Shewanella psychrophila: Sps_02402
Help
Entry
Sps_02402 CDS
T05063
Name
(GenBank) PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase
Organism
spsw
Shewanella psychrophila
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HATPase_c
Response_reg
PAS_9
HisKA
PAS
PAS_4
SPOB_a
PAS_8
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AQS37556
UniProt:
A0A1S6HPU2
LinkDB
All DBs
Position
complement(2746880..2748922)
Genome browser
AA seq
680 aa
AA seq
DB search
MDSTVFKEFSQTDINPFWPRLLAELGKLQANFINGEDILLPLCRILAEVSQSQAVMIIPK
DSLDCDDMPASATCWCRDPVRYLTLWKEAKAWPFFNQEPMVHRWQSFVIWPAKRVNIQIF
FHSSSDQWLSFLLSSGDLLSDIVMGMLVQQTLEWQERGRDRGVNSVDSEMFQSIVSNSED
LILVASRSPFGVPSIMYANAAATSISHYPRSQLIGKPITLLFQEELNPSAAGGQESELLQ
AINSRREFDGELICSKADNETAVLHMHLVALEEHSEHGSLFALVGRDITDHKQLQQIMAR
TKKMQAIGQLVGGIAHDFNNILGVLKGNLELMEIKTSEEKIARYLATAFKACQRGTDLTR
RLLQFSRQEQFSANLYQVNDVIEGIEELIGKSLTTQVNLILEPGEELDQILVDRGDLEDA
LLNLVLNARDAMGGEGKITIRSGREALEGLLPGLSGRPMVESGDYITVSVLDTGTGIAPH
LLEKIFEPFFTTKDKSDGTGLGLSMVYGFVKRSNGYMSVMKSDCSGTEFRLWFPVAKQKG
RQVQGVVERPEALKVSQKLKVLIVDDEVDLLSVLQDYCEILGMEVEAYSDPLIVREKYKE
GLNGIELLITDVLMPGGINGYELAKELCAKEDIAVLLISGFIGDIGLTSNEEMPYQVLHK
PFSIDGLVGALQQVGINFSQ
NT seq
2043 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggactctacagtgtttaaagaattctctcaaactgacatcaatcccttttggcctagg
ctattggccgagctcggaaaactacaagcaaatttcatcaatggcgaagacatactgctg
ccgctgtgccgcatattagcggaagtcagccaatctcaagcagtcatgattattcctaaa
gattcactggattgtgatgatatgcccgcttctgcaacatgctggtgtcgagatcctgtt
cgctatttaactctatggaaagaggcaaaggcttggccgtttttcaatcaggagcctatg
gttcatcgttggcaatcttttgtcatctggcctgcaaagcgagtcaatatacagatattt
tttcattcatctagcgatcaatggctgtcatttctattaagctcaggcgatctcttgtca
gatattgtcatggggatgttggtacagcagactcttgaatggcaagagagaggcagagac
agaggtgttaactcagtagatagcgagatgttccaatctatagtcagtaacagtgaagac
ttaattctagtcgccagccgttcgccctttggagtgccgagtatcatgtacgcgaatgcg
gcggcaaccagcatcagccattatccacgcagtcagcttataggaaaacccatcacactg
ttatttcaagaggagctgaatccatccgctgctggtggtcaagagagtgagctgctacaa
gcgattaattcgcgacgtgagtttgatggagagctcatttgtagtaaggccgataacgag
actgctgtgctacatatgcacttggtcgcgctggaagaacacagtgaacatggcagcttg
tttgcgctagtcggcagagatattactgaccacaagcagcttcagcagatcatggcgcga
acaaaaaaaatgcaggctataggacagttagtcggtggtatcgcccatgattttaataat
attctgggagtgttgaagggcaatttggagctaatggagattaaaaccagtgaagagaaa
attgcccgctatcttgccactgccttcaaagcatgccagagggggacagacttaactcgg
cggttattacagttttccaggcaggaacaattcagtgccaacctgtatcaggttaatgat
gttattgaaggaattgaagagctgataggtaaatctttaaccacacaagtaaacctcata
ttagagcctggagaggaactggatcaaatactcgttgatcgtggcgacctagaagatgcg
ttattaaatcttgtcttaaatgccagagatgccatgggaggcgaggggaagataaccata
cgtagcggcagagaggctttggaagggcttctgcctggcttaagcggtcgccctatggtg
gaatctggtgattacattactgtgtctgtattagatacaggaacaggtattgctcctcat
ctattagagaaaatcttcgagcctttcttcaccacgaaagataaaagcgatggcactggt
ctcggactctctatggtttatggttttgtgaagcgatctaatggctatatgagtgtgatg
aaatcagattgttcaggtacagaattcaggctctggtttcccgtggctaaacagaagggg
cgacaagtacagggcgtagtcgagaggcctgaggcgcttaaggtatctcaaaagcttaaa
gtccttattgtcgatgatgaagtagatttgctgagtgtcttacaagattattgtgagatc
ttgggtatggaagttgaggcgtattccgatcctttaatcgtaagggaaaagtataaagaa
gggcttaatggcattgagttattgatcaccgatgtactcatgcctggagggattaatggt
tatgagctggccaaggagctctgtgctaaggaggatattgcggtactgcttatttctggg
tttattggtgatataggtttaaccagtaacgaggaaatgccctatcaggtgttgcataaa
ccgttttctatagatggtttggtaggggctctgcaacaggttggtatcaacttttctcag
tag
DBGET
integrated database retrieval system