Strongylocentrotus purpuratus (purple sea urchin): 582487
Help
Entry
582487 CDS
T01019
Name
(RefSeq) fibrillin-2 isoform X1
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
spu
Strongylocentrotus purpuratus (purple sea urchin)
Pathway
spu04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
spu00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
582487
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
spu00536
]
582487
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
spu00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
582487
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
EGF
TB
hEGF
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
582487
NCBI-ProteinID:
XP_030833101
UniProt:
A0A7M7N9C6
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2839 aa
AA seq
DB search
MMRSSLLVLLACLSTVVVAQSNVINGPNVCGMRFYSYCCPGWRLHPRTKQCVVPVCNRPC
GSGYCQRPNSCSCPGGQISVSGCDGYSGGNPCTTQCLNGGSCQGNSCNCPNGFSGTNCGM
PTCNPPCQNGGECSGGNRCSCPPGFGGSQCQTDYRTGVCYLQSTSNGYCSAGVEGLHCTK
ALCCATIGQGWGDPCENCDTFDNPCDRGYILNGRTGQCIDADECLMIPGLCDGGQCTNTQ
GSYACQCPAGFELSMSTLSCVDMNECQTGYLCQNGRCINTQGSFRCDCNPGYFLGQDGHH
CTDIDTPNTPVTPEEIGYCYMRFRNRNSRGTSCSQELAVRMSFLDCCCSVDHAEGWGLSR
SDCSPCRTENEELYRRLCEGVGELTTPQPRRTPNPQTRTDGPGVVTLTPPTVTPPRKITP
RPEGICLMVPNICRNGLCVSLGGVMEYRCECFEGYENAGRYTCQDINECRDRSLCRYGAC
ENTDGSFRCVCPSGYKLSLDQRSCEDVDECRTNPNVCHHGTCMNIVGSHTCDCFEGYQKS
IDGRYCIDVDECTLGSHRCRNAECENLPGTYECICTEGYEAIGSSGVCIDVNECAQETNP
CPLGFCINTLGGYQCQCPVGYATGQDGTCVENRRGFCFLDGDLGRCTHQSMGQMTISSCC
CSAVLLQEALSWGPNCESCPPQGTLQFEQLCKHGTGWTSQRININECTLFNNLCDNGVCE
DLTGNYKCRCNSGFQPQADGKECIDENECSYNRLLCHNGACRNTPGSFVCECPDGYELDA
RSSVCQDVNECQNPSLCNNGRCINTRGSYRCECIYPGTELDPTGTICVDNRIATCWTRIS
NGQCEADIMGPMRRDECCSTFGRAWGSPCEACPLAFGDCPRGFSEINSECVDLNECELNP
MVCNNGLCENTMGSYRCVCEEGLTLDTSGRNCVDLRSYECFLDYSEGQCSSPIPGLYRNS
VCCCSLGYSYGDQGRCYECPQEGSVEFDVLCPRGRGFADTRPRPDLLDGTVYINDINECN
AYDGICKYGECTNIIGSYDCVCDVGFAMDEFGYQCVDIDECRITFGACGNGSCENTPGDF
RCNCYEGFEAHPVMRSCMDINECETVPGLCRGGSCTNLPGMFRCDCPLGQELTPDGQACR
DINECSISTGICSNGECHNIVGTYRCMCNPGFRPTANYRACEDMNECDMDNGGCDHNCVN
SQGSYECQCQSGYSLRVNGRTCVDIDECADNPDICGGGQCENQEGGYLCDCFVGFRPADD
FRSCLDIDECSTDAGVCVAGVCKNTRGSFTCQCFEGYSMKPGIPGCSDIDECMLQMHQCA
INSQCENTIGSFQCRCNPGFIVDENANICIDVDECESSNHDCHEDARCVNIPGSYQCQCN
QGFIGDGLSCIDVDECMQNQALCVNGQCINNPGGYVCECEMGFYPTERRDSCEDIDECSN
FPDICVFGQCINVPGTFRCECNPGYMLDIGGGNCTDVNECEDPGTYCVSGLCTNSMGSYV
CECPPNWVLSRDGTTCADVRTGLCYAHGPGAESRLDVNECSLLLGTSIPRTKCCCSELGK
GWGDPCELCPLVNTTEFFLLCPYGIGVHIDPNATRPVNEINQCRDFPNICRGGECQQVEG
SFRCVCPTGYEYDFEQMMCIDIDECQLSAYICGAGTCMNMEGSYTCMCPMGFMFMNMPTG
