Spiroplasma sp. NBRC 100390: S100390_v1c02650
Help
Entry
S100390_v1c02650 CDS
T05859
Symbol
smc
Name
(GenBank) chromosome condensation and segregation SMC ATPase
KO
K03529
chromosome segregation protein
Organism
sprn
Spiroplasma sp. NBRC 100390
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sprn00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
sprn03036
]
S100390_v1c02650 (smc)
Chromosome and associated proteins [BR:
sprn03036
]
Prokaryotic type
Chromosome partitioning proteins
Condensin-like complex
S100390_v1c02650 (smc)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SMC_N
SMC_hinge
AAA_23
AAA_15
AAA_21
AAA_29
PRK
SbcC_Walker_B
ABC_tran
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
APE13078
LinkDB
All DBs
Position
277451..280405
Genome browser
AA seq
984 aa
AA seq
DB search
MLFLKKLEAFGFKSFADPLTVNFDHEMIGIVGPNGSGKSNINDAIRWCLGEQSIKSLRGN
NSEDVIFNGSETKSALNMAEVKLTFDNTKRIFAMDYDEIEIIRRVFRGTGENEYFINKQR
VRLKDIQDFAMDSGLTKSSLAIISQGNINGFAEAKPLERRALFEEAAGVAKYKRRKLESL
KKLERSNENLARLKDILNEIERKLPSLKRQSEKALKYTALKDKLNEIELAVLVKDITFFN
DKLLELREQQKTITSTRQEADRELKNNEIEYNELNKENFNLDTKISVLSKEFQSLVSEIS
DLKVHKIELDNKEVALKMSNNDITITNMLSDYNELTFNLQNEQEKLEILEKQQLEYRTKR
NDFNAAQAKLNEDLGSINKTIVRLESDLERAQHKFENQDNLHEGVKNIINNKNVLPGIIG
LVQEVINVDDKYEQAIVTALTGRLQDILVKNVDSAKRAILYLKQNRAGRATFIPLDVISP
RYLSGDEEFVIKSVPGYLGLGNNLVKTSKEYRIAIDYLLSRYIICNDFDSAQEVGKLTKY
RYNIVTLDGEVIRPQGAVSGGSRRAKMTIVNPEKELNEINGKLALKGDEQQGIIQQLSTI
RHQLDEVNEIIAESQASIGAAKRQIEIIKHDQMKLQSEYHLLTAKNIDETKLEENQEILN
IVDKIQQKELLKTKLEQQLNVARSLKDKQSFNINELNNYISEKRYYVSALQEQISKINTD
LSIINVKIQQNLTHLTEEYQMTYDHAKTLELKVIDNEDLIRDEIKQLRSDLTQIGSVNLE
AIDEYKEEYERFQFMNNEYNDLYASVKNLLKSIDEMDAIMEEQFDKTIKEVNKNLPSTFE
VLFGGGSAKIIYTEPENLLETGVDIKVSPPGKNITNLNLLSGGEKSLVALSVLFAILKVR
PIPLVILDEAEAPLDPANVERFAKYIRTFVETTQFIVVTHRVGTMENCDVLYGATMQQKG
VTKIVGIKLQQAEEMIKDFENKKA
NT seq
2955 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgttatttttgaaaaaactggaggcttttggatttaagtcatttgctgacccattaact
gttaattttgatcatgaaatgattggaattgttggtcctaatgggagtggaaaatcaaat
attaatgatgcaattcgttgatgtttaggtgaacaatcaattaaatcacttcgcggaaat
aatagtgaagatgttatctttaatggttctgagacaaaatcagctttaaatatggcagaa
gtgaaattaacttttgataatacaaaacggatttttgcaatggattatgatgaaattgaa
attattcgtcgtgtttttcgagggacaggagaaaatgaatattttattaacaaacaacgt
gtgcgcttaaaagatattcaagattttgcgatggatagtggtttaacaaaatcatcatta
gctatcatttcgcaaggaaatattaatggttttgcagaagcaaaaccattagagcggcgt
gctttgtttgaagaagcggcaggagttgcaaaatataaacgacgcaaattagagtcatta
aaaaaattagaacgttcaaatgaaaatttggctcgtttaaaagatattttaaatgaaatt
