Shewanella psychrotolerans: K0I62_00935
Help
Entry
K0I62_00935 CDS
T09306
Name
(GenBank) heme lyase CcmF/NrfE family subunit
KO
K02198
cytochrome c-type biogenesis protein CcmF
Organism
spsj
Shewanella psychrotolerans
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
spsj00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
spsj02000
]
K0I62_00935
Transporters [BR:
spsj02000
]
Other transporters
Others
K0I62_00935
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CcmF_C
Cytochrom_C_asm
DUF2651
DUF4231
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QYK01594
LinkDB
All DBs
Position
185811..187784
Genome browser
AA seq
657 aa
AA seq
DB search
MIPELGHFSLIIGLAFAFLLASVPLIGVARKDQYLVRYAWPLSYGMFFFIFLSVIVLGYS
FAVDDFSVAYVAHHSNSQLPIFFKIAAVWGGHEGSLLFWVFALSVWTASVAFFSKGLEEV
FTARVLAILAMIVIGFSLFMLLTSSPFERLFPIPMEGRDLNPMLQDVGLIFHPPMLYLGY
VGFSVSFAFAIAALMGGRLDSAWARWSRPWTLAAWIFLTGGISLGSWWAYYELGWGGWWF
WDPVENASFMPWLIGTALLHSVIVTEKRAAFRNWTVLLSIFAFSLSLLGTFIVRSGVLTS
VHSFAADPSRGMFILLLLGLAIGGSLTLFAFRASDMKSPARFELMSKETMLLVGNILLTV
ACGTVLLGTLYPLLIDALNMGKISVGPPYFNAVFVPIVLVLFMFMGIGPNIRWKRAKAGE
LKRKLLVPALVAAVIGVAAPFVADGNFNVWVAFGIGTATWIVLATLRAGYDIINGKDGLS
LARMGRSQLGMVIAHFGIAVSVVGATMVSNYSMEKSVRMGPGITQELAGYSFHFIETKNV
VGPNYTAQQGQVEVSKDGEVITLLKPDRRQYNVRTMDMTEAGIDWGVFRDLYITMGDPIS
STEFAVRLNYKPFVRWLWFGSIFMMVGGVFAASDKRYRRAKIKETTQEKAKEDLATA
NT seq
1974 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatccctgaattaggacacttttcgttgataatagggctggcattcgcctttctatta
gccagcgttcctttaattggtgttgctcgtaaagaccaatacctcgtgcgatatgcctgg
ccattgagctatggtatgtttttctttatttttctttctgtgatcgtactaggctatagc
tttgcggttgatgatttctctgttgcctatgtagcacatcattctaactcccaacttcct
attttctttaagatcgctgcagtatggggtggtcatgaaggttccctgttgttttgggtg
tttgctctatcggtgtggacagcttccgttgccttttttagcaaaggtttagaagaggtc
tttactgctcgagtactcgctatattggcgatgatcgtgattggctttagtttattcatg
ttgttaacttcgagtccctttgagcgattatttcctattcctatggaagggcgtgatctt
aaccctatgttgcaagatgttggcttgatcttccatccgccaatgctctacttgggttat
gttggcttctctgtgagttttgcatttgctattgcagccctaatgggtgggcgtttagat
tctgcatgggctcgttggagccgaccttggacgcttgcagcgtggatcttccttactggc
ggtatctcacttggttcttggtgggcatattatgaattaggttggggtggctggtggttc
tgggatccagttgaaaacgcttcattcatgccttggttaattggtaccgcattattgcac
tcagttatagtgacggagaagcgagcggctttccgtaactggacagtattgctatcgatc
tttgcattctctttaagtttgttaggtacctttatcgttcgttcaggtgtattaacttcg
gttcactcatttgcagctgatccaagtcgaggcatgtttatcctgttgctgcttggttta
gcaattggtggttcgctcactctttttgcattccgcgcgagtgatatgaagagtcctgca
cgttttgagttgatgtctaaagagaccatgttgctggtaggtaatatcttactaaccgtt
gcttgcggtacggtattgttaggtacgctttatccgttacttatcgatgcgcttaacatg
ggtaaaatttcagttggcccaccatacttcaacgcggtgtttgtacctatcgttcttgta
ttgtttatgtttatgggtattggtccaaacattcgttggaagcgtgctaaagctggtgaa
ttgaagcgcaagttactggtccctgcattagtggcggcagtcatcggtgttgcggcgcct
ttcgttgctgatggtaatttcaatgtttgggttgcatttggcataggtacagcgacttgg
atcgtacttgcaacactaagagctggatacgacatcattaacggtaaagatggtttaagt
cttgcccgtatgggacgaagccaattaggtatggtgatcgctcactttggtattgcagtt
tctgttgttggtgccaccatggtgtctaactactctatggaaaagagtgttcgaatgggc
cctggtatcactcaagagcttgcgggttatagcttccattttatcgaaactaaaaatgtc
gttggtcctaactacacggcccagcaagggcaggttgaagtcagtaaagatggcgaggtg
attacactgttaaagcctgaccgccgtcaatataacgtacgtacaatggatatgacggaa
gcgggcattgattggggtgtattccgcgatctatacatcactatgggtgatcctatttcg
agtactgaatttgcagtacgtcttaactataaaccattcgttcgttggttatggtttggt
agcatctttatgatggttggtggtgtttttgcagcgtctgataaacgctaccgtcgcgct
aagattaaagaaactacacaagaaaaagctaaagaagatttagcaacggcataa
DBGET
integrated database retrieval system
