Shewanella psychrophila: Sps_05217
Help
Entry
Sps_05217 CDS
T05063
Name
(GenBank) Repeat domain in Vibrio, Colwellia, Bradyrhizobium and Shewanella
Organism
spsw
Shewanella psychrophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
FG-GAP_3
FG-GAP
PliI
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AQS40286
UniProt:
A0A1S6HXH4
LinkDB
All DBs
Position
complement(5861503..5863128)
Genome browser
AA seq
541 aa
AA seq
DB search
MEKVRNSSSFLSMLAAPSVLALPVLLLPILAMASFGANSASKNSGVTLESHSVETSFKLT
HPILPANLLAASGKELVTFGVDDSRQKWLTVFSFDKQEGKYTESLKVKLPRELASFDLTG
RDNDRSSAGATKTDDVQQLMFLSSQHLIRFVPSDKLNPFHIVADISSMSLKHTPDYISGS
DFIRDLNGDGLDDIIISDFDGVELFIAQIDGSYHRQQLPIKPQVRLYNDGARYTQSKLYS
ADINLDGKPDIVKIGEGELEVYRQKESGHFDPIAKYSSVRLAISGLDWWNKRDAYGEQLD
QSDLVYRKVEELKDINNDGFTDMVVRYTKSSGVLDRVNDYEIYLGENIKGQLTFPKKPNS
VIRADGTLTGLEFIDIDGDNKDEVLVAGFDIGLSQIIGALISGNIDQDVYLFKMDENSRF
SDDANISKEVELSFSLTSGQSGSPVVKLADINGDGLQDLLLSDGDDTLQIFLGSDSGRLF
VKRSEKIRVQLPQDGGMVSSQDLNGDGKEDLIIKYGQQDDESLQNKFKVILANPSSETHL
P
NT seq
1626 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaaagtcagaaacagttcatcttttttatctatgctagcggcgccctccgtactg
gcattgcctgtactgctattgcctatattggctatggcatcgtttggcgctaattcggct
tctaaaaactcaggtgtaaccctcgagtctcacagcgttgaaaccagtttcaagctgact
catccaatattgccggctaatttactcgcggctagtggaaaggagctggtcaccttcggt
gtggatgattctcggcagaagtggttaaccgttttttctttcgataaacaagaaggcaag
tataccgagtctttaaaagttaaacttcctcgtgagcttgctagcttcgatttaaccggg
cgtgataacgatcgttcgtcagctggtgcgactaagaccgatgacgtgcagcagctgatg
ttcctgtctagtcagcatttaattcgattcgtccccagtgataaattaaatccctttcat
atagttgccgatattagctccatgtcactcaagcacacgcccgattacatcagtggcagt
gattttattcgtgatcttaatggtgatggcttagatgatatcataattagcgactttgat
ggagttgagctctttatcgcacaaatagatggcagttatcacagacaacaactgccgatt
aagccccaagtaagactctataatgatggtgctcgttacactcagtcaaaactctatagt
gccgacattaatctcgatggtaagccggatatcgtcaagataggcgagggggagctagag
gtatatagacaaaaggaatcgggccatttcgaccctatcgctaaatacagctcggtccga
ctggctatcagtggtctcgattggtggaataaacgagatgcttacggtgagcagttagat
cagagtgacttggtttaccgtaaagtagaggagctcaaagatatcaataatgatggtttt
accgatatggtggtgcgttacaccaagagctccggcgtgctagatagggttaatgattac
gagatctatctcggtgaaaacatcaagggacagctgacgtttccaaagaagcctaatagc
gtgatccgcgccgatggcaccctaacggggttagagtttatcgatatcgacggcgataac
aaggatgaggtactggtggcggggttcgatatcggcttatctcagatcataggtgcctta
atctcgggcaatatcgatcaggatgtgtatttgtttaagatggatgagaatagccggttc
tccgatgatgccaatataagcaaagaggtggagttgagttttagtctaacctcaggccaa
agtggcagtcctgtggtcaagttggcggatattaacggtgatgggttgcaagatctgctg
ctgtctgacggggatgatactttacagatatttctgggtagtgacagtggcaggcttttc
gttaagaggagcgaaaaaattcgtgttcagctgcctcaagatggcggtatggtatctagc
caagatttgaatggcgatggaaaagaggatctcatcatcaagtatggtcagcaagatgat
gagtcactacaaaataaatttaaggtgattttagccaatcccagctcagagactcatctt
ccatga
DBGET
integrated database retrieval system
