KEGG   Sporosarcina psychrophila: AZE41_09655
Entry
AZE41_09655       CDS       T04327                                 
Name
(GenBank) Swarming motility protein SwrC
Organism
spsy  Sporosarcina psychrophila
SSDB
Motif
Pfam: ACR_tran SecD_SecF_C Sigma70_r3 DUF7713
Other DBs
NCBI-ProteinID: AMQ06168
LinkDB
Position
2017617..2020703
AA seq 1028 aa
MKGLVNFVLKNKLAVWLLTIIIVVSGIYSSTQMKTETLPDISIPYLMVMGVYPGATPEQV
MKDVSIPLEKAVDNLEHVKAVFSNSYSNMSSIQVEYEYGIDMEEAKRALTSALDAVSLPE
GAQAPTITAISMNMMPVVALSVSSQTEDIVELTSTVEEILLPKIEKIDGIASATIAGQHI
EEVQLTYKDEEMAALGITPDTVKQMIEASDLAVSLGLYEFEEGEQAVSVDGKFMTADELK
EMLIPVTPSATNTAPFVKLSDIATIDVVGREESVSRTNGENAIAIQIIKGQQANTVDVVN
AVKDLIKEEQKTIDGLVIDVSLDQGAPIEASVSTMIEKALFGGLIAILIILLFLRDFKST
IISIISIPVSIFMALLLLNWLGITLNIMTLGAITVAIGRVIDDSIVVVENIYRRLHLKTE
KLSGRALVREATIEMFKPIMSSTLVTVAVFAPLIFVGGMVGELFLPFALTMTFALVASLI
VAITIVPALSHFLFKKKLYSEKTESRHKEVGKLATWYKGVLGWTLNHKVITSLIAVVMLA
GSVALTPLIGFSFMGSEEEKVMYLTYTPETGELMEDTLANIEIVEQKLLKNKDIDIVQLS
VTDSGDAMSAMMGGGSGGALMYLIFDPDMKNFAEARTEIEDYVFDIGQSGEWKSQDFTSM
SMPTGGVSYTFYSENLDKLNEAVKMVEGVINENDRLEDVSSSAKDAYVEYKFKVEQDELL
QYGLTTGQIVMMLNPMRTNDVLTTVEKDKNTLEVIVQQEEAVQPKSIDDLLATEIPTALG
TTMKLSELVTVEEGTTLNALARSQGEYYATVSGTIIDADISKATSEVDKAIDKLDLPKGV
TVGVAGVAADMTETFTQLIVAMLAAVAIVFFILVVTFREGVAPFAILVSLPFAVIGSFVG
LLIAGETISVSVMMGLLMLIGIVVTNAIVLVDRIIRMERSGLKMREAVLEAGVTRLRPIL
MTAIATIGALIPLAIGSGGGGGLISKGLGITVIGGLISSTLLTLIVVPIAYELLSKLFKK
NRKEIEED
NT seq 3087 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaagggttagtcaattttgtcctaaagaataaattagcagtatggctacttacaatt
atcattgttgtatccggtatatattcaagtacacaaatgaaaacggagacgttgccagat
atatcaattccttacttaatggtaatgggtgtctatcctggagctactccagagcaagtg
atgaaagatgtctccattccattagagaaagcggtagacaatcttgaacatgtgaaagcc
gttttttcaaattcttattctaatatgtcaagtattcaagtggaatacgaatatggcata
gatatggaagaggcgaaacgtgcattaacttccgcactagatgcagtgtctttaccagaa
ggagcacaagcgccaacgattacagcaattagcatgaatatgatgccggttgtcgcacta
agtgtaagtagtcaaacagaagatattgttgaattaacgtcaacagtagaggaaatacta
cttccgaaaatcgagaaaatcgatggaattgcatctgcaacgattgcaggtcagcatatt
gaagaagtgcaacttacgtataaagatgaagagatggctgcactgggcataacgccagat
acagtcaagcaaatgatcgaagcaagtgatttagctgtgtcactgggtctttacgagttt
gaagaaggtgagcaagctgtttcagtagacggcaagttcatgactgctgatgaattaaag
gaaatgcttattcctgtaacaccatccgcaacaaacacagcaccatttgtgaagcttagc
gatattgctacaattgatgtcgtaggtagagaagagtcggtttcacgtacaaacggtgaa
