Staphylococcus shinii: JMB28_07565
Help
Entry
JMB28_07565 CDS
T08256
Name
(GenBank) helix-turn-helix domain-containing protein
Organism
spsd
Staphylococcus shinii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HTH_18
HTH_AraC
AraC_binding
Cupin_2
AraC_binding_2
CTP-dep_RFKase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QRA15518
LinkDB
All DBs
Position
complement(1572389..1573267)
Genome browser
AA seq
292 aa
AA seq
DB search
MLDDETFKLKFDTISLPFEGEYAVWHKISDGHFGNELHYHDHYEIFFSLSGNMLYTIEAE
QYQLDVGSMLIITPYEFHQLNEQMDGHAERIGLRFDAQLLESLSTPECNLMQCFDTKSPN
FKHLLQLTEVQKRELYYLLQGLLNEQENNKYGKKLAEESMLTQFFVLLNRVSIENAEIKM
DDDPQMQLVRQVLDYMELHYADQISLEDLERKFYVSRYKITQYFTRIVGYPPYRYLLQIR
LQNAQRMLKKGESPQQVAVLCGFSDYSNFYRRFKTIYGCSPKNYYQQHLTNG
NT seq
879 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttagacgatgaaacatttaaactaaaatttgatactatttcactaccattcgaggga
gaatatgcagtgtggcataaaattagtgatggccactttggcaatgagctacactatcat
gaccattacgaaattttcttttcattatccggaaatatgctgtacacgattgaagcagag
caatatcaattagacgttggttccatgttgataataacaccgtacgaatttcatcagttg
aatgaacagatggatggacatgctgaacgtattggtctgaggttcgatgcgcagttatta
gagtcactttccactcctgaatgtaatttaatgcaatgttttgataccaaatcacctaac
tttaaacatttactacagttaacagaagtacaaaagcgtgagctttattatttattacaa
ggtcttttgaatgagcaagaaaataataaatatggtaagaagcttgctgaagaatcaatg
ttgactcaattttttgtgctcctcaacagagtgtcgatagaaaatgctgaaataaaaatg
gacgatgatccacaaatgcagttagtgagacaggtattagactatatggagttacactat
gctgatcagatttctctagaagacttagaaaggaaattctatgttagccgttataaaata
acacagtattttacacgaatagtaggatatccaccatatcgctatttattacaaataagg
ttacaaaatgcacaaagaatgttaaaaaaaggagaaagccctcaacaagtagcagtttta
tgtggttttagtgattactcgaatttttatagacgttttaaaacaatatatggatgtagc
cctaaaaattattatcaacaacatttaactaatggttaa
DBGET
integrated database retrieval system
