Spongiibacter sp. IMCC21906: IMCC21906_03245
Help
Entry
IMCC21906_03245 CDS
T03945
Name
(GenBank) thrombospondin type 3 repeat-containing protein
Organism
spoi
Spongiibacter sp. IMCC21906
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TSP_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKH70882
UniProt:
A0A0F7MA23
LinkDB
All DBs
Position
complement(3458257..3461661)
Genome browser
AA seq
1134 aa
AA seq
DB search
MQLSKLIAALLMSSALSLQLVGCNSADNDSGGGTTPPPAATDTDNDGVVDSEDNCPNIVN
ADQADADNDDIGDACDFLDADDDGIADDIDNCPTDANTNQRDTDDDDVGDTCDTDDDGDG
VNDDVPDNCPLIANDNQLDADNDGIGDACDDSDSDGVFDLSDNCPSAANAAQTDSDNDGL
GDACDGDDDGDGADDDADNCPAVSNPLQTDTDNDGVGDACETDFDGDGVDDTADNCPLVA
NPGQEDTVDNDGVGDACDDSDVGAGDGIVDAVDNCPLVPNPDQRDTDSDGAGDACDTDDD
GDGVNDGEPDNCPLVANPNQTDSDGDGTGDACQEDRDGDGLTNGFDNCPTVPNANQNDSD
GDGIGDVCDDSDNDGVLDPFDNCPADVNASQSDIDMDGQGDACDQDKDGDGELNDADNCP
LVANPDQTNTDGEGQGDACQDDEDGDLFEDDFDNCPMTANPGQEDEFDGDGIGDACDDSD
NDGIFDGADNCPADANTDQTNTDAGFADGDAQGDACDVDDDADGILDTSDNCQFVPNFDQ
TNSGTNTELGDACEGDGDSDNVIDDVDNCPTVPNEAQTDYDQDGIGDVCDDDSDNDTVND
DVDNCPLPNPDQQDSDGDGVGDACDVAAIASNFQCSAGSPVGTTVTAVETGLVCTLTDLL
TDPLVEGCGVTSPDNAIDNDLDSFAIVNYNVGLLDALLGDGGLNLTGSQTLQVNFPEAVE
AGQVVGFIVTVPGGTVDLSLLRNFTVRTYLDDVQQEGAGVNENTSIALLGQGVVQSNSAQ
GGFVGQFPVDPDAFPDLESTTSEAKYLLGFISTSDYDRVDLVVDAQVLTVDLNEAIYVYE
ACTAAERVILDPNAPEDPSAIDPALLTELLGEGFLPEPLAEAIENGLDPEQLAELFPEQL
ADLLDLLGNDDPTAGLATLLELLGDNDPSGGLDTLLDALGEDPQQAITELLATLGGEEGP
LAGLSVLTDVLEGLGQDPEAAIAGLLESLGGEEGPLAGLDVLTDALEGLGEDPQNAITGL
LDALGGEEGPLAGLGVLSDALEGLGQDPQQVIADLLGDLGGGDPTAGLDVLTDALEGLGE
DPQDVITGLIETLGGGEGGLDALAGILNPEDPAAGLSFLTDLLPGLLDLLPIPG
NT seq
3405 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaacttagtaaacttatcgctgcgctattaatgtccagcgcgctcagcctgcagttg
gtggggtgtaattccgcggataatgatagcggtggtggcacaacaccaccgccagcggca
actgataccgataacgacggtgtagttgatagcgaagacaattgcccaaacattgtcaat
gcagaccaagctgatgcagataatgatgacattggtgatgcctgtgattttctggatgcc
gatgacgatggtattgcggacgacatcgataattgcccaaccgatgccaataccaatcag
cgtgatacggatgacgacgatgttggtgatacctgcgatacggacgatgacggcgatggt
gtcaatgatgatgtgcccgacaattgtccgttaatagccaatgacaatcagttggatgct
gataacgatggtattggtgatgcctgtgacgactccgattctgatggggttttcgacctg
agcgataactgccccagcgcggccaatgcagcccagaccgactctgacaatgatggttta
ggcgatgcctgtgatggtgatgacgacggtgacggtgcagatgatgatgcggataactgt
cctgcggtttctaacccgctgcaaactgacactgataatgatggtgtcggcgatgcttgt
gaaaccgattttgacggtgacggcgtagacgatactgcggataactgcccgctggtggcc
aaccccggtcaagaagacaccgtggataatgacggtgtcggcgatgcttgtgatgacagc
gacgtcggcgcaggtgacggcattgttgatgcggtagataactgccccttggtgccaaac
cccgatcagcgtgataccgatagcgatggcgcgggtgatgcctgcgataccgacgacgat
