Spirosoma radiotolerans: SD10_20705
Help
Entry
SD10_20705 CDS
T03819
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
srd
Spirosoma radiotolerans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_16
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKD56963
UniProt:
A0A0E3ZYF7
LinkDB
All DBs
Position
5098252..5101701
Genome browser
AA seq
1149 aa
AA seq
DB search
MINTVTTSLFAIHRRFLRSTDLERDWNDPEALENYTLTPHAKQALERLGEGLRPKSSLRA
WRITGDYGSGKSSFALLVAKLFSQPLSQLPTVFKTELRRAGSGLAFPKAPALLPVLVTGS
REPMGPAILRALLTALRSIDADESLLTELGEVTSNPEICSDRLVLHWVQRIQRYIVVTDR
ANGLLLILDEAGKFLEYAADRPDQQDVFLLQSLAEASARSGDLPLFILALLHQGVSAYTE
SLTKAQQREWEKVAGRFEEITWYHPVEQVASLVANALKTQLDQVKPQTQEQARSAMQETL
KLRWYGVDVAAKPLIDLAANIYPLHPTVLPPLVRLFASFGQNERSLYSFLLGSDPHGLQD
FTARTEGKQFFRLNNLFDYARSAFGGRLASLSYHWKEIDSIINSYQGEQEQDLAVLKITG
LMNLLNTSDLVASKQALSLALDIGNDIEAALIRLQELHMLHFRGIAGGFCVWSTSSVNLN
DARAEAKKALGTVTNLPALIRERLEVRPLVARRHYISTGNLRYFDVKYVEVASLSNKLNT
DTSADGLIIVPLCETPTDVEAAHKFISNSEIAQRAHVLVAVPRPLRGLTAELEELRQWEW
VERSIGELRHDRYAREEVSRKLVLSQQTLTKKLQVSIGLLNADGEGRLAWFHKGQLVPNL
HTGRNVLTLLTEICNNVYSFSPFIHNELINRRILSSNGAAARLRLCEKLFESASQPLLGM
DPDKHPPEMSMYLSVLQEAGLHQQTEKEGIWEVALPSEQYDEAHCRILPAMHRIHEVLLE
KPDARVPVTVVFDALRLAPYGVRDGLTPLLLAVFAVIHEQELAFYEDGSFIPRITGTNFL
RLIKAPETFEVQYYPYTGIRNDLFQQLIRELGLRAENTNRVDILDVVKPLLIFIANLPEY
ALKTTRLSPKAKAVRSILVATVDPAKLIFYDLPKACGLSPINAHIIGDEHTQLNHIQEFV
STLKSIVDELRAAYPNLLQSLCSQLMKELQLSGGFDQIRPILASRAKALAISVTEIRLKS
FCLRLADTSLVENKWLESLGNLVCSMPPAKWRDADEYKFEQEIHKLSAQFLRVEAVVFSK
KSTEQNVESVRLALTHPNGEERDQVIHLAQEQVKDMEALQEHLRTLLRHQGQLGMAAATR
VLWEMMAQK
NT seq
3450 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaataccgtaaccaccagcttattcgcgatacatcgacgttttttacgttctacg
gacttggaacgtgactggaatgatccagaagcattagagaactatacccttaccccacat
gcgaaacaagccttagagcgtcttggagaaggtttaaggccaaaatcaagtctacgtgca
tggcgtattactggggattatggttcgggaaaatcttcatttgccttactggtggcaaag
ttattttctcaaccattgtcgcaattgcctacagtgtttaagactgagctgcgtcgagcc
ggatcagggctcgccttccccaaagcccccgctttgttacctgtattggtaacgggaagt
cgggaaccaatgggcccggctattcttagggcgttgcttacagctctgcgaagcattgac
gccgacgaaagtttgttaacagaattaggggaagtaacgtctaaccctgagatctgctca
gatagacttgtgcttcactgggtgcagcgtatacagcggtatatagtagttactgatcga
gcaaatggactactattgatccttgacgaagctggtaaatttttagaatacgcggctgat
cgccctgatcagcaggatgtttttttactgcaaagtctcgctgaagcgtcggcacgtagc
ggtgacttacctttatttatattagctctattacaccagggggtaagcgcctacacggaa
agtctcactaaagcacaacagcgagaatgggaaaaagtagctggacgtttcgaagaaatt
acctggtaccacccagtcgagcaagttgcctcgttagtcgctaatgccttaaaaacccaa
cttgaccaggttaagccgcaaacacaggaacaggctagatcggctatgcaggagacgcta
aaattgcgttggtatggggttgacgtggcagccaagcctctaatagacttagcggccaat
