KEGG   Shewanella psychrophila: Sps_05340
Entry
Sps_05340         CDS       T05063                                 
Name
(GenBank) PA14 domain-containing protein
  KO
K12287  MSHA biogenesis protein MshQ
Organism
spsw  Shewanella psychrophila
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:spsw00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02044 Secretion system [BR:spsw02044]
    Sps_05340
Secretion system [BR:spsw02044]
 Type II secretion system
  MSHA pilus biogenesis protein
   Sps_05340
SSDB
Motif
Pfam: DUF6701 PA14 DUF7305 GLEYA
Other DBs
NCBI-ProteinID: AQS40409
UniProt: A0A1S6HY29
LinkDB
Position
complement(5999450..6003754)
AA seq 1434 aa
MINTIKHLFIVALLFIFADSFSTAEATDWSQTFIEGANSYDNDGEIKFESSARLNNAPQN
GQLPAPKVDDSDKACYPDGGNAKKCKKSNQLAQLPAERVSFSQCKSSSNNNIGPPSNSNP
SIDVPEGEYGDVKLEGGSNRTIRFTTEDGIYKLKTLQAKSGRLELSSGQYWIGDLEINQG
VTVVFPATGTVSFFIEGGYDIVNGDSPADPTRFLIYSYDDIKLMGGVNLNAYLVGEDDVL
LEGSSTLNGAVTSEEIELKGGAVINFINRTDEIDVIPDCNAEPVLPVVPLQCPAEQAGVA
GITYRTYDATNWKPGQYTSPVDHDDFNDLVARVKTTINQLGESIESRIEGYGVNISPHSN
QGDNYAGIFEGYLDVPETGNYTFGIDGDDSIELLIDDQVVVGFYGLHGQCGWPCRTGDIA
LAQGTHKIEMRFHEATGAEAYHLYWQPPSASSLVKVPESAYLTCPFPQFEFGRVSLSSGS
AVINFENSYATAPVVMLMPTIDGATPTNDGPSSVRLVSSSATTVNISQNDPPGNRVSADD
MPEVDYFVMESGYRFLAQGKALQAGKIETEKYQGKRLPSSGRGYEDVSFWHKFGAKPAMV
GQTLTRENNRFITTVINNVSSQGDEFDIAIEASEVNGSITQDETLGYVAGLGSGSLQVNG
EVILYEFDYALNHSAGGSTRTLTQQCAYSTNYENSYPSQPYLIANKNSRRGGDGGWIRRC
RQENFANSVSFVVDEDQLLDAERNHLAEDIGYFAFEAVAEPPATNHYRIQFSSDALSCTA
KNITVKSCANDDCSTLSSVSSSVELTKDGVKYSDVSFTGETDTELWHGEGGLTTVGLGAT
SPVGPYRCYIDGSLVENSACTLNFDEAGFIVNIDNFLSNKPQQNIEISAVKKSYSSPQCV
PTFANISKTVNFWSEYVSPSSVLNAKSVSVNSTNVGKSALSATPLPLTFDSQGKATIEMN
YADAGKIALHAKYTAAPGDDDEGLVMEGSDNTVRYPVGLCIKPETTCITGSCPAFKVAGE
TFDMSIQAMAWQSGSDTDFCDNEPTDNYVQSGITLGREIQKPSVADGGTEGVISKLSYAH
GAAIDSLNTVSQSISEIGIFKFTATPPVKYLDENINIPAAMSDPVGRFYPNDFEVYGESM
LAACVAGGTAFSYMDEPVALTMNIRARNLSGSTTQNYFGDFASGTALLVGEDSNAGVDYQ
ARFTGLASLSWEKEDLGIQAINSNILFTRLLNSAVDGPYTSMEIGLQMSDDDGVLIDSPN
MNATTIGDCSTAASCNAKRISTQHYRHGRIVLENAYGPEADILRMPARAEFWDGSQWVVN
TIDSCSDVVSAALPATGVDYAPALDVGQTVTRIGGTNSLANSDFSQGRFELLWQSLIATP
NRYRGQVTSPLAVPDWLQWYWNWDNDGALSDPRASAFFGTYRGHDKVIYWREVN
NT seq 4305 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
gtgattaataccattaagcacctatttatagtcgctttactgtttatttttgcagatagt
ttttcaactgctgaggccacggattggagtcagacctttattgaaggcgctaactcatat
gataatgatggggagatcaagtttgaaagctcagcgaggctgaataatgcccctcaaaat
ggccaacttccagcgcctaaagttgatgacagtgataaggcttgttatcccgatggcggt
aatgctaaaaagtgtaaaaagtcgaatcagttggcccaacttccagctgaaagagtgagc
ttttctcagtgcaaatccagcagtaataacaatataggcccgcctagtaatagcaacccg
agcatcgatgttcctgaaggggagtatggcgatgtaaagttggaagggggctccaataga
accatacgctttactactgaggatggtatatacaagcttaaaacattgcaggctaagagt
ggtcgcctagagctatcttcgggtcagtattggattggggatttagaaattaaccaaggg
gttacagttgttttccccgccacaggaacagttagcttttttatagaggggggctacgac
atagtaaatggcgattcccctgcagatcctactcgatttttaatttattcctatgatgat
atcaaactcatgggaggcgttaatctaaatgcataccttgttggtgaggacgatgtttta
ttagaggggagctcaacgcttaacggcgcagttacgagtgaagagattgaattaaaaggt
ggcgcagtgatcaattttattaatcgtacagatgaaattgatgttattccagattgtaat
gcagagcctgtattaccggttgtgccattgcaatgcccagcagaacaagctggagttgct
gggataacttatcgtacttatgacgcgacaaactggaagcctgggcaatataccagtccg
gtcgatcacgatgactttaatgaccttgttgctagggttaaaaccacgatcaaccagcta
ggtgaatctatagagtcacgaattgaaggatatggtgtcaacatcagtccccattctaat
