Shewanella psychromarinicola: EGC80_06370
Help
Entry
EGC80_06370 CDS
T09848
Name
(GenBank) MFS transporter
Organism
spsr
Shewanella psychromarinicola
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MFS_1
Sugar_tr
YajR_YAM
MFS_1_like
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZG34583
UniProt:
A0A3N4DV58
LinkDB
All DBs
Position
1472763..1474130
Genome browser
AA seq
455 aa
AA seq
DB search
MASNGLSGLEKKVAFSLAGVFGLRMMGLFMIMPVFALYGQHLEGFSPLWVGIAIGAYGLT
QAFLQIPMGILSDKYGRKPIILGGLVLFAIGSLIAASSDHIYGVVFGRAVQGMGAIAAAV
LALAADLTRDEQRTKVMAVIGMCIGFSFALSLLVGPIVAQYLGLTGLFLLTAVLAVLGML
IVQFFVPNPISQAPKGDTVATPTKLKRMLFDPQLFRLDAGIFILHLVLTAVFVALPLDLV
DAGLVKEKHWMLYFPAFVGAFFLMVPLIIIGVKRNNTKTMFQLSLMIMMVSLSMMGFYAD
NIWVLSGAVVLFFTGFNYLEASLPSLIAKFCPVGDKGSAMGVYSTSQFLGAFCGGMLGGG
AYQLVGASGVFFVALGLMCVWLFLTIGMQKPVLLKSYTLEATVKDKSDAQNMASKLSQLI
GVVEAIVVLEEKAAYLKVDDKFNLSEARAVLGSVD
NT seq
1368 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggccagtaatggactgtcaggtttggagaaaaaggtcgcattttcgttagccggagtg
tttggtttacgaatgatgggattgtttatgattatgcctgtcttcgcgctgtatggtcag
catttagaaggcttttcaccgctgtgggtaggtattgccattggtgcttatggattaacc
caggcttttttacagatccctatgggtattttgtccgacaaatacggacgtaagccgatt
attctcggtggtttagtcttgtttgcgattggtagtttaattgccgcatcgtctgaccac
atttatggcgtggtatttggccgtgcagtacaaggtatgggagccattgctgcagccgtg
ttagcccttgccgccgatttaacccgagacgaacaacgcactaaagtgatggccgtcatt
ggcatgtgcattggtttttcattcgccttgtcattattagtcggaccgattgtggcgcag
tatttaggcttaacaggcttgtttttgttaaccgcagtattagccgtattgggtatgtta
atcgtgcagttttttgtgcccaatccaattagccaagcgcctaaaggtgatacggtagcg
accccgacaaaacttaaacgtatgttgttcgatccacaattatttcgcttagatgcaggc
atttttattctgcatttagtgctcaccgcggtgtttgtcgccttaccattagatttggtt
gatgcgggtttagtcaaagaaaaacattggatgctgtactttcccgcgtttgttggggcc
tttttcttaatggtgccgctgatcatcattggggttaaacgcaacaacaccaaaaccatg
ttccaattgtcgttgatgatcatgatggtgtcacttagcatgatggggttttatgctgat
aatatttgggtgctcagtggcgccgtagtattatttttcactggctttaactaccttgaa
gcatcactaccgagtttaattgctaagttttgtcctgtaggtgataaaggttcggccatg
ggcgtgtattcgaccagccagtttttaggtgccttttgcggcggcatgttaggcggcgga
gcctatcaactcgtcggcgcatccggggtgttttttgtcgcactaggactgatgtgtgtg
tggttattcttgaccataggcatgcaaaaacctgtactattgaaaagctatacccttgaa
gctacagtaaaagataaatccgatgcacaaaatatggccagcaaattgtcgcagttaatt
ggcgtcgttgaagccattgtggtactcgaagagaaagcggcttatttaaaggtcgatgat
aaattcaatttaagcgaagcgcgagctgtgttaggctctgtagattag
DBGET
integrated database retrieval system
