Streptococcus pyogenes HSC5 (serotype M14): L897_03160
Help
Entry
L897_03160 CDS
T02743
Name
(GenBank) ATP-dependent helicase
KO
K16898
ATP-dependent helicase/nuclease subunit A [EC:
5.6.2.4
3.1.-.-]
Organism
spyh
Streptococcus pyogenes HSC5 (serotype M14)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
spyh00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
spyh03400
]
L897_03160
Enzymes [BR:
spyh01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
L897_03160
DNA repair and recombination proteins [BR:
spyh03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
AddAB pathway proteins
L897_03160
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
UvrD_C
AAA_19
UvrD_C_2
PDDEXK_1
DEAD
AAA_30
AAA_16
RNA_pol_Rpb1_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGQ27418
LinkDB
All DBs
Position
596352..600020
Genome browser
AA seq
1222 aa
AA seq
DB search
MLFNINEKGEPLVISFAPFLSPEAIKHLQENERCSDQSQKRTAQQIEAIYTSGQNILVSA
SAGSGKTFVMVERILDKILRGVSIDRLFISTFTVKAATELRERIENKLYSQIAQTTDFQM
KVYLTEQLQSLCQADIGTMDAFAQKVVSRYGYSIGISSQFRIMQDKAEQDVLKQEVFSKL
FSEFMNQKEAPVFRALVKNFSGNCKDTSAFRELVYTCYSFSQSTENPKIWLQENFLSAAK
TYQRLEDIPDHDIELLLLAMQDTANQLRDVTDMEDYGQLTKAGSRSAKYTKHLTIIEKLS
DWVRDFKCLYGKAGLDRLIRDVTGLIPSGNDVTVSKVKYPVFKTLHQKLKQFRHLETILM
YQKDCFPLLEQLQDFVLAFSEAYLAVKIQESAFEFSDIAHFAIKILEENTDIRQSYQQHY
HEVMVDEYQDNNHMQERLLTLLSNGHNRFMVGDIKQSIYRFRQADPQIFNQKFRDYQKKP
EQGKVILLKENFRSQSEVLNVSNAVFSHLMDESVGDVLYDEQHQLIAGSHAQTVPYLDRR
AQLLLYNSDKDDGNAPSDSEGISFSEVTIVAKEIIKLHNDKGVPFEDITLLVSSRTRNDI
ISHTFNQYGIPIVTDGGQQNYLKSVEVMVMLDTLRTINNPRNDYALVALLRSPMFAFDED
DLARIALQKDNELDKDCLYDKMQRAVIGRGAHPELIHDTLLGKLNVFLKTLKSWRRYAKL
GSLYDLIWKIFNDRFYFDFVASQAKAEQAQANLYALALRANQFEKSGYKGLYRFIKMIDK
VLETQNDLADVEVAAPKQAVNLMTIHKSKGLQFPYVFILNCDKRFSMTDIHKSFILNRQH
GIGIKYLADIKGLLGETTLNSVKVSMETLPYQLNKQELRLATLSEQMRLLYVAMTRAEKK
VYFIGKASKSKSQDITDPKKLGKLLPLALREQLLTFQDWLLAIADIFSTEDLYFDIRFIE
DSDLTQESVGRLQTPQLLNPDDLKDNRQSETIARALDMLEAVSRLNANYEAAIHLPTVRT
PSQLKAAYEPLLEPIGVDIIEKSSRSLSDFTLPHFSKKAKVEASHIGSALHQLMQVLPLS
KPINQQTLLDALRGIDSNEEVKTALDLKKIESFFCDTSLGQFFQTYQKHLYREAPFAILK
VDPISQEEYVLRGIIDAYFLFDDHIVLVDYKTDKYKQPIELKKRYQQQLELYAEALTQTY
KLPVTKRYLVLMGGGKPEIVEV
NT seq
3669 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgctttttaacattaatgagaaaggagagccacttgtgatttcttttgccccattttta
agccccgaagctattaaacatttacaagaaaacgaaaggtgcagtgatcagtctcaaaaa
cgcacagctcaacaaattgaagcaatttatactagtggccaaaatatacttgtatcagct
tctgctggttcaggaaaaacctttgtaatggtcgaacgtatacttgataaaattttgaga
ggtgtttcaattgatcggctttttatctcaacctttactgttaaagcagctacagaactg
cgtgaacggattgaaaacaaattatactcacaaattgctcaaactacagattttcaaatg
aaagtttatttaacagaacaattgcaatctctttgtcaagctgatattggtactatggat
gcttttgcacagaaagtagtaagtcgctatggttatagcattggcatttcatcccaattt
cgtatcatgcaggataaagcagaacaagatgttttaaagcaagaggtgtttagcaaactc
tttagtgagtttatgaatcaaaaagaggcaccggtgtttagggctcttgtgaaaaatttt
tctggtaactgtaaagacacttcagcttttagagagttagtttatacttgttattctttt
agccaatcgacagaaaatccaaaaatatggttgcaagaaaattttctaagcgctgctaaa
acttaccaaagacttgaagatatcccggatcatgatattgaactcttacttttggcaatg
