Shewanella psychrotolerans: K0I62_01115
Help
Entry
K0I62_01115 CDS
T09306
Name
(GenBank) diguanylate cyclase
Organism
spsj
Shewanella psychrotolerans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GGDEF
PAS_9
PAS
PAS_3
PAS_4
PAS_8
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QYK01622
LinkDB
All DBs
Position
226606..228123
Genome browser
AA seq
505 aa
AA seq
DB search
MQILDNRTLLVVIALISIGSAVALISLWRAQNKRNGSGFWASGMSCIALASVLLFGRGSL
PEFLSLVIANTFYVVGFLLIYRGIRIFTGREPLGLFDISFPLLMSLLFCYFYYIDNNLNI
RIAVLSAAFFIICTMVVKTLLAEKDAPWRTAGYAVAFMFGLFGLSHGSRGIIALFSASYT
GFLDPSVTSSIVLLSSVFIIGGIAISLVLLSYSVLEARLRIVSLAIEQSASSIVITDKVG
AIKYVNPAFIDKTGYSSEELMGQNPRVLQSGEMDASEYSRLWQTISSGDTWRGEFHNRKK
NGEFFWEIASIAPVKQRNGHISHFVAVKEDISALKEAKERIHHLANHDGLTGLPSRTFFM
QSLSNVLRSEHAKNCAVLFVDLDGFKAINDSFGHDAGDQLLIEATRRLSCSVRDIDIVGR
IGGDEFLILCTEVESQAAVKLVAEHIVNLLAQPFIYDDAEVTISASIGIAFYPQDSDDAE
TLVKMADKAMYQVKRQGKNNYAFAN
NT seq
1518 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaatattagataatcgtactttactcgtcgtcattgcgcttatttcaatcggctcc
gccgtggcgttaatttcgttgtggcgagcacaaaacaagcgtaatggatctggcttttgg
gcatcgggcatgtcttgtattgcgttggctagtgtgctgctttttggccgtggctctctg
ccagaatttctctccttggttatcgctaacactttttatgttgttggtttcttacttatt
tatcgtggcatacgtatttttactggtcgtgaacccttagggctatttgatattagtttt
ccgctgctgatgtcgctgttgttttgttatttctactatatcgataataaccttaatatt
agaatcgctgtgctcagcgcagcctttttcattatatgtaccatggttgtgaaaacgtta
ctggcggaaaaggacgctccatggcgcaccgcagggtatgcggttgcgtttatgtttggt
ctatttggtttatcccatggcagccgcggcattattgcactcttttctgcttcatatact
ggatttctagatccgagcgtgacttcaagcatcgttttattaagcagcgtgtttattatt
ggtggaattgctatttcgctggtcttattaagttattcggtattagaggcgagattacgc
atagtctctttagcaattgagcagtcggcatcatccattgttattactgataaagttggt
gcgattaaatatgtaaacccagcctttatcgataaaacgggttatagctcagaagaactg
atgggacaaaatcctcgtgtgttacaatcaggtgaaatggacgctagtgaatattcaaga
ttatggcagacgatctcctctggagatacgtggcgtggcgaatttcataatcgtaagaaa
aatggtgagtttttttgggagatagcctctattgcgccagtgaagcagcgtaatggtcac
attagtcattttgtggctgttaaagaagatatctcagcgctaaaagaggccaaagagcgg
atccaccacttagctaatcacgatggattaacagggctaccctccaggactttttttatg
caaagcctgagcaatgtcttgcgatctgagcatgctaaaaactgtgctgtgctgtttgtt
gatttagatggttttaaggcgatcaatgattcgtttgggcatgatgccggtgaccagttg
ttaatcgaagcgactcggcgtctgagttgcagcgttcgcgatattgatattgttgggcgt
attggcggtgatgagtttttaattttatgcacagaagtcgagagccaagctgcggtgaag
ttagttgctgagcatattgttaatctattggctcagccttttatttatgatgatgcggag
gtcactatctccgccagtattgggatcgccttttatcctcaagatagtgatgatgcagag
accttggttaaaatggccgataaggcgatgtatcaggttaaaaggcaaggtaaaaataat
tacgcttttgccaactaa
DBGET
integrated database retrieval system
