Shewanella polaris: FH971_02965
Help
Entry
FH971_02965 CDS
T06579
Name
(GenBank) TonB-dependent siderophore receptor
KO
K16090
catecholate siderophore receptor
Organism
spol
Shewanella polaris
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
spol00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
spol02000
]
FH971_02965
Transporters [BR:
spol02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
FH971_02965
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QDE30025
UniProt:
A0A4Y5YBG2
LinkDB
All DBs
Position
694754..697075
Genome browser
AA seq
773 aa
AA seq
DB search
MKSNSYSKLSLGAQAVAAALVFSSPAIYAADTSNETCDKDILAKCKPVETDESIERIRVH
GVQNSVYMFNNSADKRRMAALVDTPQVITVLTQDQIQESGNTDLKDILSAQAGVTLGTGE
NGNAFGDRYIIRGHEARSDVFVDGLRDPGMTTRESFATERVEITKGPSSTFAGRGSSGGA
INSVTKKASVAYDFGRVDLGIGTDEHRRLTIDYNLPLSETVAVRLNGLTAEEDKPGREGI
TRERQGVQLSGVYEATDALSFIADGYYLDAKDVPDLGSYFDQDTRKPLEDIPVYAQDGDF
LNSKVTTFTLRTEYELNDSITLYNATRVGHTENGYITTGMGGTTRADTDATAPGVKTLTL
STHQGNQDVDYVSTQFNLFWNTEILGFSNKLVFGLEYTDENVDNGVYSVTNNNPTNCSTE
GRRGVSESYCIIDGNGDTVDNINQLMGRSYVDGGSDAIYDIETVSAYMMDTVALTEQLSL
FYGLRLDSFDYSNDTTSNSGEVDYAYSDTMYNYNFGLVYDLSEDANIYANYSTATNINGG
ESDLGGNCGYGGVCGTTEQASEADAEIVENLELGTKWMLFDDKMMFSASIFQITKSDVME
SVGDSYSTLGTLNTGKNRVRGIEFGMVGNITDQLSIQFSAAKMDSEILESYDPANIGLVL
SNFADESAYLQLRYQLTESFVFGGNYTYQSEMYGGQPDTAAGFDSTNNRYSIVVPNYQVV
DLFASYNATEDLTFRINVGNVMNEEYWTAAYRSGSFMYLGDARSSKLSMTYEF
NT seq
2322 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatctaatagttacagtaagttatcgttaggtgctcaggcagttgccgctgcatta
gtctttagtagcccagcaatttatgctgcagacaccagtaatgaaacttgcgataaggat
atcttagcaaaatgtaaacctgtggaaacagacgaatcaatagaaagaattcgggttcat
ggggtacaaaactcagtttatatgtttaataactcagccgataaacgccgtatggctgca
ttagttgatactccgcaagtgattaccgtattaacccaagatcaaattcaagagtctggt
aatactgacttaaaagatattttgtcagctcaagctggggtcactttaggtacgggtgaa
aacggtaatgcctttggtgaccgctatattatccgtggtcacgaagcgcgtagcgacgtg
tttgttgatggtttacgtgacccaggcatgaccactcgcgaaagttttgcaacagaacgt
gttgaaattaccaaaggcccaagttcaacatttgcaggccgtggttcatctggcggtgcg
attaacagcgtgaccaaaaaggcctctgttgcgtatgattttggccgtgtcgacttaggc
attggtactgacgaacatagacgattaactatcgattataacttaccgttatcagaaacc
gtcgctgtgcgtcttaacggtttaacggccgaagaagataagccaggccgcgaagggatt
acccgtgaacgtcagggtgttcagctatcgggagtgtatgaagccactgatgcactgtca
tttatcgccgatggttattatttagacgccaaagacgtgcctgatttaggcagttatttt
gatcaagacacccgtaagccacttgaagatatccctgtttatgctcaagatggtgacttt
ttaaattctaaggtcaccacgttcaccctacgtaccgaatatgagttaaatgacagcatc
acgttatataatgctactcgtgttggtcacactgaaaacggttatatcactaccggtatg
ggcggcaccacgcgcgcagataccgacgcaaccgcgcctggtgttaaaaccctaacatta
agtactcaccaaggtaatcaagatgttgattacgtcagtactcagttcaatttattttgg
aatactgaaatactgggctttagcaataagcttgtttttggtttggaatacacagacgaa
aacgttgataacggtgtgtatagcgttaccaacaataatccgacaaattgttcaaccgaa
ggacgtcgtggcgtctctgagtcatactgtattatcgacggcaatggcgatacggtagat
aacattaaccagttaatgggacgcagctatgttgatggcggatcggatgcgatttacgac
atcgaaacagtatcggcatacatgatggataccgttgcactaactgaacaactgtcatta
ttctacggcttgagacttgatagctttgactacagcaatgacacgacgagtaatagcggt
gaagtagattatgcctactcagacaccatgtataactacaacttcggtcttgtttatgac
ttgtctgaagacgctaacatttatgctaactacagcaccgcaactaacatcaatggcggc
gagtctgacttaggcggaaactgtggatatggcggtgtgtgtggtaccacagaacaagct
tcggaagccgatgccgaaatcgttgaaaacctagagcttggcaccaaatggatgttgttt
gacgacaaaatgatgttctcagcatcaattttccaaatcactaaaagcgatgtcatggaa
agtgttggcgacagttactcaaccttaggtacacttaatacgggtaaaaaccgtgttaga
ggtatcgaatttggtatggtgggaaatattaccgaccaactcagcatacaattttcagcg
gctaaaatggattctgagattttagaatcatacgatccagctaacattggtttagtcctg
agtaattttgccgacgagagtgcttacctacaattacgttatcagttaactgaatcgttt
gtgtttggtggtaattacacttatcaaagtgaaatgtatggcggacagccagacactgca
gcgggctttgatagtaccaataatcgctacagtatcgtggtgcctaactatcaagtagtt
gatttatttgctagttacaatgctaccgaagacttaactttccgcataaacgtaggcaat
gtaatgaatgaagagtactggaccgcagcttatcgttctggttcatttatgtacttaggt
gatgcaagaagctcaaaactgtcgatgacatatgagttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
