Shewanella polaris: FH971_08090
Help
Entry
FH971_08090 CDS
T06579
Name
(GenBank) MATE family efflux transporter
KO
K26937
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
spol
Shewanella polaris
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
spol00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
spol02000
]
FH971_08090
Transporters [BR:
spol02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
FH971_08090
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Polysacc_synt
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QDE30929
UniProt:
A0A4Y5YEF0
LinkDB
All DBs
Position
1844522..1846012
Genome browser
AA seq
496 aa
AA seq
DB search
MTAAKFVEGSILRHILVMSSTAAVGISALFVVDLLDIFFLSLLGEVELAAAAGYASTISF
FTTSIGIGLSIALGALVSKAVGSKNIKLAKRLFLNSAIVTLLTSVLVAAIVIAFIPELLA
LVGATGRTAELAQSYLYILVPSLPFICLAMALGGALRAVGDAKLSMMSTLAGGGVNAILD
PIFIFSLSMGIEGAAAASVLARIAVFIISARGVVIKHKLLGRFSFDEFKQDLGVIFAIAA
PAMLTNVATPIGNAVVTRAIADFGDSYVAGWAVLGRLIPVSFGMIFALSGAVGPIVGQNF
GANEIERVRLSLTKAIQFCVAYVLVVSLGLFLLRNVIISSFDMKGDAAELILFFCQYIAV
FFIFSGMLFIANASFNNLGKAKYSTLFNVGKATIGTIPFVYFGAQWGGVFGVLIGQVIGA
VIFGVIGILCAYRLVDKISRQDLFSASANQQLLEDDAINIDMVAAPSPMPGRTLMAQLDE
EPLCKQLSQQDNSEKN
NT seq
1491 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaccgccgctaaatttgttgagggctcaattttacgccatatattggtcatgagctct
actgctgcagtgggtatttcggcgctgtttgtcgttgatctactcgatattttcttctta
agtctgctcggcgaagttgaacttgccgccgccgcaggttatgccagcactatttcattt
tttaccacttcaattggcattggcttatctattgcactaggcgcattggtgtcaaaagcg
gtgggttcaaaaaatattaagctcgctaaacggttgtttttaaacagtgccatcgtgaca
ttattgaccagtgtgctggtggctgcaatcgtcatcgcgtttattcctgaactattagcg
ttggtgggtgctacgggacgcacagcggagttagcgcaaagttatttgtatattttagtg
ccgtcattaccgtttatttgtttagccatggcgcttggtggtgcattacgcgccgtgggt
gatgcaaaattgtcgatgatgtcgaccttagctggcggtggcgttaatgccatattagat
cctatcttcattttttctttatcaatgggtattgaaggtgcggctgctgcgtctgttttg
gcgcgtattgcggtgtttataatctcagcccgtggcgtagtgataaaacataaattattg
ggtcgattctcgtttgatgagtttaaacaagaccttggggttatttttgccattgctgca
cccgccatgctcaccaacgtggccactccgattggtaatgcggtggtaacccgtgccatt
gcagattttggcgatagctatgtagcgggctgggcggtattgggacgtttgatcccggta
tcgtttggaatgatatttgcgctatctggtgcggttgggccgattgtggggcaaaacttt
ggcgccaacgaaattgagcgtgttaggttaagtttaaccaaagcgattcaattttgtgtt
gcttatgtattggtagtgtcactgggactgtttttattacgtaatgtcattattagtagt
tttgacatgaaaggtgatgcggctgaacttatattatttttctgccagtatattgcagtg
ttctttattttttcgggaatgttgtttattgctaatgcctcgtttaataatttaggtaag
gccaagtactccactttatttaatgtaggtaaagccactattggcaccataccctttgtg
tattttggtgcgcaatggggtggtgtgtttggggtgttaattggtcaggttattggcgcg
gttatctttggagtgataggtattttatgtgcatatcgattagttgataaaatcagccgc
caagatttattttcggctagtgcaaatcaacaactgctagaggacgatgcgattaacatt
gatatggtggctgcgccgtcacccatgcctgggcgaacgctaatggcgcaattagacgaa
gaacccttgtgtaagcaattaagccaacaagataacagcgaaaaaaattag
DBGET
integrated database retrieval system
