KEGG   Shewanella psychrotolerans: K0I62_10210
Entry
K0I62_10210       CDS       T09306                                 
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase
Organism
spsj  Shewanella psychrotolerans
SSDB
Motif
Pfam: SNF2-rel_dom Helicase_C ResIII DEAD ERCC3_RAD25_C HDA2-3 SWIM
Other DBs
NCBI-ProteinID: QYJ99843
LinkDB
Position
complement(2310454..2313603)
AA seq 1049 aa
MLKIAHDFTHQQLFAGLQLLLQQELIDFSHNADSLYGRFIDPQGDLFTRVFFTVEGLKCE
CSCSQRQCAHVAALVIEYDASQPDPITARSRRADTAIRLFKSEANQLFDPFPAMARHRVL
YLIHGEPDALQLSVHKGYLNKNGSYQLRGPLGFDITNSTPLPKYVSQSDLQLLYQLKSLL
SNEEVAGQNDQIQLPLDRGLSADFYQLLGMTGRGFYQDALRPLRCDIHYDEDYVDTSYLI
ELEDKCYLEPVSHTLVIDERDSHLIGQSILENIDLDGEWLPRVEVVRHGVDFPWLIPAMM
PLDVALFTMVHRGVAYNLSQLLFIAANHKPLMTQIAKCQLMLNILPLVSQQFELPISQSL
ASGTRLVPDDVSEHVVFFRRLTLAGWLVDFAAKKRFVKVAANNWFAEVETPNKDWFELSL
GVEVDGERVNLLPLLTNLIRQGKLSLELSCEPISLELDTGELLSLPANRVARILSVLGEL
FNKQPLNESQQLVLPRHQLTRLPQLDNALKQDLTDKRSKALKWSGATWLRKQAQALNSYV
SNTPHHADIEVPEGLNAVLRPYQEQGVSWLQFIKQHHFAGILADDMGLGKTLQTLCSILL
DKEQGKLTAPVLVIAPTSLLSNWQREATTFSPSLSTLVWSGRARRDHHQALGSVDIVITS
YGILAQDADELTGRHWYQVILDEAQTIKNSRSRVTKLVNRLDTSHRLCLTGTPMENHLGE
LWSLFHFLMPGFLGSAAQYQRQFKQPIEKDNCDTARRKLAQRIAPFMLRRTKVEVATELP
KKTVINTLIELSQTQSDLYETIRLTVAEQLQLALLQTGAKANRLAISNALLKLRQVCCHP
AMLKLNPTVDDDSTLNLEGDVSQDLLVAESSKLAWLENKLPNMIEDGRNILIFSSFTTML
DLIAQQLDDQGIDYEMLTGRSRHRDRIIDRFRSGKVNVFLISLKAGGSGLNLTEADVVIH
VDPWWNPAAEEQASDRAYRIGQQKPVFVYKLICQNTVEERIQQLQQTKKALAQSMYQTES
LSVAEMNSDDWLALLQPIADEASSDQAQS
NT seq 3150 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
ttgttaaagattgcgcacgattttactcaccaacaactgtttgcgggtttacaacttctt
ctgcagcaggaactgatcgacttttctcacaacgcagatagcctttacggccgttttatc
gatcctcaaggggatctgtttacccgtgtattctttactgttgaaggacttaaatgcgag
tgttcttgttcacaacggcaatgtgctcatgttgccgcgttggtgatcgaatatgacgcg
agccaaccggatcctattactgcgcgtagtcgtcgtgcagataccgctatccgcctattt
aaaagcgaagctaatcaactttttgacccgttccctgcaatggcccgtcatcgcgtcttg
tatcttattcacggtgagccagatgcactgcaattaagtgtgcataaaggctatcttaat
aaaaatggtagctatcaattacgtggccccttaggttttgatattactaacagcacgcca
ctacctaaatacgtgagtcaatctgatttacaattactctaccagcttaaaagcctgtta
tcgaacgaagaggttgctggtcaaaatgatcagattcagcttcctttagatagaggattg
tcagcagatttttaccaattgcttggcatgaccggaagagggttctatcaagacgctcta
agaccattacgctgcgatattcactatgatgaagattatgttgatacgagttatttaatt
gagcttgaagataaatgttatttggagccagtaagtcatactttggtcatcgatgagcgc
gatagtcatctcattgggcaaagtatattagagaatattgatctcgatggcgaatggtta
