADDYTYLL
KLFGRLLAEELVSPKHFLLRIVSFSGDSSLKSFSLHFFALQFFSTSLIQYTHICRKCVIT
ILQSYQQLIVDQPANLLKFSLLSKKVSHFLFTLAQKNIESFFFPTEWDKLKPTIILLWKD
FPNYSTLLSIMQERNSKAMYMYKPVTSSIRFLQIISCLSFPVGWRTLAKDLFKLLPVYTG
VPLLLHWCINCRSIFSGDRNFIVSSIFDNANFDRNLIVDLTLSFVLKLHPLEYNECVAAA
QLLDHLAACGYFFFSKYIARLASLGYLRESMLNSSFMDDQRKILVQLPILRMSQQLKNKI
YYILSKGNYFVDWSICDEYVKRFKEDHFSFMFKKEENYAIITLSLVKIASTPMSKLYEDY
LVMLFAFHYSMFQVMTKLIADNLVHFSFQSCALIFLYKISSYFVLDAKLFSSICSVVPKT
ESQKLLLNEMGKLFQVELNFSYDSPDVNLLIEQFYEITSYESNYDDAFVEYKDATVANRK
DFIEFLFHNITVSSKHTAVIFTSDLLMVLKIALNHPPYFDDLATTTFSSLLKRDECTILS
FFKILQFYGCKLLSVDQIWAVVSDVYEAQDNNTTLKQFFNYLLDESTWPEGYLEERHWRS
ILCKEARKHDSGLKLFKLGIKLCTRNEQIMKTIWSFIHVHDCNVISEVIPDQRFLRTLTE
HFMIDLRQLDIVTCLKKALVTLDEFSAPLYATWLTTLDDDELSELTDDVVQKKVLESLDN
YKSGIWKLVLSGLPNCKTVFEHLLLFSLEERLDLPAAFLQDLIGASAYVMEQVPDSWFLE
KLPCPLTQSLQSFSHLSNHIEVLDSTRQSRLTFLCHLILHMHGFVELTDQLATLESLTIR
KCIYRNQELLDLLLFSIHLVKPNVETNDEVCNTLKAWENIESRPYTIDFPEALQQYSPRI
VLYEPTFW
NT seq
3447 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcaatcgagattcagcaaaccctccaggctttaatgacgcggtgcccttagctatt
tgctatattgattcttcgaccagttcacacgatgagtacttaacattacttcaaagcaaa
gtttctgctccagataaaaattttcgtgatgagacagtcgacggagctccttttttggca
ggagatgctatttccaaaggccacaggtattcaccacctgtgcgaagtgatagagcatct
gctcagggtttgttacaacaacatcttgaaaaatcaagcactctagaaaatttaaaacga
tattcttctactttgctcggtcggcaaaatgatgcagtaattgatgagccattcgctccg
tttcgtcctccaccaagagttacactttctgagtctagacgtgaccgctggttgcagggt
ttatctgatcccatggtgcccttgtcttctcttattaaaactataccacatggtctatgg
ggagaagatatattacgaatgttggtgaagtttcgagtcccttttactcgagcgatatgg
ttcattcgatgcgctggagtaaatgaggctcgttcatttttacgaaaagtccagacaact
gatataacagaatgggttaaaaattggactgatgttgcagcgggattcttaatttcgttc
atttcgtcttttctaaacgctgatatttactcgttcgctgatgattacacttacctattg
aagctttttggtcgattgctggctgaagagttggtttcgcctaaacattttctattaaga
attgtttccttttcaggggattcttctttaaaatcctttagtcttcacttttttgcttta
cagtttttttctacaagcctgatccagtacacccatatttgtcgtaaatgtgttatcaca
attctgcaaagttatcaacagttaattgtggaccagcctgctaatcttttgaagtttagc
ttgctttcaaaaaaagtatctcattttttatttaccttggctcaaaaaaatattgagtcg
ttcttttttcctactgaatgggacaaattgaaacctactattatattattatggaaggat
tttccaaattatagcacgcttttatctataatgcaggaaagaaactcaaaagccatgtac
atgtacaaacctgtcacaagtagtattcgcttcttgcaaattatttcatgtctttccttt
ccagtgggttggagaacactggctaaagatttgtttaaacttttaccagtttatacaggt