KNCMDIRELTCYMSYNQSAFPLPECGSPLMTSLTKKVCCCSALMASAWGTRQECSPCPAH
MTEDYYRMCGATSPGFVVNPETGLPEDVDECRLIDGICANGICVNTPGSFRCDCQPGYRA
NMATHICEDIDECFEGMHRCVGNSICRNTPGNHECICPPGYQLSVSRLSCDDINECLTRP
GTCINGQCTNQIGSFVCVCDQGFQLSADGTQCNDIDECFRFPDRCGNGTCQNVVGDFACS
CNRGFELTINGDCADINECATMQGTCPNGRCVNTPGSFFCDCVEGYVLSLSGLRCEDENE
CISRLNICQNGRCDNTIGSFRCSCFDGFQLSPSGQECIDTDECVIIPDMCRNGVCQNTQG
SFQCTCPPGYLLSSDGLICIDMRRSYCYNDFVGGQCTDARAGNATRKECCCSLGAGWSSP
CNLCPRPSDASFTELCPDGPGYAPSLTPDLYEDINECKVFPGICENGICINTDGSYRCQC
QPGFILDTTGRICVDRNECQENYNVCGFNSTCYNTLGSFECNCGEGYQVGRRGTCEDINE
CRRRRGQCAFRCQNLPGSFRCLCPNGYTLTDDGRHCRDLDECDTNLNTCRYRCKNLIGKF
MCQCDEGYTPIGGDGNNCRDINECITNHGVCQNGRCRNTEGGHTCICNQGFTLGPSGKDC
IDRRTGFCYAYVPPSGCESSQGGMQPVTMESCCCSGGRAWGSTCQICPVYGTIEYNRLCT
ATTPVDPCQIVQGLCENGHCLGGSGGYLCQCNPGYILSPDGTRCEDENECNRAPPPCSYQ
CKNTPGSFRCGCPQGYLLSEDGLTCREKDECSMGIHECQFECRNTLGGFRCVCPEGYIQH
GSTCIDVNECIQTPDICGAYGTCQNTQGGHRCECQRNFRPDPSTNTCVDINECEDQPDIC
QYGCQNTIGGYRCVCPDGFEENFYGRCIDNNECRQSGKCGQATCYNTQGSYQCGCNNGYA
FDQQNLACNDVNECQGSYGNTNSPCQYSCDNTDGSFSCGCPPGYTSVVQGACVTDRDSVQ
PCYSCNRQPRQRRSATETNDKESTLISNNTAILYHIPLSKAVPKQQIAKFKTGYTRIVAR
YEYVILSGNEDNIFMMKKKSDGMSLLRFSKHVKATGLYELEIEGVLKRKNDTILAEVQTV
VEEPVAMQIQVQIVADEEE
NT seq
8520 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgcggtcatctttacttgtgctcctggcgtgtctgtcgaccgtcgtagtcgctcag
tcgaatgttatcaatggcccgaatgtttgtggtatgagattctattcatattgttgccct
ggatggcgccttcatccaagaacgaaacagtgtgtggtccctgtttgcaatcgtccatgc
gggtcgggttactgtcagcgtccaaactcctgctcctgtccgggtggacagatctcagtc
agtggatgcgatggctactctggtggaaacccatgtactacgcagtgtttaaatggaggg
tcttgtcaagggaactcctgcaactgtcccaatggattctcgggaactaattgtggcatg
cccacgtgcaatccgccctgccagaatgggggtgagtgcagcggaggaaacaggtgttca
tgccctcccggttttggtgggagtcaatgccagacagactacaggacaggcgtgtgctac
ctccaatcaacaagcaatggctactgttctgccggagtagaaggcttgcattgcaccaag
gcattatgctgtgctaccatcggccagggatggggggacccatgtgaaaactgtgatacc
tttgataatccatgcgacaggggttatattctcaatggacgaactggacagtgcattgat
gctgatgaatgcttgatgatcccaggtctctgtgatggaggtcaatgcactaacacccaa
gggtcatacgcctgccagtgtcccgcaggctttgaactgagtatgagtactctatcgtgt
gtagacatgaatgaatgtcagacaggttacctatgtcagaatggacgctgcatcaacaca
caggggagcttcagatgtgattgtaatccgggatatttcttgggtcaagatggtcatcac
tgcaccgatattgacaccccaaacacccctgtcactcctgaagagattggttactgctac
atgaggttccgtaacaggaactctcggggtacctcctgcagtcaagagttggctgtgagg
atgagcttcctcgactgctgttgctcagtggatcacgccgagggctggggattgtcaaga
agtgactgcagtccatgccggacagagaatgaggagctttaccgaagactgtgcgaaggt
gtaggagaacttaccacaccccagccgaggagaacgcccaacccacagaccaggaccgat
