KEGG   Spiroplasma sp. NBRC 100390: S100390_v1c00510
Entry
S100390_v1c00510  CDS       T05859                                 
Symbol
rpoC
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
  KO
K03046  DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:2.7.7.6]
Organism
sprn  Spiroplasma sp. NBRC 100390
Pathway
sprn03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:sprn00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    S100390_v1c00510 (rpoC)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:sprn03021]
    S100390_v1c00510 (rpoC)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:sprn03400]
    S100390_v1c00510 (rpoC)
Enzymes [BR:sprn01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     S100390_v1c00510 (rpoC)
Transcription machinery [BR:sprn03021]
 Prokaryotic type
  Bacterial type
   RNA polymerase
    Core subunits
     S100390_v1c00510 (rpoC)
DNA repair and recombination proteins [BR:sprn03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TCR (transcription coupled repair) factors
     DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
      S100390_v1c00510 (rpoC)
SSDB
Motif
Pfam: RNA_pol_Rpb1_1 RNA_pol_Rpb1_5 RNA_pol_Rpb1_2 RNA_pol_Rpb1_3 RNA_pol_Rpb1_4 Peptidase_M23 Gp44-like_2nd
Other DBs
NCBI-ProteinID: APE12864
UniProt: A0A1J0TZB1
LinkDB
Position
64625..68377
AA seq 1250 aa
MIENNEKNNRMIKIGLANPEDIRSWSYGEVKKPETINYKTLKPERDGLFDEKIFGPTKNF
ECACGKYKKSKNKGKICERCGVEITEAIVRRERMGHIELEEPVSHIWMLKAAPSRIALIL
DMKTKELEEVVYFVSYIVLDSGDAKSLKQKMVLDLGNAKTSAATRQRLTKTLREILDTLE
QGTIAYEAGETMIEDLKNTSLPFSMDECAQFINRHTNARFGIGAEAVEILLKNLNIDDEI
EKIKQDLKDKKTQLDQNKLMKRLEVLDSLKKSGSRPEWMILRAVPVIPPDIRPIIQLDGG
RFTTSEINDLYRRIIIRNERLKKVKAMGAPSVIVNNEKRMLQEAVDALLDNERKARPVTG
KDKRPLKSLTSILKGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIAIGPDLKMYQCGLPRDMAITLFK
PFVISKLVKDGLAANIKVAEKLILNQDDKVWEVLEEVIKSRPVLLNRAPTLHRLGIQAFE
PKLVKGKAIRLHPLVTTAFNADFDGDQMAVHVPITDEAVAEARSLMLGSRNILGPKDGKP
IVTPTQDMVLGNYYLTYEEKGQLGEGTIFKDLNEAVIAYETGAVALHALVAIPASGFVNK
KFKSEEMNDYIITTPGKIIFNQIFKEEFPYLNEPNVENLSALPARSLIKDNVNLIEYLEK
WEVNPPFKKKDLSNIIDRYFKIYGANKTAEMLDNMKNLGFKYSGKSGVTVSAGDVKVYDK
KQEEFKEADNKVKEINEYFKMGMLTSREKQHRIINVWSKVKDNIQTELEHVLREDPKNPI
FMMADSGARGNVSNFTQLVGMRGLMNNPKGDIIELPIKSSFREGLTVSEFFISTHGARKG
MADVALKTADSGYLTRRLVDVSQEIIITIKDCNARRGFVVSDIIEQKHSNIIVPLFDRLV
GRYNLKDIKLKNGKVIPANTLLSEEDSAAIVASDIKEVIIRSVLTCEAEKGICQRCYGKN
LATGMEVEIGEAVGTIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVAGGADITQGLPRIKELLDVTTP
KGSIAVISEIDGVISDIRDESGIHTIYVASDSDERKYKTQYNAVLRVKIGDKVVRGQKLT
EGSINIKELLEVAKIEDVHNYILKEVQRVYRLQGIEISDKYIEIIVKQMLNKVKIIDAGD
TELLPGEIVTIKRYRNETIKAVRSMKKPPTAKHVIFGIKKAPLESESFLSSASFQDTTRV
LVKAIIKGKVDRLEGLKENIMLGHLIPAGTGLKNPKDIITAGIAAKAEEY
NT seq 3753 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgattgaaaataatgaaaaaaataatcgtatgattaagatcggtttagcgaaccccgaa
gatattcgcagttgatcatatggagaagtaaaaaaaccagaaacaattaattataaaact
ttaaaaccagaacgagatggtttatttgatgaaaagatttttgggccaactaaaaatttt
gaatgtgcttgtggaaagtataaaaaatcaaaaaataaaggaaaaatttgtgaacgttgt
ggggttgaaatcactgaagcaattgttcgccgtgaacgaatgggacacattgaattagaa
gaaccagttagtcatatttgaatgttaaaagcagcgccaagtcgaattgcgttaatttta
gatatgaaaacaaaagaactagaagaagttgtttattttgtgtcgtatatcgttttagat
tctggtgatgctaaatcattaaaacaaaaaatggttttagatttaggaaatgctaaaact
tcggcggcaactcgtcaacgtttaacaaaaaccttacgagaaattttagatacattagaa