gtgcctcttttactacattggtgtatcaattgccgttctattttttcaggtgatcgaaat
ttcatcgtatcctcaatttttgacaacgccaattttgacagaaatttaattgtggatctg
acattgtcgtttgttttaaaattgcatcctctggagtacaatgaatgtgttgcggcagct
caattacttgatcatctcgcagcatgtggatacttcttcttttcaaagtatattgctaga
cttgcttcattaggttacctgagggaatcgatgcttaattcttctttcatggacgatcag
cgcaagattcttgttcagttgcctattcttcgcatgtctcaacaattgaagaacaaaata
tattatatcctttccaaaggaaattactttgtggattggtcaatttgcgatgaatacgtt
aaacgatttaaagaagaccatttctctttcatgtttaaaaaagaagagaattatgctatc
attaccctgagtcttgttaaaatagcatcgacacctatgtcaaagttatatgaggattac
ctggttatgctttttgcatttcactattcaatgtttcaagtaatgactaagcttattgcc
gacaacttggttcacttcagttttcagtcttgtgcgttaatttttctttataaaatttca
tcttatttcgtactagatgccaaactcttttcttcaatatgttctgttgtgccaaagaca
gaatctcaaaaactcctactgaatgaaatgggaaaattgttccaagttgaattgaatttt
agttatgactcacccgatgtaaatttgctgattgagcagttttatgaaataacatcgtat
gaatcaaactatgacgatgcattcgtagagtacaaggatgctaccgttgcgaataggaaa
gatttcattgaatttttgtttcacaatataactgtctcatcaaaacacacggcagttatt
ttcacatcagacctgcttatggtgttaaagatagctttaaatcatcccccgtattttgat
gacttggcaactacaactttttcaagcttgttgaaacgagacgaatgtactatcctctct
ttttttaaaatactacaattttatggatgcaagttattgtcggtggatcaaatatgggct
gttgtcagtgatgtatacgaagcacaagataataatacaacattgaagcaattttttaat
taccttctagacgaaagcacttggcctgagggttatcttgaagaacgacattggagatca
attttatgtaaagaagctcggaaacatgattctgggttaaagcttttcaaattgggtata
aaactctgtacccgaaatgaacaaataatgaaaactatatggtcctttatacatgtacat
gattgcaatgtcattagcgaggtcattccagatcaaagatttttaagaaccttgacggaa
catttcatgatagatttacgacaattagatatcgttacatgtttgaaaaaggcattggta
actttggatgaattttcggctcctctgtatgcgacctggcttacaactttggatgatgac
gagttatctgaattaactgacgacgttgttcaaaaaaaagttttagaaagtttggacaat
tacaaatcgggaatttggaagcttgtcttgtcagggcttcctaattgcaaaacagttttt
gagcacctcttattgttcagtttggaagaaaggcttgatttaccagcagcctttctccag
gatcttattggtgcatcagcttatgttatggaacaagtaccagattcgtggtttttagag
aaactgccttgtcctttaacccaatctttacaatctttcagtcatctcagcaatcatatt
gaagttttagattctactcgtcaatccagactaactttcctctgtcatttaattttgcat
atgcatgggtttgtcgaattgactgatcaattggctactttagaaagtctgacaatacgc
aagtgtatatatcgtaatcaagaactgttagatcttttattatttagcatccatttggtt
aagccaaatgtagaaacaaatgatgaagtttgtaacaccttgaaggcgtgggagaatatc
gagtcacgtccttataccatcgattttcctgaagctctgcaacagtattcacctagaata
gtgttgtatgagccaaccttttggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