ggcgatggcgtcaacgacggtgaacctgataactgtcctttggttgccaaccctaaccaa
acagattcagacggcgatggtactggtgacgcttgtcaggaagaccgcgatggcgatggt
ttaaccaacggttttgataactgcccaaccgtgcctaatgccaaccagaatgatagtgat
ggggatggtattggcgatgtctgtgacgactcggataacgatggtgttttagatccattc
gataattgtcctgcagatgtcaatgcatctcaaagcgacattgatatggatgggcagggc
gatgcttgtgaccaagataaggacggtgacggcgaattaaatgatgccgataactgccca
ttggttgctaacccagaccaaaccaacactgatggtgaaggccaaggtgatgcttgtcag
gatgatgaagacggcgacctgtttgaggacgacttcgataactgtccgatgaccgctaac
cctggtcaagaagatgaatttgatggcgatggtattggcgacgcctgtgacgattcggat
aacgatggcatttttgacggagcggataactgccccgctgatgctaataccgaccaaact
aataccgatgccggttttgccgatggtgacgcacaaggtgatgcctgtgatgttgatgat
gatgcagatggcatcttggatacctcagacaactgccagtttgtgccgaattttgatcaa
actaattcaggaaccaatacagaactaggcgatgcctgtgaaggtgatggcgatagtgat
aacgttattgatgatgttgataactgtccaactgtccccaatgaagcccaaaccgattac
gaccaggacggtatcggtgatgtctgtgatgacgattcagataatgacaccgtcaatgac
gatgtagataactgcccgctgcctaatcctgatcaacaggatagtgatggcgacggtgtc
ggcgatgcctgtgatgtggcggcaattgcctccaacttccagtgttccgcaggctcacct
gttggcactaccgtgacagcagttgaaacgggtctggtttgtacactgactgacttgttg
actgaccctctggtggaaggttgtggcgttacatctcctgacaatgcgattgataatgac
ctcgactcgttcgccatcgttaactataacgttggtctgttggacgccttgctaggtgat
ggtggtcttaatctgacaggttcacagaccctacaggtcaacttccctgaagctgttgag
gctggtcaagtagtcggctttattgtcaccgtacccggcggcacagtggatttgagcctg
ttacgtaacttcaccgttagaacttacttggatgatgtgcagcaagagggtgcaggggtg
aatgaaaacacctctattgctctacttggtcaaggtgttgtgcagagcaactccgcacag
ggtggttttgtaggtcaattcccagttgacccagatgctttccctgacttggagtccacg
acctctgaggccaaatacctgctgggctttatcagcactagcgattatgaccgggttgat
ttggttgttgatgcgcaggtgctgaccgtagatctcaatgaagcaatctatgtttatgaa
gcttgtactgctgcagagcgggtaattcttgatcccaacgcgccagaagatccatctgct
attgaccctgcgttgttgaccgagctattaggtgagggcttcttgcctgagccgctagcg
gaagctattgaaaatggcttggatccagagcagttagcagaattgttcccagagcaactg
gctgatctgctggatctgcttggcaacgatgatccaactgctggcttggcaacattgttg
gagctgttgggtgacaatgatcctagcggcggtttagacaccttgttggatgctcttggt
gaagaccctcagcaggctattactgagctgttagcaacattgggtggtgaagagggccca
ttggcgggtctgagcgtgttaaccgatgtgcttgaaggtcttggtcaagatcctgaggcc
gctattgctggcttgcttgaatcgcttggtggtgaagaaggtcccttggctggcttggat
gtgctaactgatgcacttgaaggcctgggtgaagaccctcagaacgctattactgggctg
cttgatgcactgggtggtgaagaaggtcctttggctggtttgggtgtgttaagtgatgca
cttgaggggctagggcaagatccacaacaagtgattgctgacctacttggcgatcttggc
ggcggcgatccaaccgctggactggatgtgttgaccgatgctttggaaggtttgggtgaa
gatcctcaggacgtgataaccgggctcattgaaaccttgggcggtggtgaaggcggcctt
gatgccttggccggtattcttaaccccgaagatccagcagctggcttgagttttcttacc
gatcttttgccaggcttgttagatctgcttcctattcccggctaa
DBGET
integrated database retrieval system