aatgccattgccattcaaattattaaagggcaacaagcaaacacagttgatgttgtaaac
gctgtgaaggacttaattaaagaagaacagaaaacaatagacggtcttgtcatcgatgta
tcacttgaccaaggtgcgccaattgaagcttcagtatcaacgatgattgaaaaagcgtta
tttggtggtttgatcgccattttaatcattcttctgttccttcgtgatttcaaatcaaca
attatttcgatcatatccattccagtttcgattttcatggctttactgttactaaactgg
ttgggtattacgttaaatattatgacgcttggtgcgattacggttgccatcggacgtgta
atcgatgactcgattgtcgtcgttgaaaatatttatcgtcgtttgcatttaaaaacagaa
aaattatcaggccgggcacttgtgcgtgaagcgacgattgaaatgttcaaaccaatcatg
tcttcaacattagtgacagttgcggtatttgcgccacttattttcgttggtggtatggtc
ggtgagctattcttaccatttgcattaacaatgacgtttgcgcttgttgcttcgttaatt
gttgccattacaattgtacctgcattatctcacttcttatttaagaaaaagttatatagt
gagaagacagaaagccgccataaagaggtcggtaaattagctacatggtacaaaggtgtt
ctgggctggacattaaaccataaagtcattacttcactaattgctgtcgttatgttggca
ggcagtgtggcattaacgccattaattggttttagctttatgggtagtgaagaagaaaaa
gtgatgtacttaacgtacacgccggaaacaggcgagctaatggaagatacgttagcaaat
attgaaattgtagaacaaaagttattaaaaaataaagatattgacattgttcaactatct
gttactgattccggcgatgcaatgtccgcgatgatgggcggaggatctggtggcgcttta
atgtacctcattttcgacccggatatgaagaactttgcggaagctcgtacggaaattgaa
gactatgtgttcgacattggtcaatcaggcgaatggaagagccaagacttcacttcaatg
tcaatgcctacgggtggggttagctacacattctacagtgaaaatttagataaactaaat
gaagctgtaaaaatggtagaaggtgttataaatgaaaacgatcgcttagaagatgtttct
tcaagtgcaaaagatgcttacgttgaatacaaattcaaagtagagcaagatgaattactg
cagtatggcttaacaacggggcaaatcgtgatgatgctaaacccgatgcgtacaaacgat
gtattaacaacggttgaaaaagataaaaatacattagaagtaatcgtgcagcaagaagaa
gctgtacaaccaaaatcaatcgatgatcttttggcgacagagataccgacagcactcggt
acgacaatgaaactttctgagctggtaacagttgaggaagggactacgttaaatgcactt
gctcgaagccaaggtgaatattacgcaacagtttcaggaacaatcattgatgctgatatt
tcaaaagcgacatctgaagtagataaagcaattgataaacttgatttacctaaaggtgtt
acggtcggtgttgctggtgtggcagcggatatgacggagacatttacacaacttattgtg
gcaatgcttgcggcagtagcaattgtcttcttcatcctggttgtaacattccgtgagggc
gtcgcaccattcgcgattctcgtctcgttaccatttgcagtcattggttcatttgttggt
ttattaatcgcgggtgaaacaatctctgtatcggtcatgatggggctattaatgttaatc
ggtatcgttgttacgaacgcgattgtactagtagaccgtattatccgtatggaacgtagc
ggtttgaaaatgcgtgaagcagttcttgaagcgggtgtgacgcgtttacgtccaattctt
atgactgcgattgctacgatcggtgcactaattccattagcaattggatcaggcggcggt
ggcggtttgatctccaaaggtcttggtattacagtaatcggtggtttaatcagttcaacg
ttattgacactgattgttgttccgatcgcttacgaactattatccaagcttttcaagaaa
aaccgtaaagaaatagaagaagattaa

DBGET integrated database retrieval system