Streptococcus pseudoporcinus: NCTC13786_00405
Help
Entry
NCTC13786_00405 CDS
T07156
Symbol
sclB
Name
(GenBank) collagen-like surface-anchored protein
Organism
spsu
Streptococcus pseudoporcinus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
CFSR
Gram_pos_anchor
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
VEF93124
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(405403..406938)
Genome browser
AA seq
511 aa
AA seq
DB search
MTDMKKNAADKQGFAQPKYRLGAASVLLAAVCAIGLQSNTAHALVPGAPGFGPGVSPHPY
IYPEIEVGPFSGSYPDYGSYGYGPYGGSGYIFVPGPQGPSGPPGVPGPQGNPGLAGARGP
IGPKGEPGLPGQTGPSGPQGRDGAAGQPGKNGAPGVAGRDGADGRQGDPGKPGRPGNNGA
PGADGRDGAPGKPGKPGKPGQKGADGQDGVDGKDGKNGRNGQKGQDGKDGVDGRHGRDGK
NGTDGAKGRDGKNGKNGTAGRNGRDGKDGQHGTDGAAGRNGRDGAKGRDGKDGRKGQDGQ
HGTDGADGRAGLDGRHGRDGRDGRNGLDGVDGRDGQSPLIKTKDHSDGSHSLYILNPDGT
KYEITLRDGKDGEPGKDGRDGKDGKDGQPGAPGRDGKDGAAGRNGRDGKDGAAGAPGRNG
RDGQDGQPGRDGMNGQNGHHAPANNGQGNGAGMPVALNAPVAVAAANGQGQMASQELPST
GDNVNPFFTAAALAVMAGAGVVATGFKRKKD
NT seq
1536 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacagacatgaagaaaaacgctgctgacaagcaaggttttgctcagcctaaataccgc
ttgggagcagcttcagtcctcttagcagcagtatgtgctatcggattacaaagtaacaca
gcacatgctcttgttcctggtgctccgggattcggcccaggagtaagtccacatccatat
atttaccctgagatagaagtaggaccattcagtggttcatatccagactacggtagttat
ggttatggtccatatggtggttctgggtatatttttgttccgggcccacaaggaccttca
ggacctccaggagttcctgggccacaggggaatccagggcttgcaggagcacgaggtcca
ataggtcctaaaggggaacctggattaccaggccaaactggaccttcagggcctcaaggt
cgagatggtgcagccggtcagccaggaaaaaatggagctcctggtgtagcaggtcgtgat
ggcgctgatggtagacaaggagatccaggaaaaccaggcagaccaggaaataatggagct
ccaggtgctgatggccgcgatggtgctccaggaaaaccagggaagccaggtaaaccgggt
cagaaaggagccgatggtcaagatggtgtagatggtaaagatggtaagaacggtagaaat
ggccaaaaaggtcaggacggtaaagacggcgtagatggacgtcatggtcgcgatggtaaa
aacggtactgacggagctaaaggccgtgatggtaaaaatggaaaaaatggtacggcaggc
cgtaacggtcgtgatggaaaagatggccaacacggtactgatggtgcagcaggtcgtaac
ggtcgtgacggcgctaaaggccgtgatggaaaagatggacgtaaaggtcaagatggccaa
catggtactgatggtgcagacggccgcgcaggtttagacggccgtcatggtcgtgatggc
cgcgatggtcgtaatggtttagatggtgtcgatggccgtgatggacaatctccacttatt
aaaaccaaagatcattctgatggtagccattctctctatatcttaaatccagatggtact
aagtatgaaattactcttcgtgatggaaaagatggtgagccaggtaaagatggtcgcgat
ggaaaagacggtaaagatggtcaaccaggtgcaccaggccgtgacggtaaagacggtgca
gccggtcgcaacggtcgtgacggtaaagatggtgcagcaggtgctccaggtcgcaacggt
cgcgatggtcaagatggtcaaccaggccgtgatggcatgaatggtcaaaatggtcaccat
gcgccagctaataatggtcaaggcaatggagctggtatgccagtagcccttaatgcgcca
gtagctgtggcagcagcaaatggtcaaggccaaatggctagccaagaattgccttcaaca
ggcgataacgttaacccattcttcactgcggcagctctagctgttatggcaggtgcaggt
gtggttgctacaggcttcaaacgcaaaaaagactaa
DBGET
integrated database retrieval system
