Sphingobacterium psychroaquaticum: E2P86_05665
Help
Entry
E2P86_05665 CDS
T05967
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
spsc
Sphingobacterium psychroaquaticum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
spsc00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
spsc02000
]
E2P86_05665
Transporters [BR:
spsc02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
E2P86_05665
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
DUF3869
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QBQ40666
LinkDB
All DBs
Position
1371784..1374825
Genome browser
AA seq
1013 aa
AA seq
DB search
MINKLKILILFVLALVAYQGKAQQQITGLVKDQATGSVVIGATIVGDKGGKTNSDGQGRF
SISSGNTTIDVSYVGYQSQRIRLDGRTHYDVLLVAQESALEEVVVIGYGTSKKSDITGSV
SSLNEKDFNKGANISPEQLIAGKVSGVQVVQSSGEPGGGISVNVRGVGSVNAGNSPLYVV
DGFPIDNSATVGGTGANFTGMKSARNPLNAINPDDIASIEVLKDASATAIYGSRGANGVV
LITTKKGKSGGLNVNYDAYYGVQNVQRDIKILSTRQYKDVINGLIDAGEGTASQRIGDIT
EGTDWLAHMYSKNAPIQNHNLSFSGGNENTKYHTSLNYFGQDGLLINSDNKRYSARVNLE
HTAGNFKLGTNITSSYIKDNYVANGMDLNERAGIIYAAIAYDPTLPIYNADGTYKLSPDM
NIDNPLAIANGKTSQSNLYRTLGTIYGEMKFLEDFTAKLNVGADISNQRRDTYVDRQTIE
GRANGGVASILQGTSTSYLGEFTLGYKKRLDMHDLNFLVGITGQQFNDVSSSSQGSGFSS
DATGTNNMGLADPTKFIVTSGRTRNSLLSYLGRANYNLYDKYLFTASLRIDGSSRFGANN
RYGVFPSFAFGWKLEEEEFIKQLDFFNTLKLRTSWGRTGNQEIGNYQSMSTYGGGQKAVI
GNAQVSTTTPSRIANPNLKWETSEQLNFGLDYGFLKNRISGSIDVFYKDTKDMLLNLAVP
RTTGFSTMMTNVGAVRNSGIEFLMNTRNIEGAFSWETTWNFAWLKNLVKDLGTNTIIYNG
SAGGTSNVSIIKVGQPMYSFYGYEIDGIWQKNDDFSVTKDPVVAGDFKYRDINGDMIVNA
DDRVVIGNSFPKYTASLTNNFDYKGFNLNIFIDGVFGVNMLNNNLVDTYFPANLKRNRLA
DPMLNRWTADNPSTVYPSFVNPLKQGKKEVNSYTVEDASYVRLNTVKLGYTIPLQNTKYV
KGINLYVVGQNLAIITDYTGYDPSINPNGSGARIDWNAYPTARTFMFGINLNL
NT seq
3042 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaacaaacttaaaattttgattctgtttgtgctcgccctggtagcttaccagggg
aaagcacagcaacagattaccggactggtcaaagaccaagctaccggtagtgttgttatc
ggcgctacaatagtaggcgataaaggagggaagactaattcggatgggcaaggacgattt
agtatttcctcgggtaatacgacaatcgatgtaagttacgtcggttatcaatcgcaacgc
atccgtttggatggtcgcacgcattacgatgtgcttcttgttgcacaggaaagtgcactg
gaggaggttgtggtaattggttatggtacttctaaaaaatcagacataacggggagtgtt
agcagtctgaatgagaaggactttaataaaggtgcaaatatttcaccggagcagttgatc
gcaggtaaggtatcgggggtgcaggtggtgcaaagcagtggggagccgggaggtggtatt
tcggtgaatgtgcgtggcgtcggatcggtgaacgcgggtaattcgcctttgtatgttgtg
gatggatttcccatcgataattctgcaacagtagggggaacgggagcgaatttcacaggg
atgaaatcggctagaaatccactgaatgccataaacccggatgatattgcgtccattgag
gtgttgaaagatgcttctgctacggcgatttatggttctaggggcgcaaatggagtagtg
