Spiroplasma sp. NBRC 100390: S100390_v1c00040
Help
Entry
S100390_v1c00040 CDS
T05859
Symbol
gyrA
Name
(GenBank) DNA gyrase subunit A
KO
K02469
DNA gyrase subunit A [EC:
5.6.2.2
]
Organism
sprn
Spiroplasma sp. NBRC 100390
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sprn00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
sprn03032
]
S100390_v1c00040 (gyrA)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
sprn03400
]
S100390_v1c00040 (gyrA)
Enzymes [BR:
sprn01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.2 DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
S100390_v1c00040 (gyrA)
DNA replication proteins [BR:
sprn03032
]
Prokaryotic type
DNA Topoisomerases
S100390_v1c00040 (gyrA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
sprn03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
Facilitator
S100390_v1c00040 (gyrA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_topoisoIV
DNA_gyraseA_C
SIS
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
APE12817
UniProt:
A0A1J0TZ72
LinkDB
All DBs
Position
4811..7264
Genome browser
AA seq
817 aa
AA seq
DB search
MNPENDTYDYNGKIRDIDIADEMKSGFLDYAMSVIVSRAIPDVRDGLKPVHRRIIYAMWD
LNMTYDKQHKKSARIVGEVIGKYHPHGDTAVYEAMVRMAQDFSYRYPLIDGHGNFGSMDG
DAPAAMRYTEARMSKIAGELIKDIEKETTIFIDNYDGSEQEPTFLPGYFPNLLVNGASGI
AVGMATNIPPHNLNEVIDGVIALTKNMDITTVELMKVIKGPDFPTGALITAGNSLIKAYE
TGNGTITIRSKIDIEENNNKRRIIVSEIPYQVNKAKLLERIAELVRDKIINGISDLRDES
NMEGVRVVLELKRDAQENVILNKLYKLTPLQTNFSLNILALYKNQPKVMGLKQILKYFIE
HQIDIIVKRSQFELHKNQNRLVILEGLKIALDHIDEVITIIKKSQTTQIALESLIDQFKL
VTEQARAILEMRLQRLTGLEIEKINNETREIKLAIIALEEIINNNEKQIEIMINELIEIK
KKYGDERRSQIIKEELTEIDPEELIRREDILIMLTQDGYVKRVADDTFKLQNRGGKGITG
LANMEDSLKKIVSANSIDSLLIFSNFGKVYKLRAYQIETYSRHARGLPIINLIAIDKTEN
IQTILALDETISEQDNLFFVTKKGLIKKTKLSEFNQIRQTGKVAIELKEKDELVSVIITK
GTDDIIIGNNIGKVIRFNEKEIRAMSRQSVGVKGISNDKSGITIGVSSGRSVKYVLSVTE
NGYAKKTPIEDYRLTGRNTKGVKSINLTGKTGYLKFAQTVVGDEDLLVGTKNGNVIRVSL
EQIPLFGRTTSGVKIMRLDQDDKLEVIEILKKKDSSE
NT seq
2454 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaacccagagaacgatacatatgattataatggtaaaatccgtgatattgatattgct
gatgaaatgaaaagtggctttttagattatgcaatgtcagttattgtttcacgtgcaatt
cctgatgttcgtgatggattaaaacctgttcatcgtcgaattatttatgcaatgtgagac
ttaaatatgacatatgataaacaacataaaaaatcagcgcgaattgttggggaagtaatt
gggaaatatcatccccatggtgatactgctgtatatgaagcaatggtgcgaatggcacaa
gatttttcttatcgttatcctttaattgatggtcatggtaattttggatcaatggatggt
gatgcgccagcggcaatgcgatatactgaagcaagaatgagtaaaattgctggtgaatta
attaaggatattgaaaaagaaacaacaatttttattgataattatgatggtagtgaacaa
gaaccaacttttttaccaggttattttccaaatttactagttaatggtgcaagcggaatt
gctgttggaatggcaactaatattccaccgcataatttaaatgaagtaattgatggtgtt
attgctcttacaaaaaatatggatattacaacagttgaattaatgaaagttattaaggga
ccagactttccaacaggagctttaattactgctggaaatagtctaattaaagcttatgag
acagggaatgggacaattacaattcgttcaaaaattgatattgaagaaaataataataaa
cgtcgaattattgtttctgaaattccatatcaagtgaataaagcaaaattattagaacga
attgcagaattagtacgcgataaaattattaatggtatttctgatcttcgtgatgaatca
aatatggaaggggttcgtgttgttttggaattaaaacgtgacgcccaagaaaatgttatt
ttaaataaattatataaattaacgccattacaaactaatttttcgttaaatattttagct
ttgtataaaaatcagccaaaagtaatggggttaaagcaaattttaaaatattttattgaa
caccaaattgatattattgttaagcgtagtcagtttgaattgcataaaaatcagaatcgg
ttagtgattttagaaggattaaaaattgcccttgatcacattgacgaagtaattacaata
attaaaaaatcgcagacaacacaaattgctttagaatctttaattgatcagtttaagtta
gttactgaacaagcacgagcaattttagaaatgcgtttacaacgtttaacaggtttggaa
attgaaaaaattaataatgaaactagggaaattaaacttgcaattatagcattagaagaa
attattaataataatgaaaaacaaattgaaattatgattaatgagctaattgaaattaag
aaaaaatacggtgatgaacgtcgtagtcaaattattaaagaggaactaactgaaattgat
ccagaagaattaatccgtcgggaagatattttaattatgttaacccaagatggttatgtt
aaacgtgttgctgatgatacatttaaattacaaaatcgtggtggaaaagggattactggt
ttagcaaatatggaagatagtttgaaaaaaattgttagtgctaatagtattgattcttta
ttgattttttcaaattttgggaaggtttataaactgcgagcgtatcaaattgaaacttat
tcacgacatgcacgaggattaccaattattaatttaattgcaattgataaaactgaaaat
attcaaacaattctagctttagatgaaacaatttccgaacaagataacttattctttgta
acaaaaaaaggattgattaaaaaaacaaaattaagtgaatttaatcaaattcgccaaaca
gggaaagttgctattgaattaaaggaaaaagacgaattagtaagtgttattattacaaaa
ggaactgatgatattatcattggaaacaacattgggaaagtaattcgttttaatgaaaaa
gaaattagggccatgagtcgccaatctgttggagttaagggaatttctaacgataaatca
gggataacaattggggtaagttctggccgatccgtaaaatatgtgttatctgtaacagaa
aatggttatgcaaaaaaaacaccaattgaagattacaggttgacagggagaaatacaaaa
ggtgttaagtcaataaacttaacaggaaaaacaggatatttaaaatttgctcaaacagtt
gttggggatgaagatcttttggtaggaacaaagaatggaaatgttattcgtgtttcatta
gaacaaattccgttgtttggtcgaacaacatcgggtgttaaaattatgcgattagatcaa
gatgataaattagaagttattgaaattttaaaaaagaaagatagtagtgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
