Shewanella polaris: FH971_00565
Help
Entry
FH971_00565 CDS
T06579
Name
(GenBank) aromatic hydrocarbon degradation protein
KO
K06076
long-chain fatty acid transport protein
Organism
spol
Shewanella polaris
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
spol00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
spol02000
]
FH971_00565
Transporters [BR:
spol02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
FH971_00565
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Toluene_X
DUF2490
OMP_b-brl
DUF6850
BBP2
Pom
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QDE29595
UniProt:
A0A4Y5YAA8
LinkDB
All DBs
Position
134248..135600
Genome browser
AA seq
450 aa
AA seq
DB search
MKKTVLTLAISAIVFGATTQVNAAGFQLSEYSATGLGRAFAGEAAMADNASAQARNPAML
SYLEGRQLSGGGIYVMPNVDVVGDVALSSSLLGSEPLVINADAYDVADNALVPNFYYSNQ
LNDQWTWGLAVNSNYGLATDVPVSDAAAIFGSKTSVTTVEFNPSVAYRIDETFTVGAGLR
IVYGEGELDATTPSWMDSIKSNANVPESISELLPDGGTSLKSMEGNDIGYGWKAGASWQV
NSANRIGLAYHSGVDLKLDGHVSGLLYTGDQDSEIDAYLPIELPAFAELASYHQLTENWA
MHASINWTEWSVFDKLEAHFTGDVKPVGDLESDVVKEENFKDNWRYAIGTTYLVNNQWTI
RAGMALDKTAVDDQDRTTTIPDTDRLWFSVGTGYQVSQNLNVDVGVTYIRTHGDAPINET
QDLLGIASVGFTGEATGDVWLAGVQLSYKM
NT seq
1353 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaacagtgttaacgttggcgattagcgccattgtttttggggcaacaactcaa
gtgaacgcagctggctttcagctttcagaatattcagccacaggcctaggtcgtgcattt
gctggtgaagccgcgatggctgacaatgcttctgctcaggctcgaaacccagccatgttg
tcatatttagaaggccgccaattgtctggtggtggtatctatgtgatgccaaatgtcgat
gttgttggtgatgttgccctttcttcatccttgttaggttcagagccattagttataaat
gctgatgcctatgatgtagcagacaatgcacttgtgcctaatttttactattctaatcaa
ttgaatgaccaatggacttggggtctagcggtgaattctaattatggtttagcgaccgat
gttccagtatcggatgcagccgctatttttggcagcaagacgtcggttaccactgtagag
ttcaatcctagtgttgcttaccgtattgatgagacatttaccgtaggtgctggtttacgt
attgtatatggtgaaggtgaactggatgcgactacgccgagttggatggattcaattaaa
tctaatgctaatgtacctgaaagcatcagtgaacttttacccgatggtggtacgagtttg
aagtcaatggaaggtaatgatattggctatggctggaaagcgggtgccagttggcaggtt
aattcggcgaaccgtattggtttggcttaccatagtggtgtcgaccttaaattagacggt
catgtttcagggctactttatactggtgatcaagatagcgagattgatgcatacttgcct
attgagttaccagcatttgctgagcttgcttcttatcatcagttaactgaaaattgggct
atgcatgccagtatcaattggacagaatggagcgtttttgacaaactagaggcgcatttc
actggtgacgtaaagcctgttggtgacttagagtctgatgtagtaaaagaagaaaacttt
aaagataactggcgttatgcaattggtacaacgtacttggtaaataaccaatggacaatt
cgtgctggcatggcgcttgataaaacggctgttgacgatcaagatcgcaccacgactatc
cccgacactgaccgtttatggtttagtgtgggtactggttaccaagtatcccaaaatttg
aatgttgatgtaggtgttacttatattcgcactcatggtgatgccccgattaacgagaca
caagatctattgggtatcgcatcagttgggtttactggtgaagcgacgggtgatgtttgg
ctcgctggtgtacagttaagctataaaatgtag
DBGET
integrated database retrieval system