Spiroplasma sp. NBRC 100390: S100390_v1c06060
Help
Entry
S100390_v1c06060 CDS
T05859
Name
(GenBank) helicase
Organism
sprn
Spiroplasma sp. NBRC 100390
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
SNF2_assoc
Helicase_C
ResIII
DEAD
SWIM
TetR_C_26
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
APE13413
UniProt:
A0A1J0U0V6
LinkDB
All DBs
Position
complement(688020..691316)
Genome browser
AA seq
1098 aa
AA seq
DB search
MESFNLDFIRNLTRLVTFNNAEQLYQTKKVTLLKIDEQQTSNNEKELIISCQVVAKNNSD
YYEVNVVFAIVAEMTFLTRQSCSCIDYNFQHQICQHIIATLLFAFYESKENIQQWRSVFT
ATDHLLTTFVNKNKQNYEIKENIVDCQCSLIIDSTFQKPAVVQLKLGYEDDQFFEIKNIY
HFLGFLAKNPLDPDYLKGYEISQKFVLYPAKVVFSPFAEKVIRFLQREFINVFSFLQTQK
MDFYGVSITKSFGFSAYQTEQFLITLQDETIKLIINDHEYPNIKISVDQYQPSLKVQQND
NLIQIINNKITPIVLTTNQGSLFDYEQIFLLGEKNAFLLGPIYQTMAVTNQNQITFTTHQ
TSAVIKEIVALLDYPRDVVNVDKTILNTLEKTPLIIESYFDFKGKEIILRPIFRYGTITI
DLLNKTNDDSKIVLRDIYQEQQYLTLLKQIGFVKKYNYLILNDLNYVIKLLSEHISTLET
LSQIFYTDNFKNVRLVDFNVHSSTINVNQKNNWLEFEFQVADIDYHNLSEILMAINNGNK
YHQLANGGIIDLQAQTLQKFATLINQFDFQAEQFASGKLQLPKYHALTIYNNLDLWAEFN
CTFNFDFDHLITKIKNLEENKFSVPASLETVMCDFQKKGYFWLKTLASLGFGGILADEMG
LGKTLQTISFILKEYELNPKMAPVLIVVPASLIYNWKNEINKFAPALKTLVIAGERKTRE
LLFAKINEVQVIITSYPLLRRDIGYYQQFQFQYCFLDEAQHIKNPQSINAKTVGTLNITT
RFALTGTPIENNLTELWSIFNFILPGFLFHHHYFQKRYEIPIIREQNEEVKKELLQKIAP
FILRRLKKDVMSELPPKIEHKILVEMTERQKKIYAAFATAAREEINKILKAGQYQQNRLK
IFATLTKLRQICCDPSILDEKYQNESAKLDALRDIFSDLTGGGHKILIFSQFTTVLKRIE
TITRELNLKYLYLDGKTRSESRVLMTQKFNEDETISVFLISLRAGGVGLNLTAADVVIHF
DPWWNPSIENQATDRAHRIGQQSTVQVIKLIAKGTIEEKILAIQNDKQAVIEAVLNNNLE
NANFTKFSEAELRDILEL
NT seq
3297 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaagctttaatcttgattttattcgaaatttaacgagattagtaacatttaataat
gctgaacaattgtatcagacaaagaaggtaacattattaaaaattgatgaacaacaaacc
tcaaataacgaaaaagaattaattattagttgccaagttgtagcaaaaaataatagtgat
tattatgaagttaatgttgtttttgccattgttgctgaaatgacatttttgactcgtcaa
agttgtagttgtattgactataattttcagcatcaaatttgtcagcatattattgcaact
ttgttgtttgctttttatgaatcaaaagaaaacattcaacagtggcgatcagtatttacc
gcaactgatcatttattaaccacatttgttaataagaataaacaaaattatgaaattaaa
gaaaatattgttgattgtcaatgtagcttaattattgattcaacatttcaaaaacccgct
gttgtgcaattaaaattgggttatgaggatgaccagttttttgaaattaaaaacatttat
cattttttaggttttttggcaaaaaatccccttgatccagattatttaaaaggttatgag
atttcacaaaaatttgttttgtatccagcaaaagtagttttttcaccatttgcggaaaaa
gtaattcggtttttacagcgagaatttattaatgtttttagttttttacaaacacagaaa
atggatttttatggtgtgtcaattacaaaaagttttggtttttcagcttatcaaacagaa
caatttttaataactttacaggacgaaacaattaaattaattattaatgatcatgaatat
ccaaatattaaaatcagtgttgatcagtatcaacccagtttaaaagttcaacaaaatgat
