Candidate division SR1 bacterium Aalborg_AAW-1: XF24_00239
Help
Entry
XF24_00239 CDS
T04487
Symbol
inlA
Name
(GenBank) Internalin-A precursor
Organism
srg
Candidate division SR1 bacterium Aalborg_AAW-1
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Flg_new
Vgb_lyase
Big_13
SGL
NHL
Mala_s_1-like
SBBP
Big_6
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKH32599
UniProt:
A0A288GSR3
LinkDB
All DBs
Position
complement(249409..254730)
Genome browser
AA seq
1773 aa
AA seq
DB search
MKKIFFGILYGFVLSFGTSVCAYFPLLGTDFQAWYKADSLSSSSTGSLWSDSYWQDGRFD
LQKGTGNSFVYTTNGMNFNPTLFFDATKLNNYHPDNIALQGEHKIFAVIKPSGTSGPINT
IINGQCPNDQSCPRPDFYITAGGYPEYFAGAVGVDGSIPRYGINHPMNTTTSIIGKPTLM
SVQSNQTNPAWSYWVYDHPLSWGDGLNSRAFIKKNGLDIGVYEFLNNSQRDDSGIPREYN
IGAGSKSANFGYQVGYDYLVGQEANLKPFQGEIAELIVYKGASNQTAQSNSIRSVESYLA
LKYGLTLEQIGTGQHYLDGSGNVVWNASNNSGYKNNIFGIGRDDSTSLYQKQSQSVNTGV
LTIALDQLASTNQDNTSTLSDRNFIIGGDNNGTLNLSESFNGNINSRLGRVWKFEKTGTD
TPLIEMIFTGITTSGLSLIVSTDEVFDMGDTIIPLSGDRVSYTPTSSILYVSLVSTPPTG
YYPGPINYPIPGLKDHSLAISNLSGTTYTSTPILSGTTAANAFVTVTLSGTQYTGYADGS
GNWSIVPATLSTGVYTATVTAMITGDSLDEYNTGIVTRLVQQFASTSFPNFLAFDFQGNL
FTTNGNDCAGSTITQVTPLGVVSTLSETVAHTRCGLVFDSQGNLFVSSSTASPQSISKVV
TGGTATLFATPTNAGSFGLGDMVFDTMGNMYVTARGNNVIQKISSAGVVSTFATGFVNSF
GITIDNNENIYVAEYGGTIKKITPSGNKSTFATGFVSTSDAVFDLNDNMYVSDWLGSTIY
KITPSGNKSIFATGLGNATSLAFGDDGNLYVSRRPNNRIDRVYASQSLLTISTTFSIVGL
LPPPAPTIFYPGSGSTITDITPTFSGTGSTSGDIITLTIYGVQYTGMVQSDLTWSITPSD
VKLPDNRSYTISVTETNAGGTSPATIETFRVQRYTPDTKDVNLTISNVSGAVSCMLPTLT
GTATPGSTVVATLSGYSFTGTADGSGNYAIPLSGNFADGNYTVDTTVIVTGSALDSYTTG
TFSTVNSIFATGLSLPIGITFNAYNNIYIGNYGNDTVVTMSGGMLIPYANGFNHTVDIVF
DIRGNLYVSNDLSHTISKVNIGGTVSTFAGGFTGPHGLLYDSLGRMYVTNRNGNTISQLT
TGGIWSTFINGLNKPEFMVFDTNNNIYVANFGNNIISRITGLGVISNFSSGFGGSRGIAI
DIFNNIYVANSTSNTISKITPLGVVTTFVGSGLSGPFGMAFDNYGNLFVANPSNNTVSKI
TSQSTLTKSITFTKNCNALVTFVDYDGTVLQTGTVQYGSSAVAPANPTRTGYTFSGWNPS
DLSNITGDRIFTGEYTINYYTLSFEENGGSNVLDQTGIAYNTTGVVPVNPIKTGYYFSGW
YLSGSSIPFDFSTLITGDTIVYAYWNTIPVITYTLSFEENGGTPILDQTGIVYNTPGTDP
GSPTRVGYTFSGWYLSGASNPFDFSTPLSGDTTLYAQWNLISVALTYTLFFEENGGTLVT
DQTGITLNGTGNQPTNPIRTGYTFGGWYTSPAFTTLYNFSTVITGDTTVYAKWTEQSSGG
GGGGGYTIPYEEVFNDTIGTTCFTPGDKRTIDQGNNVTESFKIAHQMLYSYELTKWQGTR
DYRPFDYLTREEAARFMVEFAENVLCRKKTRTYNNNFSDLGGSNPTLTRFIRESYEYEIF
NGDKGVDDQYSTTFRPQDRISKNELAAIMVRLVTNTILEEPETDWSQHYRIQLNKYARLT
QLNDRGRGNIAEVMYDLYRNNTYILQDVGYVIQ
NT seq
5322 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaatattttttggtatcttgtatggttttgttctatcctttggtacatcagtt
tgtgcttacttcccgcttttatgaactgactttcaagcatggtataaagctgattcttta
tcctcttcatcaacgtgaagtttatggtctgatagttattggcaagacggtagatttgat
ctccaaaaaggtacaggaaattcatttgtctataccacaaatggtatgaattttaatcct
