Spiroplasma sp. NBRC 100390: S100390_v1c08310
Help
Entry
S100390_v1c08310 CDS
T05859
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K21898
ornithine racemase [EC:
5.1.1.12
]
Organism
sprn
Spiroplasma sp. NBRC 100390
Pathway
sprn01100
Metabolic pathways
sprn01110
Biosynthesis of secondary metabolites
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sprn00001
]
09100 Metabolism
09106 Metabolism of other amino acids
00470 D-Amino acid metabolism
S100390_v1c08310
09110 Biosynthesis of other secondary metabolites
00975 Biosynthesis of various siderophores
S100390_v1c08310
Enzymes [BR:
sprn01000
]
5. Isomerases
5.1 Racemases and epimerases
5.1.1 Acting on amino acids and derivatives
5.1.1.12 ornithine racemase
S100390_v1c08310
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Ala_racemase_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
APE13637
LinkDB
All DBs
Position
complement(946187..947251)
Genome browser
AA seq
354 aa
AA seq
DB search
MYPKLIWNLARIKTNCQIMVQECSARNLDLVGVVKLGAGQQKIVSTLIESGIKTIADSRI
LNLQQFAHLPVKKMLLRLPMLSEVPTVVNNADCALVSEIVTIKALNQAAQVINKKFEIIL
MIETGDIREGLWDEGLIFQTVATVLSLSHIKLTGLGTNFACFGATVPTVQKLNQLVQLKQ
QLEQHFNIKLPIISCGNSSHITIWDNPQLNPAINQIRSGTALLMGLGLNDEPILFLQQNN
LWLEAEIIELQTKPSASIGERGLDAFGRIKEFDDIGERVKAIIALGRQDCPFEELTPFEK
GITILGQSSDHTILDITDYHAELTVGSVIKFKTTYLANLMLGTSCYVQKEFLES
NT seq
1065 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtatccaaaactaatatgaaatttagcccgtattaaaacaaattgtcagataatggtg
caagaatgttccgctaggaacttggaccttgttggcgttgttaaattaggggcaggccaa
caaaaaattgtatcaacattaatagaaagtggaattaaaacaattgcagattctcgaatt
ttaaacttacagcaatttgctcatttgccagttaaaaaaatgttgttgcgattaccaatg
ttaagtgaagttccaacggttgttaacaatgctgattgtgctttggtttctgaaattgtg
acaattaaggctttaaatcaagcagcacaagttattaataagaaatttgaaataatctta
atgattgaaactggtgatattcgagaaggattatgagatgaaggattaatttttcaaaca
gttgcaacggtattatcgttatcacatattaagttaactggcttaggaactaattttgct
tgtttcggtgcaacagttcccaccgttcaaaaattaaatcaattggtacaattaaaacaa
caattagaacaacattttaatattaaattaccaattattagctgtggtaactcaagccat
attacaatttgggataatccgcaattgaatccagcaattaatcaaattcggagtgggaca
gccttattaatgggtttaggattaaatgatgaaccaattctttttttacaacaaaataat
ttatgactagaagctgaaattattgaattacaaacaaaaccaagtgcatcaattggtgag
cgaggattagatgcttttggtcggataaaagaatttgatgatattggtgaacgggtaaaa
gcaatcattgcattaggacgacaagattgtccttttgaagaattaacaccttttgaaaaa
ggtattactattttgggacaatcaagtgatcatactattttagatattactgattatcat
gcggaattaaccgttggtagcgttattaaatttaaaacaacgtatttagcgaatttaatg
ttgggaactagttgttatgttcaaaaagaatttttagaatcataa
DBGET
integrated database retrieval system