aatttaattcaaattattaacaataaaataacacccatagttttaacgacaaatcaagga
agtttatttgattatgaacaaatttttctattaggagaaaaaaatgcctttttgttagga
ccaatttatcaaacaatggcagtgactaatcaaaatcaaattactttcactactcatcaa
actagtgctgttattaaagaaattgttgctttgttagattatcctcgtgatgttgttaat
gttgataaaacaattttgaacacattagaaaaaacaccattaattattgaaagttatttt
gattttaagggtaaggaaattatcttacgcccaatctttcgttacggcacaataacaatt
gatttgttaaataaaactaacgatgatagtaaaattgtgttacgtgatatttatcaagaa
caacaatatttaactcttttaaaacaaattggtttcgttaaaaaatataattatttaatt
ttgaatgatttaaattatgttattaaattgttatcagagcatatctcaacgttagaaaca
ctttcgcaaattttttatactgataattttaaaaatgttcgcttagttgattttaatgtt
catagttcaactattaatgttaatcaaaaaaataattggttagaatttgaatttcaagta
gcagatattgattatcataatttaagtgaaattttaatggcgattaataatgggaataaa
tatcatcaattagcaaatgggggaattattgatttacaagcacagacattacagaagttt
gcaactttaattaatcagtttgattttcaagcagaacaatttgcatcaggtaaattgcaa
ttgccaaaatatcatgctttaacaatttataataatttggatttatgagcagaatttaat
tgtactttcaattttgattttgatcatttaattactaaaattaagaatttagaagaaaat
aaatttagtgttccagcatcattagaaacggtaatgtgtgattttcaaaagaaaggttat
ttttgattaaagactcttgcttcattgggatttggtggaattttagctgatgaaatgggg
ctaggaaaaacattacaaacaattagttttattttaaaagaatatgagttgaatcccaaa
atggcgcctgttttaattgttgttccagcatcattaatttataattgaaaaaatgaaatt
aataaatttgcccccgctttaaagactttggtgattgcgggtgaacgcaaaacaagagaa
ctattatttgcaaaaattaatgaagtgcaagtcattattacttcttatccattacttcgc
cgtgatattggttattatcaacaatttcaatttcaatattgctttttagatgaagcacaa
catattaaaaacccacaatcaattaatgctaaaacggttggaacgttaaatattacaact
cgttttgcattaacaggaacaccaattgaaaataatttaacggaattatgatcaatcttt
aattttattttacctgggtttttgtttcatcaccattactttcaaaaacgatatgagatt
ccaattattcgggaacaaaatgaagaagttaaaaaagaattattacaaaaaattgctcca
tttattttgcgtcgtttgaaaaaagatgtaatgagtgaattaccaccaaaaattgaacat
aaaattttagtagaaatgactgaacgacaaaagaaaatctatgctgcttttgctactgca
gcacgagaagaaattaataagattttaaaagcaggtcaatatcaacaaaaccgcttgaaa
atttttgcaacattaactaaactaagacaaatttgttgtgaccctagtattttagatgaa
aaatatcagaatgaaagtgctaaattagatgctttacgagacattttttctgatttaaca
ggtggtggtcataaaattttaattttttcacaatttacaaccgttttaaaacggattgaa
acaattacaagggaattaaatttaaaatatttgtatttagatggtaaaacacgatcagaa
agtcgagtgctgatgacccaaaaatttaacgaagatgaaacaattagtgtttttctaatt
tccttaagagcaggtggtgttggattgaatttaacagcagctgatgttgttattcatttt
gatccttgatgaaatccttcgattgaaaatcaagcaactgatcgtgctcaccgaattggc
caacaaagtacagtgcaagtaattaagttgattgcaaaaggaacaattgaagaaaagatt
ttagcaattcaaaatgataagcaagcagtaattgaagcggtactaaataataatttagaa
aatgctaattttacaaaattttcagaagcagagttacgtgatattttggaattataa
DBGET
integrated database retrieval system
