Staphylococcus roterodami: ML435_08245
Help
Entry
ML435_08245 CDS
T09562
Symbol
sasC
Name
(GenBank) LPXTG-anchored repetitive surface protein SasC
Organism
srot
Staphylococcus roterodami
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF1542
YSIRK_signal
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UMT74888
LinkDB
All DBs
Position
complement(1756418..1762753)
Genome browser
AA seq
2111 aa
AA seq
DB search
MNLLKKNKYSIRKYKVGIFSTLIGTVLLLSNPNAAQTLTTETTANNSADQSVPANVQNSN
VNTNQGVTNNAQNTSSHSTTTNASPNQTLPNHNSVGSANQVAPISPQPNQPNTTTGQNSN
NSHLNTTTTDKTSNTANGNLTSNTNTLNVDNNTTENSSERHLTLKEIQEDVRHSSDKPEL
AAVTEEPSNRPKKRSRRAAPADPNAAPADPAAAAGNGATPAGNAATYTPATDPNANNTGQ
NAPNEVLTFDDNGINPSTNRSVPSVTIVDNLPGFTLINGGKVGVLSHAMVRTSMFDSGDA
KNYQAQGNVIALGRIRGNDTTNHDGFNGIEKALTVNPNSELIFEFNTMTTKNYQGMTNLI
IKNADNDVVIAEKVVAYGPIWRLFKVPENVSHLKIQFVPKDDAITDARGIYQLRDGYKYY
DFVDSIGLHSGSHVYVERRSMDPTATNNKEFTVTTSLKNNGNFAASLNTDDFVYQIQLPE
GVEYVNNSLTKDFPSNNSGVDVNDMNVTYDAANRIITIKSAGGGGGNSAARLMPDKILDL
RYKLRVNNVPTPRTVTFNDTLTYKTYTQDYINTPAESHTVSTDPYTIDIIMNKDALQAEV
DRRIQQADFTFASLDIFNGLKRRAQTILDENRNNVPLNKRVSQADIVALANQMQHTLIRS
VDAENAVNQKVNQMEDLVNQNDELTDEEKQDAIQVIEEHKNEIIGNIGDQTTDEGVTRVK
DQGIQTLSGDTATPVVKPNAKKAIRDKAAKQREIINNTPDATEDEIQDALNQLTTDESDA
IDNVTNATTNADVETAKNNGINTIGAVVPQVTHKQAARDAINQATATKRQQINDNREATQ
EEKNAALNELTQATNHALEQINQATTNADVDNAKGDGLNAINPIAPVTVVKQAARDAVSH
DAQQQIATINANADATQEERQAAIDKVNAAVAAANTNILNANTNADVEQVQTNAIQGIQA
IEPATKVKTDAKNAIDQSAATQHNIIFNNNDATLEEQQAAQQLLDQAVTTAKQNINAADT
NQEVAQAKEQGTQSITVIQPATQVKTDARNAVNEKAREAITNINATPGATREEKQEAIDR
VNTLKNRALNDIGVTSTTAMVYSIRDDAINQIGAVQPHVTKKQTATGVLNDLATAKKQEI
NQNTNATTEEKQVALNQVDQELATVINNINLADTNAEVDQAQQAGTQAINAIQPNIVKKP
AALEQINQHYNAKLAEINQTPDATDDEKNAAINTLNQERQQAIESIKQANTNAEVDQAAT
TAENNIDAVQVDVVKKQTARNKINVEAAKRIEVVKQTPNATEEEKQAAVNKINQFKDQAL
NQINQDHTNDQVDATTNQMINAIDNVEADVVVKPKAIADIEKAFKEKQQQIDNSIDSTDN
EKEVATQALAREKEKALAAIDQAQTNNQVNQVATDGLSAIKIVQPETKVKPAAREQINQK
ANELRAQINQDKEATAEEKQAALNKINDFVNQAMSDISNNRTNQQVTDTKTQALDNIAQV
NPEHIVRAAARDAVNQQYEAKKQEIEQAEHATDEEKQVALNQLTNNKERALQNINQAVTN
DNVKHVETNGIATLKGVEPHIVVKLEAQQAIKASADKQVDSIKDTPDATVDEINEANQLI
KDTLQQGQQQIDNTNQDAAVTGVRNQTIKAIEEIKPKERRKRAALDNIDQTSDNQMNTIQ
NTLDTTEDERNDAIHALNKIVNSLKEAIAHNSTNAEVDQTETSGQENIKVIIPKVQVKPE
ARQAVNVKAVSQNALIDQSDLSTEEERLEAKHLVEQALIKAKQQIVSAVTNADVAYLLHD
GKNEIREIEPIINRKASARELLTTLLNEKKQAIESNVQATVEERNSVLAELQNIYDAAIL
QIDHDRSNAQVDKTTSLNLQAIQDLDVYPVKKPNAEKEINQEVVRVTNLVQSYRKVSDRN
KSEALKAIDALKLQMEEELKAAHTNADVDEVLKRFNVALVNIEAVITEKENGLIRIENIA
QQTFKKFKAIATPEQLAKVKALIDQYVKDGTRMIDEDTTLNDIKQHTQFIIDEILAIKLP
AEAKVELPKARKSAPKVCEPNKKEGKDEARKIEKELPNTGFEGMELPLKEMALITGAALL
ARRRSKKEKES
NT seq