ggacctggagtggtaacactgaccccacccacagtcacccctccacgaaagatcacgccc
cgccctgaagggatctgtctcatggtgcctaacatatgtcgcaatggtctgtgcgtgtcc
ctggggggagtcatggaatatcgttgtgaatgctttgaggggtatgagaatgctggcagg
tacacatgccaagatatcaacgagtgccgagacaggtccctgtgtaggtatggagcttgt
gagaacacagatgggagcttccgttgtgtgtgccccagtggatataagttatctctcgat
cagaggtcatgcgaagatgtggatgaatgccgtaccaaccctaatgtgtgccaccacggt
acatgtatgaacattgtcggctcccatacatgtgattgcttcgagggctatcagaaatca
atagatggacgttactgcattgatgttgatgaatgcacattgggctcacatagatgtagg
aatgcagaatgtgagaatcttcccggtacctatgaatgtatctgtactgaaggctatgaa
gctattggatcatcaggcgtctgcattgatgtgaatgaatgtgctcaggagaccaatcca
tgtcctctgggtttctgcatcaacacgttgggaggctatcaatgccagtgccctgtgggt
tatgcaacaggacaggatggcacctgcgtcgagaaccgtcgtggcttctgtttcttggac
ggagaccttggccgatgcacccaccagtctatgggtcagatgaccatctcatcctgctgc
tgtagtgctgtcctactccaagaggccctgagctggggaccaaactgtgaatcctgcccc
ccgcagggtacgctgcagtttgagcagctctgtaaacatggcaccgggtggacaagccag
agaatcaatatcaatgagtgcacactgttcaacaacctgtgtgacaatggcgtctgtgag
gacttgactggtaactacaagtgtagatgtaactctggattccagccccaagctgatggc
aaggagtgtattgatgagaatgagtgttcttacaacagactactctgtcacaatggtgcg
tgtagaaacaccccaggaagctttgtgtgtgaatgcccagatggctatgaattggatgca
aggagctcagtttgtcaagatgtcaacgagtgtcagaatccaagtctttgcaacaatggt
cgctgtatcaacaccagagggagctatcgatgtgaatgtatctatcccggcactgaatta
gaccccactggaaccatttgtgtcgataaccgcattgccacttgctggacccgcatcagt
aacggtcagtgcgaggctgacatcatgggaccaatgaggagagatgaatgctgctctacc
tttggccgagcttggggtagtccctgcgaagcctgccctcttgctttcggtgactgtcct
cggggcttctctgagatcaacagtgaatgtgttgatctgaacgaatgtgaactcaacccg
atggtgtgcaacaatgggctatgtgagaacactatgggctcctaccgatgtgtatgtgaa
gagggactcaccctggatacctccggaagaaactgcgtcgacctgcgttcttacgagtgc
ttcttggactactctgaaggccagtgttccagtcctatcccgggtctctacaggaactct
gtatgctgttgttcattgggctactcttacggtgaccagggaagatgctatgagtgccca
caggagggcagtgttgagtttgatgtcttatgcccaagaggacgtggttttgctgatacc
aggccgcgccctgatcttttggatggcactgtctacatcaatgacatcaatgaatgcaac
gcatatgatggaatctgtaaatatggagaatgcaccaacatcattggatcctatgactgt
gtatgtgatgtaggctttgctatggatgagtttggctatcagtgtgtggacattgatgag
tgtcgaatcacatttggtgcctgtgggaatggatcctgtgagaatactcctggagacttc
aggtgtaactgctatgaaggatttgaagctcatccagttatgcgctcatgcatggatata
aacgagtgtgagacagtaccaggtctctgccgaggtggctcctgcactaacttaccagga
atgttcagatgtgactgccccttgggacaagagctgacaccagatggacaggcttgtagg
gatatcaatgaatgctccatcagcacaggtatttgctccaacggtgaatgccacaacatc
gttggtacctaccgatgcatgtgcaatccgggattcaggccaacagcaaactacagggcg
tgtgaagacatgaacgaatgtgatatggacaatggtggctgcgatcataactgtgtcaat
tcacaaggaagttatgaatgccagtgccaatctggatattcattgagagtcaacggcaga