acgttgttcttcgatgcaacaaaattaaataattaccatccagataacattgctcttcaa
tgagaacataagatctttgctgtgattaagccttcttgaacaagtggtccaattaatacg
attattaatggacaatgtccaaatgatcagagttgtcctcgtcctgatttttatataaca
gcttgaggatatcctgaatattttgctggagctgtgggtgtagatggtagcattccaagg
tatggtattaatcatcctatgaatactacaacgagtatcattggaaaaccaactcttatg
tctgtgcaaagtaatcaaacaaatccagcttggtcgtattgggtttatgatcatcctttg
tcatggtgagatgggttaaattcgagagcatttatcaagaagaatggtcttgatatagga
gtatatgagtttttgaataatagccaacgagatgatagtggtattccaagagaatataat
atatgagcgtgatccaaatctgctaattttggatatcaggtatgatatgattatcttgtt
ggacaagaagctaatttgaaacccttccaatgagaaatagcagagttgattgtctataaa
tgagcgtcaaatcaaactgcacagagtaattctattcgtagtgtagaatcatatttagca
cttaaatatggtcttacgttagaacaaatctgaacatgacaacactatctagatggtagt
ggaaatgtagtatggaatgcgagtaataatagctgatacaagaataatatatttggtata
tgacgtgatgatagtacgagtttgtatcaaaaacaatcacagtcagtgaatacaggtgtt
ttgacgatagcccttgatcaattagcgtctaccaatcaagataatacttctacattatca
gatagaaattttattattggatgagataataattgaacactgaatttgtcagaatcattt
aatggaaatataaatagtcgtctatgaagagtatggaagtttgaaaaaacatgaactgat
actccacttatagaaatgatatttacatgaattaccacatcatgactttcgctcatagta
agtactgatgaagtatttgatatgtgagatactattataccacttagtggtgatagagtt
tcatatactccgacaagtagtatattgtatgtgagtttggtatctactccacctacagga
tattatccatgacctatcaactatcctattccatgacttaaagaccatagtcttgctatc
agtaatctaagttgaactacttatacatcaactcctatattaagcggtaccacagcggca
aatgcttttgtaacagtaactctttcatgaacacagtatacctgatatgctgatggaagt
ggaaactggtctatagtgcctgctacattatcaactggtgtctatacagctacggtgact
gctatgattacatgagattctcttgatgaatataatactggaatagtaacaagattagta
caacagtttgcatcgacatcgttccctaactttcttgcttttgattttcaaggaaactta
tttacaacaaatggtaatgattgtgctggttcaactataactcaagttactccattatga
gttgtatctactttatctgagacggttgctcatacgagatgtggattagtatttgatagt
cagtgaaacctatttgtgtcttcatctacagcatcaccacaatcaatctcaaaggttgtt
acttgatgaacagcaacgctttttgcgacaccaaccaatgcttgatcttttggtttatga
gatatggtgtttgatactatgtgaaatatgtatgtgacagcacgatgaaataatgttatt
caaaaaatctcttctgcatgagtagtatctacttttgcaacaggatttgttaattcattt
tgaatcactattgataataatgagaatatatatgttgcagagtattgatgaacaataaaa
aaaattactccatcatgaaataaatctacttttgcaacatgatttgtttctacctctgat
gctgtatttgatttaaatgataatatgtatgtatctgattggttgtgatctactatttat
aagattactccatcatgaaataaatctatttttgcaacatgactttgaaatgctacatct
ttggcttttggagatgattgaaatctttatgtgtcacgtcgtcctaataatagaattgat
agagtatatgcatcacaatcacttctgactatctctactactttttctatcgtatgatta
ttgcctccaccagcaccaactatcttctatccatgatcatgaagtacgattacggacatt
acaccgacttttagtggaacagggagtacatcatgagatattattacattgactatctat
ggagtacagtatacaggtatggtgcagtcagatctcacatggagcattacaccaagtgat
gtgaaacttccagataatagatcctatacgatctcagtaacagaaacaaatgcatgatga
acttctccagcaacaatagagacatttagagtacaaagatatactccagatacaaaagat