caaggcactattgcttatgaagctggtgaaacaatgattgaagatttaaaaaatacttca
ttacctttttcaatggatgaatgtgcccagtttattaatcgtcatactaatgctcgattt
ggaattggagctgaagcagttgaaatattattaaaaaatttaaatattgatgatgagatt
gaaaaaattaaacaagatttaaaggataaaaaaacgcaattagatcaaaataaattaatg
aaacgtttagaagtgttagactcattaaaaaaatcaggttcacgcccagaatgaatgatt
ttacgagcagttccagttattccaccagatattcgtccaattattcaattagatggtggt
cgttttactacttcagaaattaatgatttatatcgtcgtattattattcgaaatgaacga
ttaaaaaaagttaaagcaatgggggctccaagtgttattgttaataatgaaaaaaggatg
ttacaagaagctgttgatgcattattagataatgaacgaaaagcacgtccagtaaccgga
aaagacaaacgaccattaaaatcattaacaagtattttaaaaggaaaacaaggtcgtttc
cgtcaaaacttattaggaaaaagagttgattattcagggcgttcagttattgcgattggt
cccgatttaaaaatgtatcaatgtgggttacctcgtgatatggcaattacattgtttaag
ccatttgttattagtaaattagtaaaagatggtttagcagcaaatattaaagttgcggaa
aaattaattttaaaccaagatgacaaagtatgagaagttttagaagaagtaattaaatca
cgaccagtgttattaaaccgtgccccaacattgcaccgtttaggaattcaggcttttgaa
ccaaaattagttaaaggaaaagcaatccgtttgcaccccttagtaacaacagcttttaat
gctgactttgatggtgaccaaatggcggttcatgtgccaattacagatgaagcagttgct
gaagcacgtagtttaatgttaggaagtcgtaatattttaggaccaaaagatgggaaacca
attgtaacgccaacccaagatatggtgttaggaaattattacttaacatacgaggaaaaa
ggacagttgggggaaggaacaatttttaaagatttaaacgaagcagttattgcttatgaa
actggagctgtagctttacatgccttagttgcaattcctgctagtggttttgttaataaa
aaatttaaatctgaggaaatgaatgattacatcattacaacaccaggaaaaattattttt
aaccaaatttttaaagaagagttcccatatttaaatgaaccaaatgttgaaaacttatca
gcattaccagcccgttcattgattaaagataatgttaatttaattgaatatttagaaaaa
tgggaagtaaatccaccatttaagaaaaaagatttatcaaatattattgatcgttatttt
aaaatttatggtgctaacaaaactgctgaaatgttagataatatgaaaaatctagggttt
aaatactcaggaaaatcaggagtaactgtttcagcgggcgatgttaaggtttatgataaa
aaacaagaagagtttaaagaagcagataataaggttaaagaaattaatgaatactttaaa
atgggaatgttaacaagtcgtgaaaaacaacaccgaattattaatgtgtgatcaaaagta
aaagataatattcaaacagaattagagcatgttttacgagaagaccctaagaatccaatc
tttatgatggctgattcaggagcacgggggaatgtttcaaactttacacagttagttgga
atgcggggcttaatgaataaccctaaaggagatattattgaattaccaattaagtcttcg
ttccgagaaggattaaccgtatcagagttctttatttcaacccatggggcgcgaaaagga
atggctgatgtggcgttgaaaaccgccgattcaggttatttaacaagacgtttggttgat
gtttcacaagaaattattattacaataaaagattgtaatgctcgtcgtggttttgttgtt
tctgatattattgaacaaaagcactcaaatattattgtgccattatttgatcgcctagtc
ggacgttataatttaaaagacattaaattaaaaaatggtaaagtaattccagctaataca
ttgttatcagaagaagatagtgcagcgattgttgctagtgatattaaagaagtaattatt
cgttctgttttaacttgtgaagctgaaaaaggaatttgccaacgttgttatgggaaaaac
cttgcaacaggaatggaagttgaaattggtgaagcagttggaacaattgccgcacaatca
attggagaaccagggacacagttaacaatgcgtactttccatactggaggggttgccggg
ggagctgatattactcaagggttaccacggattaaagaattattagatgttacaacacca
aaaggatcaattgctgttatttcagaaattgatggtgttattagtgacattcgtgatgaa
agtggaatccataccatttatgttgcgtcagatagtgatgaacgaaaatataaaacacaa
tataatgctgttttaagagttaaaattggtgataaagttgtccgtggtcaaaaattaacg
gaaggttcaattaacattaaagaattattagaagttgctaaaattgaagatgttcacaat
tatattttaaaagaagtgcaacgtgtttatcgtttacaaggaattgaaatttcagacaaa
tatattgaaattattgttaaacaaatgttgaataaagttaaaattattgatgcgggagat
actgaattattaccaggtgagattgtgacaattaaacgttatcgtaatgaaacaattaaa
gctgtccgctcaatgaaaaaaccaccaacagctaaacatgttatttttggaattaaaaaa
gcaccattagaatcagagtcattcttatcgtcagcttcattccaggatacaacgcgggta
ttagttaaagcgattatcaaaggaaaagttgatcgtttagaaggcttaaaagaaaatatt
atgttaggacatttaattccagctggaacaggattaaaaaatcccaaagatattattacc
gccggaattgctgctaaagctgaagaatattag

DBGET integrated database retrieval system