acatgtgttgatattgatgagtgtgctgacaaccctgatatctgtggtggtggacagtgt
gagaatcaagagggaggctacctatgtgattgcttcgtgggtttcagaccagcagatgac
ttcaggagctgtctagatattgatgaatgtagtacagatgctggtgtctgcgttgctggt
gtttgtaagaatacccggggttcattcacctgtcagtgctttgaaggatactctatgaaa
ccaggcattcctggatgctcagacattgatgaatgcatgctacagatgcaccagtgtgcc
atcaactcacagtgtgagaataccatcggctcgttccagtgtcgctgtaacccaggcttc
atcgttgatgagaatgctaacatctgtatagatgtggatgagtgtgaaagctccaaccat
gactgtcatgaagatgctcgctgtgtgaacatccctggctcctaccagtgtcaatgtaat
caaggattcattggagatggtctttcgtgcatagatgtggatgagtgcatgcagaaccaa
gccctgtgtgtcaatgggcaatgtatcaacaatcccggtggttatgtgtgtgaatgtgaa
atgggattctatccaaccgagcgcagagacagctgtgaagacattgacgaatgctccaac
ttcccggatatctgtgtgtttggtcagtgcatcaatgtaccaggaaccttccgatgtgaa
tgcaacccaggatatatgctggatataggaggaggcaattgcacagatgtgaatgaatgt
gaggaccctggcacatactgtgttagtggcctctgcaccaacagcatgggatcctacgtc
tgtgagtgtcctccaaactgggtgctatctcgtgatggaacaacttgtgctgatgtgaga
accggtttgtgctacgcccatggcccaggggcggagtctcgacttgatgtgaacgaatgc
agtctccttcttggtaccagtatcccaaggactaaatgctgttgctcagaacttggcaaa
ggctggggagatccatgtgagctgtgtcctctagtcaataccactgaattcttcttgctc
tgcccatatggaatcggtgtacatattgatcctaatgccacccgcccagtcaatgaaatc
aaccagtgccgggacttccccaacatttgtcgcggtggagagtgccagcaggtagaggga
tccttcagatgtgtgtgtcctacaggatacgagtatgactttgaacagatgatgtgtatt
gacattgatgaatgccagctgagtgcttatatatgtggagcagggacgtgtatgaatatg
gaaggcagttatacctgtatgtgtccaatgggattcatgttcatgaacatgcctacagga
aagaactgcatggacatccgagagttgacatgttacatgtcctacaaccaatcagcgttc
ccactgccagagtgtgggagtccattgatgacgagtctcaccaagaaagtgtgctgctgc
agtgcactcatggcttcggcatggggaactaggcaggagtgctctccttgtccagctcat
atgacagaggattattacaggatgtgcggtgcgacttcacctggctttgttgtaaatccc
gaaactggccttcctgaagatgtggatgagtgcaggcttatagatggtatctgtgctaat
ggtatctgtgtgaacacacccggaagcttccgttgtgattgtcaaccaggctacagggca
aacatggctacacatatctgtgaagacattgatgaatgctttgaaggcatgcatcgatgt
gtaggaaactccatctgtaggaacacacccggcaaccatgaatgcatctgtcctcctgga
taccaactttctgtttccagattatcctgtgatgatattaatgaatgcttgaccagacct
ggtacctgtataaacggccagtgcaccaaccaaattggctcctttgtgtgtgtctgtgac
caaggcttccaactctctgcagatgggacccaatgcaacgatattgatgagtgcttccgt
ttcccagaccgatgtggaaacggcacctgtcagaatgtggtgggagactttgcctgcagc
tgcaacagaggctttgaactcactatcaatggagactgtgcagatatcaacgagtgtgca
acgatgcaaggcacatgtcccaacggtcggtgtgttaacactccaggcagcttcttctgt
gattgtgttgagggatacgttctatctctatcaggactccgatgtgaagatgagaatgaa
tgtatctcgaggttgaatatctgccagaatggtcgctgtgataatactattggaagcttc
aggtgttcctgcttcgatggtttccaactttcaccttctggtcaagagtgtatcgatacc
gatgagtgtgtgattattcctgacatgtgtcgcaatggtgtttgtcagaacactcaagga