gtaaatctgactatctcaaatgtcagtggagcagtatcgtgtatgctaccaactctcaca
ggaacagcgacaccatgatctacagtagttgcaactttatcatgatatagttttacgtga
actgcagatgggagtggaaactatgccataccactatcatgaaattttgcagatggaaat
tatactgtagatacgacagtaattgtgaccggatcggctttggatagttatacgactggt
acgtttagtacagttaatagtatttttgcgacttgattatcattgcctatatgaatcaca
tttaatgcttataataatatatatattggtaattatggtaatgatactgttgtgactatg
tcatgatgaatgctgataccatatgctaattgatttaatcatacagttgatattgttttt
gatataaggtgaaatctttatgtaagtaatgaccttagtcatactatttcaaaagtaaat
atatgatgaacagtatcaacttttgcatgatgatttacatgacctcattgattgttatat
gattctttatgaagaatgtatgttacaaatcggaattgaaatacaatttcacaacttact
acatgatgaatatggtcgacttttataaatggattaaataaaccagagtttatggttttt
gatactaataataatatatatgtagcaaattttggtaataatattatatcaagaattact
tgattatgagttatatcaaatttttcttcatgattttgaggatctcgtggaatagcaatt
gatatatttaataatatatatgttgcaaatagtactagtaatacaatttcaaaaatcaca
ccattaggtgttgtaactacttttgtcggatcatgactatcatgaccatttggaatggca
ttcgataattattgaaatttatttgttgcaaatccttcaaataatacagtttcaaaaata
acctcacaatctactcttacaaagagtattactttcactaaaaattgtaatgcactagtg
acctttgtcgactacgatggaacggtactgcagacgtgaacagtacaatatggaagctca
gcggtagccccagcaaacccaacgaggacaggatatacatttagctgatggaatccgagt
gatttgagtaatatcacaggagataggatatttacaggagagtataccatcaattattat
acgctttcatttgaagaaaatggaggaagtaatgtgctagatcagacaggtatagcttat
aatacaacaggagttgttccagttaatcctattaaaacctgatattattttagtggatgg
tatctgagttgatcgtctattccatttgattttagtacacttattacgggtgatacaatt
gtttatgcatattggaatactataccagttattacttatacgctttcatttgaagaaaac
tgatgaactcctattctagatcagacaggaatagtctacaatacgccatgaactgatcca
tgatctcctacgagagtatgatatacctttagtggatggtatctgagtggagcatctaac
ccatttgatttctctacgcctttgagttgagatactacactgtatgcacagtggaatctt
atttcagtagcactaacctatacgttattctttgaggaaaatggatgaacactagttaca
gatcagacaggaattacgctaaatggtacaggtaatcaaccaacgaatcctataagaaca
ggatatacattcggatgatggtatacatcaccagcttttacgacactctataatttctct
acagtaattacgtgagatactactgtgtatgcaaaatggaccgaacaatcatcatgatga
tgaggtggctgatgatataccataccatatgaagaagtatttaatgataccataggtacc
acttgttttactccatgagataaaagaactatcgatcagtgaaataacgttaccgaatca
tttaaaatagcgcatcagatgttgtatagttatgagttgacaaaatggcaaggtacaaga
gattatagaccgtttgattaccttaccagagaagaagcagcaagatttatggtagagttt
gctgaaaatgtattgtgtagaaaaaaaacaagaacatataataataatttttctgactta
tgatgatctaatccaacacttacaagatttattagagaatcatatgaatatgaaatattt
aatggagataaaggtgtcgatgatcagtattctactacttttagacctcaagatcgtata
agtaaaaatgaattagcagcaattatggtgagacttgttacaaacaccattctagaagag
ccagagactgattggtctcaacattatagaatacagctaaataaatatgcaagacttaca
caattgaatgatagaggaagaggtaatattgctgaagtgatgtacgatttatatagaaat
aatacctatatattacaagacgtatgatatgtcattcaataa
DBGET
integrated database retrieval system