gaacgaaagttgccaagtttgaaacgacaaagcgaaaaagctttaaaatatactgcttta
aaagacaaattgaatgaaattgaattagcagttttagttaaagatattactttttttaat
gataaattacttgaattacgtgaacaacaaaaaacaatcacaagtaccagacaagaagct
gatcgtgaattaaaaaataacgaaattgaatataatgaattaaataaagaaaattttaac
ttagatacaaaaattagtgtcttaagtaaagaatttcagagtttggtttcagaaattagt
gacttaaaagtacataaaattgaattagataataaagaagttgctttaaaaatgtcaaat
aacgatattacaattactaatatgcttagtgattataatgaattaacttttaatctacaa
aatgaacaagaaaaattagagattttggaaaaacaacaacttgaatatcgcactaagcga
aatgattttaatgcagcccaagctaaattaaatgaagatttaggatcaattaataaaaca
attgtgcgtttagagagcgatttagaacgagcacaacataaatttgaaaatcaagataat
ttacatgaaggggttaaaaatattattaataataaaaatgttttgccaggtattattgga
ttagtacaagaagtaattaatgttgatgacaaatatgaacaagcaattgtaacagcttta
acgggacggttgcaagacattttagttaaaaatgttgatagtgcgaaacgagcaatttta
tatttaaaacaaaatcgtgctggacgagcaacttttatcccattggatgttatttcacca
cgttatcttagcggtgatgaagaatttgtgattaagtcagtaccgggatatttgggactt
ggaaataatttagttaaaactagcaaggaatatcgtattgcgattgattatttattaagt
cgttatattatttgcaatgattttgatagtgctcaagaagttggaaaattaacaaaatat
cgttacaatattgttactttagatggcgaagtaattcgcccccaaggtgctgtttcgggt
gggtcgcgccgtgccaaaatgacaatcgtgaatccggaaaaagaacttaatgagattaac
gggaaattagcacttaaaggtgatgaacaacaaggaatcatccaacaattaagtacaatt
cgtcatcaattggatgaagttaatgaaattattgctgaaagccaagcttcaattggggca
gcaaaacggcaaattgaaattattaaacatgatcagatgaaattacaaagtgaatatcat
ttgttgacagcaaaaaatattgatgaaacaaaattagaagaaaatcaagaaattttgaat
attgttgataaaattcaacaaaaagaacttttaaaaacaaaattagaacaacaattaaat
gttgcacgtagtttaaaagataaacaatcatttaacattaatgaattgaataattatatt
tcagaaaaacgttattatgtttccgcgttacaagaacaaattagtaaaattaatactgat
ttatcaattattaatgttaaaattcaacaaaatttaacacacttaacagaagaatatcag
atgacatatgatcatgccaaaacattggaattaaaagtaattgataacgaagacttaatt
cgggacgaaattaaacaattacgaagtgatttaactcaaattggtagtgttaatttagaa
gcaattgatgaatataaggaagaatatgaacgttttcagtttatgaataatgagtataat
gatttatatgcttctgttaaaaatttattaaagtcaattgatgaaatggatgctattatg
gaagaacaatttgacaaaacaattaaagaagttaataagaatttaccatcaacctttgaa
gttttatttggtggtgggtcggcaaaaattatttatactgaaccagaaaatttattagag
actggtgttgatattaaagtatcaccacccgggaaaaatattactaatttaaatttatta
tctggtggtgaaaaatcattagttgcattgtcagttttatttgcgattttaaaagtccgt
ccaattccattagttattttagatgaagcagaagcaccattggatccagcaaatgttgaa
cgttttgctaaatatattcgtacgtttgttgaaacaacacagtttattgttgttactcat
cgagttggaacaatggaaaattgtgatgtgttatatggtgcaacaatgcaacaaaaaggg
gtaactaagattgtaggaattaaattgcaacaagcagaggaaatgattaaagattttgaa
aataaaaaagcataa
DBGET
integrated database retrieval system
