Spiroplasma sp. NBRC 100390: S100390_v1c04120
Help
Entry
S100390_v1c04120 CDS
T05859
Symbol
rarA
Name
(GenBank) recombination factor protein RarA
KO
K07478
putative ATPase
Organism
sprn
Spiroplasma sp. NBRC 100390
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sprn00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09192 Unclassified: genetic information processing
99976 Replication and repair
S100390_v1c04120 (rarA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MgsA_C
AAA_assoc_2
AAA
RuvB_N
AAA_5
DUF815
nSTAND3
AAA_16
DNA_pol3_delta2
AAA_18
AAA_22
Sigma54_activat
Sigma54_activ_2
RsgA_GTPase
NPHP3_N
RNA_helicase
AAA_2
AAA_14
CbiA
SKI
MMR_HSR1
TIP49
VapE-like_dom
AAA_7
RCF1-5-like_lid
NB-ARC
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
APE13225
LinkDB
All DBs
Position
453055..454299
Genome browser
AA seq
414 aa
AA seq
DB search
MQQPLAFLLRPTAITDIIGQSHIINDQNGLISRMLKYNYASSLIFYGDPGVGKSSIARAL
ANDLQLEYAVFNAEIDKKQDLENIIKKAQNVDRFIIIVEEVHRMNKDRQDILLQYLENGH
LIMFACTTENPYFVINPALRSRANIIKLERITTDEMLIGLKKLIATKKLALTITTEALEL
ICQLASGDLRIAINILELCLNLYPKEEITTAIITSIAPTANLINFADGDEHHDLKSALQK
AIRGSDVDAALYYFARLLASGDHEALLRRMLIIAYEDIGLANPSIAIHVKAAVDSFRQIG
LPEGRIPLGLAIVEMCLSEKSNSAYLATDQAYDDVLNGKIYPIPHNLRDTSYASAVKLGN
GVGYQYPHDFPNDYVVQQYLPKEMLGTVYYHPKLHSVYEKRINELYHRFRNKTK
NT seq
1245 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaacaaccgttagcgtttttgttacgcccaacagcaattactgatattattggacaa
agtcatattattaatgatcaaaatggtcttatttctcgaatgttaaaatataactatgct
agttcattaattttttatggtgatcctggtgttgggaaaagtagtattgcgcgtgctttg
gcaaatgatttgcaattagaatatgctgtttttaatgctgaaattgataagaaacaagat
ttagaaaacataattaaaaaagctcaaaatgttgatcgttttattattattgttgaagaa
gttcaccgaatgaataaagatcgccaagatattttgttacaatatttagaaaatgggcac
ttaattatgtttgcttgtacgactgagaatccctattttgtcattaatccagcgttacga
tcacgggcaaatattattaaattagagcggattactactgatgaaatgttaatcgggtta
aaaaagttaattgccacaaaaaaattagcattaacaattaccactgaagcattggaatta
atttgccaattagctagtggtgatttacggattgcaattaatatcttagaattatgttta
aacttataccccaaagaagaaattaccaccgcaattattacaagtattgcaccaacagca
aatttaattaattttgccgatggtgatgaacaccatgatttaaaatcagcgttacagaaa
gcaattcgtggcagtgatgttgatgcggcattgtattattttgctcgcttattggcaagt
ggggatcatgaagctttgttacgacgaatgctaattattgcgtatgaagatattggctta
gctaatccctcgattgcaattcatgtgaaagctgctgttgatagctttcgtcaaattggg
ttacccgaaggacgaattccattaggattagcaattgttgaaatgtgtttaagtgaaaaa
tcaaatagtgcttatttagcaacggaccaagcttatgacgatgttttaaatggtaaaatt
tatccaattccgcataatttacgtgatacaagctacgcttcagcagtaaaattaggaaat
ggggttggttatcaatatccccatgattttccaaatgattatgttgttcagcagtactta
ccaaaagaaatgctcggaactgtttattatcatcccaaattacatagtgtgtatgagaaa
cgaatcaatgagttatatcatcgttttaggaataaaaccaagtag
DBGET
integrated database retrieval system
