Shewanella psychromarinicola: EGC80_05270
Help
Entry
EGC80_05270 CDS
T09848
Name
(GenBank) BCCT family transporter
KO
K05020
glycine betaine transporter
Organism
spsr
Shewanella psychromarinicola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
spsr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
spsr02000
]
EGC80_05270
Transporters [BR:
spsr02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
EGC80_05270
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
BCCT
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZG34396
UniProt:
A0A3N4E2S0
LinkDB
All DBs
Position
1237288..1238994
Genome browser
AA seq
568 aa
AA seq
DB search
MCSGVGKLKCWVNRLLGDVGVVFYLSIFLIVAFLTVAAVEPDETQRLAQKALNATTSNFG
WLYLLTSSGFVLFTLGLAFSRFGIIRLGLDDEPPEFSFSSWLAMIFSGGMGVGLVFWGVA
EPILHLSSPPLGIGAPGSVEAAQTGMRYAFFHWGLHQWANFTVVGLAIAYVRFRHNSRGL
ISETFRPLLGDRVDGGWGNAIDILAVLSTIFGVATTLGLGALQINSGLSRLSGMPYGITP
QLLIIAGLGSLFILSAMTPLNRGIRYLSNANMVLAAGLLLFVLMLGPTAFIFSELTQTMG
EYVGNIIQMSLVTTPYSSAHWVQEWTIFYWAWGLSWAPFVGSFIARISQGRTIREFVLGV
MIVPVLLSMLWFSTFGGSAIYFELFENAGIAAAVAQEVPAGLYAMLDQLPGGFYAAIVAV
LLVSMFVVTSADSATFVLGMFTSKGVLNPTRFVRILWGVLQLLMAGVLLLSGGLLGLRTI
SIVTAFPFMLLMVLMAYSLYRDLSLEWQRRQKNDNLLHERIESMLLRESEREAARQAEEN
AHPSAPEPTEDADVGEAVEHKEGDKIGN
NT seq
1707 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtgcagtggcgtaggaaagcttaagtgctgggtaaatcgactgcttggggatgtgggg
gtggttttttatctatcaatatttctgattgttgcctttttgacggttgcggctgtcgaa
cctgatgaaacacaaaggttggcacagaaagcattgaatgcgacgacgagcaattttggt
tggttgtatcttctgaccagtagcggttttgtgctctttactttgggcttggctttttct
cggttcggcattattcgccttggtcttgatgatgaacctcctgaatttagttttagcagc
tggctggcgatgatcttctccggtggaatgggggttggtttggtcttttggggggtagca
gagccgatacttcatcttagttcaccgcctttaggaataggcgcgccaggctcagtagaa
gctgcgcagacgggtatgcgttatgccttttttcattggggcctgcatcagtgggccaac
tttacggtggtggggctggccattgcctatgtgaggtttcgtcacaacagtcgtggttta
attagcgaaacttttcggcccttgttgggagaccgtgtcgatggcggttggggaaatgcg
attgatattttggcggtgctttctactatttttggtgtggcaacgacgctcgggctgggg
gcgttacagattaatagtggtctgtctcggctctctggtatgccttacggaatcactccc
cagttactgatcattgccggactcggctcgttgttcatactgtcagccatgacgccatta
aatcgcggcatacgttacttgagtaatgccaatatggtgttggctgcaggtctattgctg
tttgttttaatgcttgggcctacggcttttatcttcagtgaattgacccaaactatgggc
gaatacgtgggtaatattatccagatgagtttggtaacgacgccgtattctagtgcgcat
tgggtgcaagaatggaccattttttattgggcttggggccttagttgggcaccttttgtc
ggcagctttattgcccgtatttctcagggacgcactattcgggagtttgttttaggcgtt
atgattgtgccagtgctattgagtatgctctggttttctacctttggcggctccgctatt
tattttgagctgttcgaaaacgcgggtatcgctgcggcagtggcgcaggaagtgcccgca
gggctctatgccatgctagatcaattacccggtggcttttatgcggcgattgttgcggtt
cttttggtgtctatgtttgtggtgacatctgcagattcggctactttcgtgttgggtatg
tttacgtcgaaaggtgttcttaatcctacccgctttgtgcgtattttatggggtgtgttg
caattattgatggcgggagtgctgctgcttagtggggggctgctggggttgcggacgatc
tctattgtgacggcttttccttttatgctgctgatggtgttaatggcttattcgctttat
cgagatttgtctttggaatggcagcgaaggcaaaaaaatgacaaccttttgcatgagcgg
attgagtcgatgttgttacgagagtccgaaagagaagccgcgcgacaggcggaagaaaat
gctcacccctcggcgccagaacctacagaagacgctgatgttggagaagctgtagaacat
aaggaaggggacaaaattggtaactag
DBGET
integrated database retrieval system