Shewanella polaris: FH971_07735
Help
Entry
FH971_07735 CDS
T06579
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
spol
Shewanella polaris
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
spol00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
spol02000
]
FH971_07735
Transporters [BR:
spol02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
FH971_07735
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QDE30869
UniProt:
A0A4Y5YE88
LinkDB
All DBs
Position
1767085..1769724
Genome browser
AA seq
879 aa
AA seq
DB search
MSSVTLTAKAIRRSLLAVATTSVVTTGLFASAAVSAEEQVQKVERIEVTGSRIKRADMET
ASPVSVIDASAILSSGATSIDDILQQMTSTGGAMTNAAVNNGSGGDTSINLRGLGSNRTL
VLVNGRRMIASGTGAASTVDLNTIPVSMIQRVEILKDGASAVYGTDAIAGVVNIILKRDF
DGLEMNVQTGMSGQGDADETSLDFTMGNTFDKGNVVINAQYTNRGDASQADRDFSDCPIS
ETGDAGSIELYCGGSSYSEGGHIWGETAELSGLGGEYHEYTNEDKYNYSKDSYLSTPMER
INLSLAGSYELSDSMTFFSEAMYSKRWSSQQMAPQPIWNSSTWTYEPESAGGFMTDDLLP
WIAAGEEVSYGRRMVESGTRNFSQVVDTVRIVIGLEGEFDNGWTWDASYNKGKNDSVDTL
ANLHNLGSIDDAVLEGTFDPFLQSSWEGDSIAPYIYTEVNSGGSELDIFAATLSGDIADL
PAGVLGFAAGVEHREESAHYTPDSLTAQGLANDPRVEATAGSFQVDEVYAELAIPLLSDL
PFAQQVDLSAAMRYFDYNTFGDDTTWKLGLTWRMTDDLMFRGGRSTAFRAPTVNELFGGA
SPSFDQIVHPASDQTQAEVTVGGNELLTPEEADITTLGLVYSPSFVEGLSLTLDYYKIDI
SNTITAVDSNYVANQCLDANGAKINTDTALCQASNIEIDATGRISFDNGLQNIGETNTAG
YDINIAYVFDAAGLSWKANLDTSILDKYEEFDQDGNVTDYRGYVTGNVGAYAKIKTNLDL
TASGDDWSATYEIRYIDGMDSLACKDDPSECYAPSVDSIVYHDLSGSYDLTETVRLSGGV
NNIFDKEPPYYTGNLDSNTDPYTYDVLGRYFFVRASVKF
NT seq
2640 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagttcagtaacattaaccgctaaggctattcgtcgtagtctattagctgtagcaaca
acaagtgtcgtgacaaccggcttattcgcttcagctgctgtttcagcagaagaacaagtt
cagaaagttgaaagaatagaagtaacaggttcacgtattaagcgtgcagatatggaaacc
gctagccctgtaagtgtaattgatgcttcagcaattctttcttctggcgcaacgtctatc
gatgatattttacagcaaatgacctctactggcggcgcgatgactaacgcagccgtaaac
aatggttctggtggtgatacatctatcaaccttcgtggtttaggtagtaaccgtacacta
gtattagtcaacggtcgccgtatgattgcatctggtacaggtgctgcatcaacagtagat
ttgaatacaattcctgtatcaatgatccaacgtgttgaaatattaaaagacggtgcttct
gctgtttatggtacagatgctatagctggtgtggttaacattattctaaaacgtgatttt
gacggtttagaaatgaatgttcaaacgggtatgagtggacaaggtgacgcagacgaaaca
agtcttgatttcactatgggtaacacgttcgacaaaggtaacgttgttattaatgcccag
tacacgaatcgtggtgatgcaagccaagcagaccgtgatttttctgactgtcctatatct
gaaacaggtgacgctggcagcatagaattatattgtggtggtagttcatacagtgaaggt
ggacatatttggggtgaaaccgctgaactaagtggtctcggtggtgaatatcacgagtat
actaatgaagataaatataactattccaaagacagttatttatctacaccaatggaacgt
attaacttaagtcttgctggttcatatgagttgtcagacagcatgacattcttctctgaa
gcaatgtactcaaagcgttggtcatcacaacaaatggcaccgcaacctatttggaatagt
tcaacttggacatatgaaccagaatcagctggtggatttatgactgatgatttacttcct
tggattgcagctggtgaggaagtgagttatggccgtcgtatggttgagtctggtacacgt
aactttagtcaagtagttgatactgttcgtattgtaattggtttagaaggtgagttcgac
aacggttggacttgggatgcttcatataacaaaggtaaaaacgattctgttgataccctt
gcaaatcttcacaacttaggttcaattgatgatgcagtattagagggcacttttgatcca
ttcctacagtcttcttgggaaggtgatagcattgctccttacatctacactgaagttaat
agtggtggtagtgaactagacatctttgctgcaacactttctggtgatattgctgattta
ccggctggtgtattaggttttgctgcgggtgttgagcaccgtgaagagtctgctcattac
actcctgattcattgacagcacaaggtcttgctaatgacccacgtgttgaagctacggct
ggtagttttcaagttgatgaagtatatgcagaattagctattccattattaagtgattta
ccatttgcacaacaagttgatttgagcgctgcaatgcgttatttcgattacaatacattt
ggtgatgatacaacatggaaattgggcttaacatggcgcatgactgatgacttaatgttc
cgtggtggtcgttctactgcattccgagcgccaacagttaatgaattattcggtggtgct
tctccatcgttcgatcaaattgttcatcctgcaagcgatcaaactcaagctgaagtgact
gttggtggtaatgaattgttaacacctgaagaagctgatattacaacacttggattggtt
tactctcctagttttgtagagggtttatcgttaacacttgattactataaaattgatatt
tctaacactattaccgcggttgattctaattatgtggctaatcaatgtttagatgcaaac
ggtgctaaaatcaacactgatactgcattgtgtcaagcctcaaatattgaaattgatgct
actggacgtatcagttttgataacggtttacaaaatattggtgaaactaatacagctggt
tatgatatcaacatagcgtatgtatttgatgctgcaggacttagctggaaagcaaactta
gatacttcaattttagataagtatgaagagtttgatcaagacggcaatgtaactgattat
cgtggctatgtaacgggtaatgttggtgcctatgctaaaatcaaaacaaaccttgaccta
acagccagtggtgatgattggagtgctacctacgaaattcgttatattgatggcatggat
tcattagcttgtaaggatgatccttcagagtgctatgctccttcagtagatagtatcgtg
tatcatgacctttcaggttcttatgatttaaccgaaactgttcgtctatctggtggtgtt
aacaatatctttgataaagaacctccttactacactggtaacttagattcaaataccgat
ccttatacttatgatgtattaggtcgttacttcttcgttcgtgcaagtgtgaagttctaa
DBGET
integrated database retrieval system