Spongiibacter sp. IMCC21906: IMCC21906_02260
Help
Entry
IMCC21906_02260 CDS
T03945
Name
(GenBank) OmpA family
KO
K03286
OmpA-OmpF porin, OOP family
Organism
spoi
Spongiibacter sp. IMCC21906
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
spoi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
spoi02000
]
IMCC21906_02260
Transporters [BR:
spoi02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
IMCC21906_02260
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
OmpA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKH69923
UniProt:
A0A0F7M6S4
LinkDB
All DBs
Position
complement(2408385..2410214)
Genome browser
AA seq
609 aa
AA seq
DB search
MALFSRLVSSLFLSLVLAQSATADPISDLLEALGIQSLLRDAPIVGTIGASVLDPNGTGD
NDFLGADALNPENDLGLTLLSGELLGFGNKTGSDTALPLDFLGLGDLLGALGLTYEAGFA
GQLRGLLAQDGMITSALVGTLGDVSSLLSTDLLGLEGFALPNGGVGLPGLNDQPLGLAIL
GAANSGNASSDGLLGLSLLTPGSSGNGGLIGVSVLSGDNSGNGSAIGLAILSGSNSGNGD
NIGASVLGGDNAGNGGDLGVGVLNGNNSGNGGTIGGVAVLNGDNSGNGDLVGVGVLNGAN
SGNGDSIAAGVLNGDNSGNGSVAAAVLNGNNSGNSETISLAGLNGSSSGNSDFATVAAIN
GDNSGNSGTLSVAAINGADSGNSDFASVGALNGSNSGAGGVITVAALNEANGNGGDDAAN
SCATTGGVGCDDHEPLATMETCKDGDGDGICDEDDECKDTPAGAPVFLTGCHLTEDAPLV
LRGVNFEFDKADLTPESIPILEHAVKVLNAQPSALVAVDGHTDAKGSFEYNDKLSYRRAG
TVYDYLIAAGIKSERLVFRGFGENVPVAPNENSDGSDNPEGRAENRRVELNILKADDFMD
VKEVNEAGR
NT seq
1830 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgttgttttctcggctggtttccagtcttttcttgtccttggttttggcgcaaagc
gccacggcggaccctatctcagatttattagaggcgctgggtattcagtctttacttcgg
gatgctccgatagtggggactattggtgcctctgtgcttgatcctaatgggacgggtgat
aacgactttttgggtgccgatgcacttaatccagaaaatgatttaggcctaacgctgctt
tctggagagcttttaggcttcggtaataaaaccggatcggacaccgctcttcctttagat
tttctaggcctgggtgatttgctaggggctttagggcttacctatgaagccggttttgcc
ggccaacttcggggcttgcttgctcaagatggaatgattacttccgctttggtgggcacc
ttgggtgatgtttcttccttactcagtaccgaccttttgggtttggagggctttgctttg
cctaatggcggggtcggcttacccggtttaaatgaccagccgctgggtttggctattttg
ggagcggctaactcgggtaatgcttcttccgacggcctgttgggtttatcactgctgacg
ccgggttcttcaggtaacggcggtttaattggcgtgtctgttttgtcgggtgataactct
ggtaatggtagtgcgattggattggcgattttaagcggcagcaatagtggcaatggcgac
aacattggtgccagtgtattaggcggcgacaacgcaggtaatggtggcgatctaggggtt
ggcgttcttaacggtaataacagtggcaatggcggcacaattggtggcgtggctgtttta
aacggtgacaacagcggcaatggtgatctcgttggtgtcggtgtattgaatggcgctaac
agtggtaacggcgattcgattgctgctggggtacttaacggtgacaacagtggtaatggt
tctgttgctgcagctgtgcttaatggcaacaattctggcaactctgaaacaatttctctt
gctggcttgaatggcagcagctcaggcaattctgattttgccacggttgcggcaattaac
ggtgataattcgggtaactctggcactctttcggtggccgccataaatggtgccgattca
ggtaatagtgattttgcttcagtgggcgcactgaatggtagcaactccggtgccggtggc
gtgattacggttgcggcattaaacgaagctaatggtaatggcggtgatgatgcggcgaat
tcttgcgcgactaccggtggtgttggctgtgatgatcacgagcctttggcgacgatggaa
acgtgtaaagacggcgatggcgatggtatctgcgacgaagacgacgaatgcaaagatacc
ccggcaggtgcgccagtatttttaacgggctgtcatctcactgaggatgcgccactggta
ttgcgcggtgttaattttgaatttgataaagcggatctgacgccagaatctattcccatt
cttgagcatgcggtaaaagtattgaatgcccagccttcggccttggttgctgtggatgga
cacaccgatgctaaaggcagctttgaatacaatgacaaactctcgtaccgcagggcgggc
acggtctacgattacctgattgctgcgggtattaaaagtgagcgactggtgtttcgtggc
tttggtgaaaatgtgcctgtagcgcctaatgagaatagcgatggtagtgacaacccggaa
gggcgtgccgaaaaccgtcgggttgagcttaatattttgaaagctgatgattttatggat
gttaaggaagttaacgaggctggccgatag
DBGET
integrated database retrieval system
