Shewanella polaris: FH971_18845 Help Entry FH971_18845       CDS       T06579                                  Symbol csrD Name (GenBank) RNase E specificity factor CsrD   KO K18765   RNase E specificity factor CsrD Organism spol  Shewanella polaris Brite KEGG Orthology (KO) [BR:spol00001]  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    03019 Messenger RNA biogenesis [BR:spol03019]     FH971_18845 (csrD) Messenger RNA biogenesis [BR:spol03019]  Prokaryotic type   Bacterial mRNA degradation factors    Other RNA degradation factors     Others      FH971_18845 (csrD) BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  EAL GGDEF GAPES4 Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  QDE32843 UniProt:  A0A4Y5YK25 LinkDB All DBs Position complement(4320181..4322091) Genome browser AA seq 636 aa AA seqDB search MKHTKILTKKMTSFWLLSLAAVAFVFLLCAVMGFTQLTYNFQQQKVAELETMLVEDYQQH GSNQFSSWLPPLLTAYKAVDFSLSHEHQVVYQFHRDQIDTTKSNLTVYQTQLNPGQLSMK LVMPPPFSLYDLGWHELIILLIGFISIGIFVRFGYGWYSRELDGVEQLALRSKLILDGKL KQAAEVPTNGKPRMINRALSKLLADLDDAHKERGRLDQFIRKDTFLDKQTQIGNPIFFQN RLDALSHDQKMMAHGVLMFIEFDDVDLVENEFGEGGMKAMLSLTTEAITAALTQYEDSIF ARRSYSQLAIVVPQLSLIEADQLAQRILKTCLALPFYGIGDPDNFFHLGCAFFKTGDLQI QLVEEAEMALRAAQLQRVNNWFMYDKGALDEEIAKGSVRWRSFLENTLVSKRFFTLQQAI VDSDDQVLHYEIFSRARDIRGNDIRATLFIPMANKCGLMPQIERQILEQVLFRLMNDNTL TYSINLSLDSLISRAFVRWIQSTLLEHRPLASRLIFEVSEDIIVKNQKNTLLLKTLDMLR KMGAKLAVDNVGQYVVGSHYIQEYHFDLVKLHRSIVRRVHQRPENQLFIRSLIGGLYRAE VKVIAEGVECFEEWQTLKILGVSAAQGDFLGQRSEV NT seq 1911 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgaaacacaccaagatccttactaaaaaaatgaccagcttttggttgctttcattggcc gctgttgcctttgtgtttttgttgtgtgcggtgatgggttttactcaattaacctataat tttcagcaacaaaaagtcgctgaattagagaccatgttagtcgaggattaccaacaacat ggcagcaatcaattttcaagttggttacccccattattgacggcttataaagcggtcgat ttttccctgtctcatgaacaccaagtcgtttaccaatttcatcgcgatcaaatcgatacc actaagagcaacttgacggtatatcaaacccagttgaaccctggtcaattatccatgaag ttggttatgccaccgcctttttccttgtatgatttgggctggcatgagctgattattctt ttaatcggtttcattagtatcgggatttttgttcgctttggctatggttggtattccaga gaattagatggcgtagagcaacttgcactgcggagcaaacttattttagatggtaaatta aagcaagccgccgaagtgcctaccaatggtaaaccacgcatgatcaatcgtgcgctcagt aaattactcgccgatctggatgatgctcataaagaacgtggtcgcttagatcagtttatt cggaaagatacttttttagataaacaaactcaaattggtaatcctatattttttcaaaac cgtctagatgcgctaagccatgatcaaaaaatgatggctcatggtgtattgatgtttatt gagtttgatgatgttgatttagttgagaatgaattcggtgaaggtggcatgaaggcgatg ctatcactaacaaccgaagcaattactgcagcgttaactcaatatgaagacagtattttt gcccgacgtagctattctcaattagctattgtcgtcccacaattatcgctcatagaagcc gatcagttagcccaacgaatactaaaaacttgtctcgcattacctttttatggcatcggt gatcctgataattttttccacttaggctgtgcattttttaaaactggcgatttacaaatt caacttgttgaagaggctgaaatggcacttcgtgctgcacagctgcaacgggttaataac tggtttatgtatgataaaggtgcattagatgaagaaattgccaaaggttctgtccgttgg cgcagcttcctagaaaatacgctagtatcaaaacgtttttttaccttacaacaagcgatt gtcgacagtgatgatcaggtactacattatgaaatatttagtcgtgctagagatatacgc ggtaacgatatacgcgcaaccttgtttattccaatggctaacaaatgtggcttgatgcca cagattgaacggcaaatattggagcaagtgctcttcaggctaatgaatgataatacactt acttatagcatcaatttaagcctcgatagtttaatcagtagagcgtttgttcgttggata caatcaacattacttgagcatcgccctttagcttcgcggcttattttcgaggtgtcggaa gacatcattgttaaaaaccaaaagaataccttattgcttaaaaccttagatatgctcagg aaaatgggggcgaaattggctgttgataatgtcggtcagtatgttgtcgggagccattat attcaagaatatcattttgatttagtcaaactacaccgctctatcgtacgaagagtgcat caacgaccggagaatcaactatttattcgcagcttaattggtggtctttatagagcggaa gtaaaagtgattgcagaaggggttgaatgtttcgaggagtggcaaacgttaaaaattctc ggtgtgagtgctgcacagggcgatttcttagggcaaagatctgaagtttaa

DBGET integrated database retrieval system