atataccctcttcatcctaccgttttaccacccttggtccggctatttgccagttttggt
caaaatgaacggtcactctattcgtttttgctgggttctgatccacacggcttgcaagac
tttaccgctcgtactgagggaaaacagttttttcggttaaataatcttttcgattatgcg
cgtagtgcctttggtggtcgcttggcctcgctcagctaccactggaaagaaatcgatagc
attataaattcctaccaaggagaacaggagcaagatctagcggtgcttaaaataactggc
ttaatgaatctcctgaacacaagcgacttagttgcttcgaagcaagcattgtcgcttgcc
ctggacataggaaatgatatagaggccgctctcattcgtttgcaggagctgcatatgctg
cactttagaggtatcgccggtggtttttgtgtgtggtctacctcaagtgttaatttaaat
gatgcccgtgccgaagcaaaaaaagccttaggaactgttactaatctgccagcacttatt
cgggagcgcctagaggtgcggccacttgttgcccgtcgtcattacatcagcacaggtaat
ctgcggtattttgatgtaaagtatgtagaagtggcctccttgtccaataaacttaatacg
gatacatcagcagatggactaattattgttcccctctgtgagacacctacagatgtcgaa
gctgctcataagttcatatcgaattcggaaattgcccaacgtgcccacgtacttgtggct
gtacctcgaccccttcgaggacttacggcagagttggaggagcttcgtcaatgggagtgg
gtagagcggtcgatcggtgaactacgtcatgatcgatatgcacgagaagaagtctcccgt
aaattagtactctctcagcaaacgttaacaaaaaaattacaagtaagtataggtctactt
aatgccgatggagaaggccgtttggcttggttccataaagggcagctagtacccaatctt
cacacaggaaggaatgtactgacgttgttaaccgaaatttgtaataatgtctattccttc
tccccgttcatacataatgaactgatcaatcgaaggattttatcgtcgaacggtgctgct
gcacggttaaggctatgtgagaaactctttgaatcagccagtcaacctttattgggcatg
gacccggataagcatccacctgaaatgtccatgtatttatcggtattgcaagaagcaggc
ttacaccagcaaacagagaaagaaggcatatgggaagttgctttacctagtgaacaatat
gacgaagctcattgccgtattttaccggcgatgcatcgtattcatgaggttcttttggaa
aaaccggatgcacgtgtgccagtgacagtagtgtttgatgcgttacggctagcgccttat
ggtgttagagatggtttaacaccgctactactggcggtatttgccgtcatacacgagcaa
gaattagcattttacgaagatggttcttttattccaagaataactggtactaacttctta
cggctcattaaagctccggaaacgtttgaggtccaatattatccatacacaggtatccgt
aacgacttgtttcaacaattgatccgtgaattagggctaagggctgaaaacacgaaccga
gtcgacatactggatgtcgtaaaaccactactcatatttatcgcaaatcttccagaatat
gcgctaaaaacgacacgtttatctcctaaagccaaggccgtccggtctattctggtagca
actgttgatccggctaaacttatcttctatgatttgccaaaagcctgtggcctatcccct
atcaatgcccacattattggtgatgaacatacacaactaaatcatatccaggaatttgta
tctactttaaaaagtattgtagatgaattgcgtgctgcctacccgaatttgttgcagagc
ttatgttcacaattgatgaaagaattgcagttaagtggtggatttgatcaaatccgacct
atattggccagccgggcgaaagcgttggccatctcggtgactgagattcgattaaagagc
ttttgcttacggctagctgatacatcactagtagaaaataaatggctggaatctttgggt
aatctagtttgctcaatgccaccagccaagtggcgtgatgcggatgaatataagtttgag
caagaaatccacaagctgagcgctcaattcttgcgagtagaagctgttgtgtttagtaaa
aaaagtactgaacagaatgtggagtctgtccgactggctctaactcacccgaacggagag
gaacgtgatcaagttattcatttagcgcaagaacaggttaaggatatggaagctctacaa
gaacacctgagaacattacttagacatcagggacagctcggtatggctgctgctacacgt
gtcctgtgggagatgatggctcaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
