KEGG   Shewanella polaris: FH971_05385
Entry
FH971_05385       CDS       T06579                                 
Name
(GenBank) rRNA (guanine-N1)-methyltransferase
  KO
K02674  type IV pilus assembly protein PilY1
Organism
spol  Shewanella polaris
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:spol00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02044 Secretion system [BR:spol02044]
    FH971_05385
   02035 Bacterial motility proteins [BR:spol02035]
    FH971_05385
Secretion system [BR:spol02044]
 Type II secretion system
  Pilin secretion/fimbrial assembly protein
   FH971_05385
Bacterial motility proteins [BR:spol02035]
 Pilus system
  Pilus assembly proteins
   FH971_05385
SSDB
Motif
Pfam: T4P_PilY1 Tox-HNH-HHH
Other DBs
NCBI-ProteinID: QDE30455
UniProt: A0A4Y5YCM8
LinkDB
Position
1216558..1220106
AA seq 1182 aa
MFLKQLLSVLLFAILAHSSISFADDTELYVFESTARSGSKPQVLIIFDTSGSMSTSFSTD
DPYERGEENTNNGTLLGNTKLYFTRSSSNIPEASSNQYFLHSVNGCDVGEKYLEDYGMFT
GYLREHKYIGENGVWSELPLTDGSSIQQVDCYEDIADRNYYNNGTNFYGFPVDGLGSSAS
PVRYTTANSSSTTAEIDAAIEKAKLTNLGIGQPITLYTEKYINWYYSTKSQHRYSRMAIA
KRVIEDTIVTTPSVDFGLSIFNYNYRCCDGGRIVYGITTNNETNRTNLLNTIGDFNADGN
TPLCENLYEAYRYFAGLGVYFGDDDPSRTPSRDQSVEHNGSYISPFVDKQCQDKAYVIYV
TDGEPTQDTAADNAILNLSGVTTSDRHSSSYLPALAGWLNKNDVNTNLDGIQTVSTYTIG
FSEGADDAKDILTETATRGGGEYYSAKNAQKLQEALQDIFSNILEVNSSFTSPSIASNNF
DRTQTLNSVYYAMFLPNEGPRWVGNLKKFTVTGSGDVVDKNGDNAIGDDGNLKSSACSYW
TDDSVCSATSGGGDGNNVEIGGTLTKLQNTSNRTLYGNFGSDGSLKAFTKSNAASSPGIS
SEASLATFMGVDKTELTKLFDWAIGIDVDDEDEDNSTSDTRLDIMGDPLHSKPLAINYGT
EGSPDVRILLGTNAGFLHMFKDKGDSVEESWAFMPQELLPNLRELRANVPTGVHSVYGMD
SPPVAYVKRNTSGAIEKAWLFVGMRRGGKSYYALNITNPDLPSFMWKVDPSSSGMSEMGQ
SWAEPVVTLIPGVPSGNMSAASATPVVILGGGYNPSTKDGSGIGTDDTTGRSVYVLNAET
GALVHQFGTSTGTNKTTLPSIVDSIPNSVAILDGNNDGLTDRIYATDTGANIWRMDMPSA
SSNDSTNPWTAFKFASLGGATQATDRRFFAEPAVAQTVFTNISEVSVTVSETTTTSVTYQ
NVPYDAVTVGSGNRPHPLDTTRSDKFFVLQDRNVISKSFTGATGKEVPATLELSNLYNVS
STPPVTEEQNIEFGKQRGWFYNFSASGEKSVSASTIIEGRVYFTSYVPGDNTSTNQCLVS
GQGRLYGFDLHKGTRSYTQEYLEMGSRVPDTPQLVIPPNDEPSDPDDSTNQNDESYMYLI
GIGSAGDKMEKVDGDDDGCAEGDNKCIRAGLGVNRIYYHIDE
NT seq 3549 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtttttaaaacaattactgtcagtattattatttgcaatcttggctcattcatcgatt
agcttcgcagatgacacagaattatatgtatttgagtcgacagctcgatctggctctaag
ccccaggtgttaattattttcgatacatcgggcagtatgagtactagttttagtactgat
gatccttatgaaagaggggaggaaaataccaataatggtactttactaggtaatacaaag
ctttattttacccgtagtagtagcaatatccctgaggcaagcagtaaccaatacttctta
cacagtgtaaacggttgtgatgtcggcgagaaatatctcgaagattacggtatgtttact
ggttacctacgtgaacataaatatattggtgaaaatggtgtgtggtctgaattgccgtta
actgacggtagttcaatccaacaagttgattgttatgaagatattgcggatcgcaattat
tacaataatggcacaaacttttatggttttcctgttgatggtttaggctctagcgctagt
cctgttcgttatactactgcaaatagctcatcaacaacggctgaaattgatgctgctatt
gaaaaggccaagttaactaatttaggtattggccaacccataaccttgtacacagaaaaa
tatattaattggtattacagcacgaaatctcaacatcgttattctcgtatggcaattgct
aaacgagttattgaagatactattgtcaccactccgagtgttgattttggcttgagtata