cctcgtgttgaggtggtacgtcatggggtcgatttcccttggttgatacccgcaatgatg
ccactggatgtagccttgtttactatggtgcatcgtggtgtcgcatataacttatcacag
ttgttatttatcgccgcaaatcataagcccttgatgactcagattgccaagtgtcaacta
atgcttaatattcttcctttagttagccagcagtttgagttacctatcagccaaagttta
gcttctggtacgcggctggtgcctgacgatgtcagtgaacatgtggtgtttttcagaaga
ttgaccttagcgggttggctggtcgattttgcggctaaaaagcgatttgtaaaagtagcc
gcaaataactggtttgcagaggtcgaaacacctaacaaagattggtttgaactcagctta
ggtgttgaagttgatggtgaacgagtcaatctattgcctttattaaccaacttgatccgc
caaggtaaattgtcgttggagctgagctgtgagcctatctctttggagctcgatactggt
gagttattgtcattgccagccaatagggttgcacggattttgagtgtattgggcgaacta
tttaacaaacaaccgctaaatgagtcgcagcagctggtattacctcgtcaccaactgacc
cgattaccgcaactcgataatgcattaaaacaagatctcaccgataaacgctctaaagcg
ctgaaatggagtggtgcgacttggctacgaaaacaggcgcaagcactaaatagttatgtg
agtaatacacctcaccatgctgatatcgaggtgcctgagggacttaatgcggtattgagg
ccctatcaggaacaaggcgttagttggctacagtttatcaaacagcatcattttgctggc
attttggctgatgatatggggctaggtaaaaccttgcaaaccttgtgcagtattttgttg
gacaaggagcagggcaagctaacggcaccagtgttagtcatagctcccaccagtttactc
agcaattggcaacgtgaagcaaccacttttagtccaagcttgagcacgttagtgtggagc
ggccgagcgaggcgtgatcaccatcaggcgctaggcagtgtcgacatagtgatcaccagt
tatggcattcttgctcaagatgccgacgaattaactgggcgccactggtaccaagttatt
ttagatgaagctcaaacgattaaaaacagcaggagtagggttactaagctggttaatcgt
ttagatacaagccatcgtctatgtcttaccggaacaccgatggaaaaccatttaggtgaa
ttgtggtcgttgtttcattttttaatgccaggttttctcggcagtgcagcgcaataccaa
cgccagtttaaacaaccgatagaaaaagataattgtgacaccgcgaggcgtaaattagcc
caacgaatcgcgccctttatgttgagacgtaccaaggttgaggtggccactgagttaccg
aaaaagacggtgatcaataccctcattgaattgagtcaaactcagtcagatctctatgaa
actatccgcttaacggttgctgaacagttacagttagctctattacaaacgggggcaaaa
gccaaccgattagctatcagtaatgcattattaaaattgcgccaagtatgttgtcatcca
gcaatgcttaagctcaatccaactgttgacgatgacagtacgcttaatcttgaaggtgat
gtatctcaagatctgttggtcgcagaatcttctaagctagcttggcttgaaaataagctg
ccaaatatgattgaggatggacgtaatattcttattttttcttccttcaccaccatgctt
gacctcatagctcagcaacttgatgatcaaggcatcgattatgagatgttaacgggtaga
agtcgtcatcgagatcggatcatcgaccgtttccgtagcggcaaggttaatgtgtttctg
atcagccttaaggcgggaggttctggccttaatctaactgaagcagatgtggttattcat
gttgatccatggtggaatccagccgctgaggagcaagccagtgatcgggcgtatcgcatt
ggtcagcaaaagccggtctttgtttataagctgatatgccaaaacaccgttgaagagcgt
attcagcagttacaacaaaccaaaaaggcattggcgcagagtatgtatcaaaccgagagt
ctttctgttgcagagatgaatagtgatgattggttagccttgcttcaaccaatcgccgat
gaagccagctcagatcaagcacagtcttga

DBGET integrated database retrieval system