Spiroplasma sp. NBRC 100390: S100390_v1c04640
Help
Entry
S100390_v1c04640 CDS
T05859
Symbol
oppA
Name
(GenBank) oligopeptide ABC transporter substrate-binding protein
KO
K15580
oligopeptide transport system substrate-binding protein
Organism
sprn
Spiroplasma sp. NBRC 100390
Pathway
sprn02010
ABC transporters
sprn02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sprn00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
S100390_v1c04640 (oppA)
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
S100390_v1c04640 (oppA)
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
S100390_v1c04640 (oppA)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sprn02000
]
S100390_v1c04640 (oppA)
Transporters [BR:
sprn02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
Peptide and nickel transporters
Oligopeptide transporter
S100390_v1c04640 (oppA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SBP_bac_5
ACP_syn_III
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
APE13277
LinkDB
All DBs
Position
524486..526660
Genome browser
AA seq
724 aa
AA seq
DB search
MLKKKLALFASLTAITTVTPLVVSCGISLDRLANRLNYDNVFRSMFKYPLTSWSSGTTMQ
VEDNKILADLVGTLVATDKYNRSFGDIAVQTDKSSKYVGQPNANASEWKYQISSAAKWFD
YRGNFQRNIKASDMINTAKFVLFPKNLSATAGIWRTFIAGAQEIWDYFQAGKYQPDYYND
PIWSKLGMSVNAADDEITIKLAKPAEYFDTLMTYLAFAPMPEKAVLQGYNYGTNFKNIWY
SGAYLVEKYSSTSQILLRKNSEYRHANLTYIDKLNYTYLANNDVSRERVLFESGDVNDFI
VQPTDTNGWGKYVGPNPANPIFSGASSIINPDPTTYTIMFNYANANILSNNSSLVQQALN
ASKALQYDKIRKYLATHLDRSKFVKYYSEALDDSPTSKFLRNVYTARYFVKNGNVDYATY
VEEEYANKYLNGDKQASSQLLKDGSDALYLNQDLLKNDQNILDEIRTWLQKNTGSSSVAI
KILMNGASTLTTNRFLLNMIDSFNAENNVIKIIPDITVDATEYNSRTKKADWDMLIGGWS
PDYADPYTYLHTFSLGGDLQYYSGTSRIFSDLKLVNNQVPDFADIKNKLNNPYWNQLKKT
TAIESFYNVFKNYTNEVTDADHITDPKLLTDRYKGFAKAEFNSIYTDFIFIPAYVPNGSY
QIRISYVTPRTQITVGYGSSKYKHWGMELNWYLLTARERQIIEARYQQQLAIIQTDYAAF
REDY
NT seq
2175 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaaaaaagaaattagcgctttttgcaagtttaacagcaattacaactgtaactccc
ttggtagtatcatgtggaattagtttggatcggttagctaatcgtttaaattatgataat
gtttttcgttcgatgtttaaatatcctttaacatcatgatcaagtgggacaacaatgcaa
gtagaagataacaaaattttagcagatttagttggaaccttagtcgcaacagataaatat
aatcgtagttttggggacattgctgttcaaacagataaatcatcaaaatatgttggtcaa
ccaaatgctaatgcgagtgaatgaaaatatcaaatttcttctgcagcaaaatggtttgat
tatcgcggtaattttcaacgcaatattaaagcaagcgatatgattaataccgctaagttt
gttttatttccaaaaaacttatccgcaacagctgggatttgacgaacttttatcgcggga
gcacaagaaatttgagattattttcaagctggtaaatatcaacctgattattataatgac
ccaatttgaagtaaattagggatgagtgttaatgcggcagatgatgaaattacaattaaa
ttagcaaaaccagcagagtattttgatactttgatgacttatttagcatttgcgccaatg
ccagaaaaagcagtattacaaggttataattatggaacaaactttaaaaatatttgatat
tcgggagcatatttagttgaaaaatatagttcaacttcgcaaattttattacgaaaaaac
tctgaataccgccatgcaaatttaacttatattgataagttaaattatacatatttagca
aacaatgatgtttcgcgtgaacgagtgttatttgaatcaggtgatgttaatgattttatt
gttcaaccaactgatacgaatgggtgagggaaatatgttggtccaaatccagctaatcca
atctttagtggtgcttcaagtattattaatccggacccaacaacttataccataatgttt
aattatgctaatgctaatattttaagtaataacagtagtttggtgcaacaagccttaaat
gctagtaaagcactacaatatgataaaattcgaaaatacttagcaactcatttagaccgt
agtaagtttgtaaaatattattcagaagccttagatgattcaccaacatcaaaattttta
cgaaatgtttatactgcccgttattttgttaagaatggtaatgttgattatgctacctat
gttgaagaagaatatgctaataagtatttaaatggtgataagcaagcaagcagccagtta
ttaaaagatggtagtgatgccttgtatcttaaccaggatttgttaaaaaatgatcagaac
attttagatgaaattcgaacttggttacaaaaaaacactggttcatcaagtgtggcaatt
aaaattttaatgaacggagcatcaactttaacaactaatcgttttttattaaatatgatt
gattcgtttaatgcggaaaataatgtcattaaaattattcctgatattaccgttgatgca
acagaatataatagtcgaacaaaaaaagcagattgagatatgcttattggaggttggtca
ccagattatgctgatccatatacctacttacatacattttctctggggggggatttacaa
tattattcaggaacatcacgaatctttagcgatttaaaattagtaaataatcaagtccct
gattttgctgatattaaaaataaattaaataatccatattgaaatcagttaaaaaaaacc
acagcaattgaaagtttttataatgtttttaaaaattatacaaatgaagttacagatgct
gatcatattactgatccaaaattgctaactgatcgttataaaggttttgccaaagcagag
tttaattcaatttataccgattttatctttattccagcttatgttcccaatggttcatat
caaattcgaatttcatatgttacccctcgcacacaaattactgttggatatggaagttca
aaatataaacactgaggaatggaattaaattggtatttattaaccgctcgtgaacgtcaa
attattgaggcacggtatcaacaacaattagcaattattcaaactgattatgctgctttt
agggaggattattag
DBGET
integrated database retrieval system