cagggggataactatgcaggcatctttgaaggttacttagatgtgcctgaaacgggtaat
tatacctttggcattgatggtgatgattcgatagagctcttgattgacgatcaagttgtg
gtcggattttatggtctacatggccaatgtggttggccgtgtcgaaccggagatattgca
ttagctcagggaacacataaaatcgagatgcgttttcatgaagctactggtgctgaggcg
tatcacctgtattggcagccaccttcggcatcgagcctagtaaaagtacccgagtcggca
tatctaacctgcccatttcctcaatttgaatttggtcgggtcagtttgagcagcggcagc
gctgtcattaattttgaaaatagctatgcaacagcacctgtggtgatgctgatgcctacc
attgatggagcaactcccaccaacgatggcccttctagcgtaaggctagtttcgagtagt
gctactactgtgaatatctctcagaatgacccaccgggtaaccgagtatcggccgatgat
atgcctgaggtggattattttgtgatggagtctggttatcgtttcttagcgcagggcaag
gcgctgcaagcgggaaagatagagacggaaaagtatcaaggtaagcgattgccttcttca
ggaagaggatatgaagatgttagtttctggcataagtttggcgctaagcctgctatggtc
ggacaaacgttaacacgagaaaataatcgatttattaccactgtgataaataatgtgagt
tcacaaggtgacgaatttgatattgccatcgaagcatcagaggtgaatggttcgataact
caagatgaaaccttaggttatgttgccgggttaggttcaggctccttgcaagtcaatggc
gaggtcatcttgtacgagtttgactatgcactcaatcacagtgcggggggcagtactcgc
acactgacgcagcaatgtgcttattcgacgaactatgaaaacagctacccaagtcaacct
tacctaatcgcaaataagaattcacgtcgtggaggcgatggtggttggatcagacgctgc
cgccaggaaaattttgctaactctgttagctttgtggttgatgaagatcaactgttggat
gcagagcgcaatcaccttgctgaagatattggttactttgcctttgaagctgttgcagag
ccaccagcgacaaaccattaccgtattcagttctcgtcagatgccctaagttgtacggca
aaaaatatcacagttaagtcttgtgccaatgatgattgcagcaccctaagttcagtctct
tcgtcggttgaacttaccaaagatggtgtgaaatacagtgatgtcagttttaccggagag
acggataccgagctttggcatggggaagggggcttaacgactgttggtcttggcgctacg
tcacctgtaggaccataccgctgttatatcgatggcagtttagttgagaattcagcttgt
acactaaactttgatgaggcaggttttattgtcaacattgataacttcctctccaataaa
cctcagcagaatattgagatttctgctgttaagaagagctactctagtcctcaatgtgtg
cccacgtttgccaatatcagtaagacggttaatttctggagtgagtatgtgagcccctca
agcgtgctcaatgctaaatccgtttcagttaatagcaccaatgttggtaagagtgcctta
agtgctacgccgctgcccttaacatttgacagtcagggtaaagcaaccattgagatgaat
tatgccgatgcgggtaaaatagccctccatgccaaatatacagcagcgccaggtgatgat
gacgaaggtttagtgatggaaggatctgataataccgtgcgttaccctgttggtctgtgc
attaaacctgagactacttgcataactggttcctgcccggcatttaaggttgccggtgag
acctttgacatgtcgatacaggcgatggcttggcagtcaggcagtgatacagacttctgt
gataacgaaccgacagataactatgtacagtctggtattacgttaggcagggagatacaa
aagccaagtgttgctgatggaggcaccgaaggagtgatctcaaagctttcatatgctcat
ggagctgctatcgacagtcttaatactgtttcgcagtcgatcagtgaaattggaattttc
aagtttaccgcgacaccgcctgtgaaatatttagatgaaaacatcaatatccctgctgct
atgagtgaccccgttggacgtttctaccccaatgattttgaagtctacggagaaagtatg
cttgcggcgtgtgttgcgggagggactgcattttcctacatggatgagcctgttgcacta
acaatgaacattcgagcaagaaacctaagtgggtcaacaacacaaaattactttggcgac
tttgcatcaggaacagcgttgcttgtcggcgaagacagtaatgcaggcgtggattaccaa
gcgaggtttacaggattagcctccttgagctgggagaaggaggatttaggaattcaggcc
attaatagcaatattctatttactcgtctgcttaatagcgctgtagatggcccttatacc
tctatggaaataggcctgcagatgagtgacgatgatggcgtgttgatcgactcaccgaat
atgaatgcgaccactattggtgattgttctacggcagcaagttgtaatgctaaacgaatc
agcacgcaacattatcgccatggtcgtatcgtattagaaaatgcctacggtccggaagcc
gatattttaagaatgcctgctagggcagagttctgggatggatcccagtgggtggttaac
acaatagatagctgtagtgatgttgtttcagctgcacttcctgcaacgggtgttgattac
gcccctgccctcgatgtgggtcagacggttacgcgaattggggggactaactctttggcc
aatagtgatttctctcaaggtcgattcgagctattatggcagtctttaatcgcgacgccg
aatcgttatcgaggtcaggtgacttcacctcttgcggtgccagattggctgcagtggtat
tggaattgggataacgacggtgcgctttcagatccaagagccagtgctttctttggcact
tatcgtggtcacgataaagtgatctattggcgggaagttaattag

DBGET integrated database retrieval system