caagacactgcaaatcagctaagagatgtgactgatatggaagattatgggcagctgact
aaggcaggtagccgatctgctaaatacactaaacacttaacgatcatagaaaagttgtct
gattgggtgcgtgattttaaatgtttgtatggaaaagccggattggatcggttgatcaga
gatgtgacaggccttataccatctgggaatgatgttacagtctcgaaggtaaaataccct
gtttttaagaccttgcatcaaaaattaaaacaatttaggcatttagaaacaattttaatg
tatcagaaagactgttttcccttattggaacagttacaagattttgtgcttgcgttttca
gaagcttatttagctgtcaaaatacaagaaagtgcttttgaattttcagatattgcacac
tttgcaatcaaaattttagaggaaaatacggatattcgccaatcctatcagcaacactat
catgaggtgatggttgatgaatatcaagataacaatcatatgcaagagcgactcctgacc
ttactatcgaacggtcataatcgctttatggtaggagatatcaaacaatcgatctatcga
tttcggcaagccgatcctcagatttttaatcaaaagtttagagactatcaaaaaaaacct
gagcaggggaaagtgattttactcaaagaaaactttcgtagccaatcagaggtgttaaat
gtcagcaatgctgtttttagtcacttaatggacgaatcagtaggagacgtcttatacgat
gagcaacatcagttaatagcaggtagtcatgctcaaacagtcccctatctagaccgtcgt
gctcagttattgctatataatagcgataaagatgatggcaacgccccttcagatagtgag
ggtatttcatttagcgaggttacaattgttgccaaagaaattattaagcttcacaatgat
aagggtgtcccttttgaagacattacgttactcgtttcttcaagaacaagaaatgatatc
atttctcatacattcaatcaatatggtattcctatagtaacagatggtgggcagcaaaac
tatcttaaatctgttgaagtgatggttatgttagatacattacgcaccattaataaccca
agaaatgattatgcccttgtggctttactgcgctcaccgatgtttgcctttgatgaggat
gatttagcaagaatagcacttcaaaaagacaatgagctagataaagattgcctatatgac
aagatgcaaagggctgtgattggaagaggtgctcatcctgaattgattcacgataccttg
cttggcaagttaaatgtttttttaaagacgttgaaaagctggcgtcgatacgctaagcta
gggtcgttgtatgacttgatttggaaaattttcaatgatcgtttttattttgattttgta
gctagtcaagcaaaagcagaacaagcacaagctaatctatacgcattagctctacgtgct
aatcagtttgaaaaatcgggctataaagggctataccgttttattaaaatgattgataag
gtacttgagacgcaaaatgacttagcagatgtggaagtggctgctcctaaacaagctgtt
aatttaatgaccattcacaagtctaaaggtttacaatttccgtatgtatttatccttaat
tgtgacaagcgcttctcaatgacagatattcataaatcatttattctgaatcggcagcac
ggtatcggtatcaagtaccttgcagatatcaaaggtttacttggtgaaacaacactcaat
tctgttaaagtaagcatggaaaccttaccttatcaattgaacaaacaagagttgcgctta
gcaactttatcagaacaaatgcgcttattgtatgttgctatgacacgagctgaaaaaaaa
gtttattttattggtaaagctagtaagagcaaaagtcaagatatcacagatcctaaaaag
ttaggcaaacttttgccgctggctttacgagaacagttattgacattccaagattggcta
ttagcaatagcagatatattttcaactgaagatctttattttgatattcgctttattgaa
gatagtgatttgacacaagagtcagtcggacgacttcaaacaccacagttattaaatcca
gatgatcttaaagataatcgtcaatcagaaacaattgcacgggctttagatatgttagaa
gcagtgtctcgattgaatgccaattatgaagcagctattcatttgccaacagttcgaacg
cctagccaacttaaggcagcttacgagcctttattagaacccattggtgtagatattata
gagaaatcttctcgatcgctatctgattttactttgccacatttttcaaaaaaagcaaaa
gttgaagcaagtcatattggatcagctcttcatcagttgatgcaggtgctccctttgtca
aaaccgataaatcaacaaacgcttttagacgctttaagaggaattgatagtaacgaagag
gtaaaaacagctcttgatctcaaaaaaatagagtcgttcttttgtgatacaagcctaggc
caattttttcagacttaccaaaaacacttgtatcgagaagcaccatttgctattttaaaa
gttgaccctattagtcaagaagaatatgtcctacgtggtattatagatgcctactttttg
tttgatgatcatattgtattagtggactataaaacagataaatacaagcagcccattgag
ttaaaaaagcgttaccaacaacagttggagttatatgcagaagctctcactcaaacgtat
aaacttcctgtgactaagcgctatcttgttttaatgggaggtggaaagccagaaattgtc
gaagtttaa
DBGET
integrated database retrieval system