agtttccagtgcacctgtcctccaggctacctactcagcagtgatgggctcatctgtata
gacatgcgtaggagttactgctacaatgactttgtcggtggccagtgtactgatgctagg
gcaggcaatgccactcgtaaggaatgctgctgttctcttggcgctggctggagtagtccc
tgcaatctatgcccaagaccctcagatgcaagcttcactgaactttgccctgatggtcct
ggttacgcaccgagcttgacccctgacctctacgaagacatcaacgagtgcaaggtgttc
cctggaatctgtgagaacggtatatgtatcaacacagacgggtcctatcgttgccaatgc
caacctggattcatcctcgataccactggtcgcatctgtgtcgatcgcaatgagtgtcaa
gagaattacaatgtgtgtggcttcaattccacctgctacaacactctgggatcctttgaa
tgtaactgtggagagggataccaagtaggaaggagaggaacctgtgaagatatcaatgag
tgccgtcgaaggagaggccagtgtgcattccgctgtcagaacctgcctggatccttccgg
tgtctctgccctaatggatacaccctcactgatgatggcaggcattgtagagatttggat
gagtgtgatactaaccttaacacctgccgctaccgctgcaagaatctcatcggcaagttc
atgtgccagtgtgatgaaggctacacaccgattggtggggatggaaacaactgcagagat
atcaatgaatgtatcaccaaccatggtgtctgtcagaatggacgctgcaggaatacagaa
ggcggccacacgtgtatctgcaaccaaggattcacacttggtccctctggcaaagactgc
atagatcgacgcacaggtttctgctacgcctacgtgccacccagtggatgcgagtccagc
cagggaggtatgcaaccagtcactatggaatcatgctgctgcagtggcggaagggcttgg
ggatccacgtgccagatatgccctgtatatggaacaattgaatacaaccgcctctgcacc
gccaccacgccagtggatccatgtcagatcgttcagggcttgtgtgaaaacgggcactgt
ctgggaggctccggtggatacctttgtcagtgtaatccaggatacatccttagcccagat
ggcacaagatgtgaagatgagaacgagtgtaaccgtgcacctcctccatgtagctaccag
tgtaagaacactccagggagctttagatgtggctgccctcagggttatctactcagtgaa
gatggactcacatgcagagagaaagacgaatgttcaatgggaatccatgaatgtcagttt
gaatgcagaaacactctaggcggcttccgatgtgtgtgtccagaaggatatatacaacat
ggatctacatgtatagatgtgaatgagtgtatacagactccagatatttgcggtgcatac
ggtacttgtcagaacacacagggtgggcataggtgcgaatgccagagaaacttccgacca
gatccatccactaacacatgcgtcgacatcaatgaatgtgaggatcaaccagacatttgt
cagtatggctgtcagaataccattggtgggtacagatgtgtgtgtccagatggctttgaa
gaaaacttctatggaaggtgtattgataacaatgagtgcagacagtccggtaaatgtggt
caagctacatgttataacactcagggtagctaccaatgcggatgcaacaatggatatgca
tttgatcaacagaatcttgcttgcaatgatgtgaatgagtgtcaagggtcatatggcaat
acgaacagtccatgtcagtatagctgtgataatacagatggtagcttctcctgcggctgt
cctccagggtacaccagcgtggtgcagggagcttgtgtgacagatcgagactctgtccaa
ccgtgctacagctgcaatagacaaccaagacagcgcagaagtgctacagagactaacgac
aaggaatcaacactgatatccaacaacaccgccatcctgtatcatatcccgctctccaaa
gccgtccccaagcaacaaatcgctaaattcaagaccggctacaccaggatcgtggcccgc
tacgagtacgtcatcctgagcggtaatgaagacaacatctttatgatgaagaagaaatct
gatggcatgtccctgctacgattcagcaaacatgtgaaggccacgggtctctatgaactt
gaaattgaaggtgtgctgaaaaggaaaaatgacacgatattagctgaagttcaaactgta
gtagaggaacctgttgcaatgcagattcaagttcaaatagtagcagatgaagaagaatag
DBGET
integrated database retrieval system