cttatcaccacgaaaaaaggaaagtctggcggtttgaacgtaaattatgatgcgtattac
ggtgtgcaaaatgtacagcgtgacattaagatactgtcaacccgacagtacaaagatgtg
atcaatggcttaattgatgccggagagggaacggccagccagcgtattggtgatatcacg
gagggaacagattggctagctcatatgtattccaaaaatgcaccgatacagaaccataat
ctttcattttcagggggcaatgaaaatacaaagtaccatacgtcgcttaactattttggg
caggatggcttattgattaattcggacaataagcggtacagtgcacgtgtaaatcttgaa
catacggcaggtaactttaaattggggaccaatattacgagttcctatatcaaagataat
tatgtcgccaatggtatggatttgaatgagcgagcaggtattatctatgcggctattgcc
tatgatccaaccttaccgatttataatgccgatggaacctataaactatctccggatatg
aatatagataatcccttagcaatcgcgaatgggaaaacatcgcaatcaaatctgtatcgc
acgctgggcacgatctacggtgaaatgaaatttctcgaggattttacggcgaagctaaat
gttggagccgatatttcgaatcaacgccgcgatacctacgtagatcggcaaacgatcgaa
ggacgcgcgaatgggggggtcgctagtattttacagggaacaagcaccagctatctcggt
gagtttacactcgggtataagaagagattggatatgcatgacttgaattttttggtgggt
attaccggccaacagtttaatgatgtctcttcttcttctcaaggtagtggcttctcttcg
gatgctacaggaaccaataatatggggcttgcggatccgaccaaatttattgtcaccagt
ggccgcacacgaaacagccttttgtcttacctcgggcgtgccaactataatttatacgat
aagtatttgtttacggcatcgctgcgtattgatggttcatctcgatttggagcgaacaat
cgctatggcgtgttcccctcttttgcctttggatggaagctggaggaagaggaatttatc
aagcagttggacttctttaataccctgaaactgagaaccagctggggaagaaccggtaat
caagaaattggaaactaccaatccatgtctacttatggtggagggcagaaagcggtgatc
ggaaacgcacaggttagtactacgacgcctagccgtattgcgaaccccaatctgaaatgg
gaaacctcagaacagttgaattttggtttggattatgggttcctgaaaaatagaatatcc
ggtagcatcgatgtgttttataaagatacaaaggatatgttgctaaatctggcggtaccg
cgcacgactggtttctccacgatgatgaccaacgtgggagcggtacgaaattcgggtatt
gagtttttgatgaatacccgaaacatagaaggtgcgtttagttgggaaacgacttggaat
tttgcgtggttaaaaaatctagtgaaagacctagggacgaatacaattatttacaatggt
tctgcgggaggaacgtcgaatgtatccattatcaaggtgggacagccgatgtattctttt
tacggctatgagatcgatggtatatggcagaaaaatgatgatttttcggtaactaaagat
ccggtggtagcgggtgatttcaaatatagagacatcaacggtgatatgattgtgaacgcc
gatgatcgcgtggtaatcggaaactcttttccaaagtatacggcatcgctaacgaataat
tttgactataagggcttcaatttaaatatcttcatcgatggggtgtttggtgttaatatg
ctgaataataatttggtggatacgtattttccagcaaacttaaaacgaaacagactagca
gacccaatgcttaaccgatggactgcggacaacccttcgacggtatatccttcttttgta
aacccgttaaaacaaggtaagaaagaggttaattcgtatacggttgaagatgcaagttat
gttcggttgaatacggtgaagttggggtatacgattccgcttcaaaatacgaaatatgta
aaagggatcaacctgtatgtagtcggtcagaatctcgctattatcaccgattatacgggc
tatgatccttcgattaatccaaatggaagcggagctagaatcgattggaatgcttatcca
acggcgcgtacatttatgtttggtataaatttaaacttatag
DBGET
integrated database retrieval system