tttaactataattatagatgttgtgatggtgggcgtatagtatacggtataactacaaat
aatgagactaacagaactaatttactcaataccattggtgactttaatgctgatggtaat
acacctttgtgtgaaaacttatatgaagcctatcgttactttgctggtttaggggtgtat
tttggtgatgatgatccaagtaggactccaagtcgagatcagtctgttgagcacaatgga
tcatacatatcaccttttgtcgataaacaatgccaagataaagcctacgttatttatgtt
acagatggagagccaacccaagatacggctgccgataatgcaatcttaaatctttctggt
gtgacaacatctgatcgacactcaagtagctatttacctgcccttgctggttggttaaac
aaaaatgacgtaaataccaaccttgatggtatccaaaccgtatcaacctacactattggt
tttagtgaaggagctgatgatgctaaagacatccttacagaaacagccactcgtggtggg
ggagagtattattcagccaaaaatgcacaaaaattacaagaagcgttacaagatattttt
tctaatatcctagaagttaactcaagctttacgtctccatctattgccagtaataacttt
gatagaacacaaacattaaactctgtttactatgcaatgtttttacctaatgaaggccct
cgctgggtcggaaaccttaaaaagtttactgttacaggttctggtgatgttgtagataaa
aatggtgataatgcaataggtgatgatggaaatttaaaatcatctgcatgttcatattgg
acagatgattcagtctgtagtgcaactagtggcggcggggacggtaataatgttgaaatc
ggtggtacgttaaccaagcttcaaaatacttctaataggacgctatacggcaactttggt
agtgatggttccttaaaagcatttactaaatcaaatgctgcaagtagtccaggtattagt
agtgaagcatcattagcaacctttatgggggttgataaaaccgaattaactaaattattt
gattgggccatcggtatcgatgttgacgacgaagatgaagataattcaacatctgataca
cgtttagatattatgggtgatccactgcattcaaaaccattagcgataaactatggtaca
gaaggctcaccagatgtgcgcatattgcttggcacgaatgctggttttttgcatatgttt
aaagataaaggggatagcgttgaagaatcttgggcatttatgccacaagagttattgcct
aatttacgtgagctaagagctaacgtgccaactggtgttcactcagtttatggtatggac
agccctccggttgcttatgttaaacgtaatacatcaggggctattgaaaaagcttggtta
ttcgttggtatgcgacgtggtggtaagtcctattatgccctcaatatcactaacccagat
ttaccatcatttatgtggaaggtcgatcctagttcatctggaatgagtgaaatggggcag
tcttgggctgagcctgtagttacgttaattccaggtgtaccttcaggcaatatgtcggcg
gcgagtgcgactccagtcgtcattcttggagggggctataatccttccactaaagatggt
tctggtattggtaccgatgacactactggtcgaagtgtttatgtgttaaatgctgaaaca
ggcgctttagtacatcaatttggaacatccactggaaccaacaaaaccacactacctagt
attgttgatagtatccctaatagtgttgcaattttagacggtaataacgatggtctaact
gacagaatatatgctactgataccggtgctaatatttggcgtatggatatgcctagtgct
tcgtctaatgattcaactaatccttggacagcatttaaatttgctagtttagggggagcg
acgcaagcaacagacagacgtttttttgctgaaccagccgttgcgcaaaccgtgtttact
aatatttccgaggtttctgtcacggtgtcagaaacaacaactacaagtgtcacttatcag
aacgttccttatgatgcggtaactgttggaagtggtaatcgtccgcatccattagataca
acgcgttcagataaattttttgtgctacaagaccgtaatgttattagtaagtcattcact
ggggctacgggtaaggaggtaccagcaacattagagttatcaaatctttataatgtatca
tctactcctccggttactgaagagcagaatattgaatttggtaaacaacggggttggttt
tataacttttccgcatcaggagagaaaagtgtatcggcttcaaccattattgaagggcga
gtttattttacctcttatgttccaggtgacaatacttcgactaatcaatgtttagtatct
ggtcaaggccgcttatatggatttgatttacataaaggtacccgctcttacacacaagag
tatttagaaatggggtctagagtccctgatacgcctcaattagttattccccctaatgat
gaacctagtgatcctgatgattccacaaaccaaaatgatgagagttacatgtacttaata
ggcattggttcagctggtgataaaatggaaaaagttgatggtgatgatgatggctgtgcg
gaaggtgacaataagtgcattcgtgcaggacttggtgttaacaggatttactatcatata
gatgagtaa

DBGET integrated database retrieval system