6336 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatttgttaaagaaaaataaatatagtattagaaaatataaagttggcattttctct
acattaatagggacagtattattactttcaaatccaaatgctgctcaaactttaactact
gaaacaactgcaaataattcagcagatcaaagtgtaccagctaatgtacaaaattctaat
gtgaatactaatcaaggtgttacaaataatgcgcagaatacatcaagtcattctactaca
acaaatgcatcaccaaatcaaacgttgccaaatcacaatagtgttggttctgcaaatcaa
gttgcgccaatatcaccgcaacctaaccaacctaacacaacaacaggtcaaaacagcaat
aattcgcatttaaatacaacaacaactgacaaaacgtcaaatactgcaaatggtaattta
acatcaaatacgaatactttaaatgtggataataatacaactgaaaatagttcagagcgt
catttaactttgaaagagattcaagaggatgttcgtcattcttcagataaaccagagtta
gctgcagtaacagaagaaccttctaatagaccaaagaagagaagtagacgtgcagcgcca
gcagacccgaatgcggcaccagcagatcctgcggcagccgctggaaatggtgcaactcca
gctggaaacgcagcgacatatacgccagcaacggatccaaatgctaacaatacaggccag
aatgcgccaaatgaagtgttaacttttgatgacaatggtattaatccaagtactaaccgc
tcagtaccttcagttacaattgtggacaatttaccaggtttcactctcattaatggtggt
aaagtcggtgtccttagtcacgcaatggtaagaacaagtatgtttgattctggagatgca
aagaactatcaagcacagggcaatgtcattgcattaggtcgtattagagggaatgataca
accaatcatgatggatttaatggtatagaaaaagcgttaacagtaaatccgaattctgaa
ttaatctttgaatttaatacgatgactactaaaaactatcaaggtatgacaaacttgatc
attaaaaatgctgataatgatgttgttattgcagaaaaagtagttgcgtatggtccaata
tggcgtttatttaaagtacctgaaaatgtcagtcatttaaaaattcagtttgttcctaaa
gacgatgccattacagatgcccgtggtatttatcaattaagagatggctataaatattat
gactttgtagattcaattggtctacattctggttcgcacgtttatgttgagagacgttct
atggatccaacagcgacaaataataaagaatttactgtaaccacatcattaaagaataat
ggtaattttgcagcatcattaaacacagatgattttgtctaccaaattcaattacctgaa
ggtgtagaatatgttaataattcattgactaaagacttcccaagtaataattcaggtgtt
gatgtgaatgatatgaatgtaacttatgatgcagccaatcgaattattacaattaaaagt
gctggcggtggtggaggaaattcagctgcgcgccttatgcctgataaaatattggattta
agatataagttacgtgtaaataatgttccaactccaagaacggttacatttaatgacaca
ttgacttataaaacttatactcaagattatattaatacacctgcagaaagtcatactgta
agtacagacccatatactattgatatcattatgaataaagatgcattgcaagccgaagta
gatagacgtattcaacaagcagattttacatttgcctcattagatatattcaatggttta
aaaagacgtgcacaaacgattttagatgaaaaccgtaataatgtcccattaaataaaagg
gtgtcgcaagcagatattgttgcattagcaaatcaaatgcagcatacattaattcgcagt
gttgatgctgaaaatgcagtaaaccaaaaagtaaatcaaatggaagatttagttaatcaa
aatgatgaactaacagatgaagaaaaacaagatgcgattcaagttatagaggaacataaa
aatgaaataattggtaatattggtgatcaaacgactgatgaaggcgttactcgtgttaaa
gatcaaggtattcagactttaagcggggatactgcaacaccggttgttaaaccaaatgct
aaaaaagctatacgtgataaagcggcaaaacaaagagaaattatcaataacacaccagat
gcaactgaagatgaaatccaagatgcattaaatcaattaacgacagatgaaagtgatgct
attgataatgtaacgaatgccacaacgaatgctgatgttgaaacagctaaaaataatggt
attaatactatcggcgcagttgttcctcaagtcacacataaacaagcagctagagatgca
attaaccaagcaacagcaacgaaacgacaacaaattaatgataatagagaagcgacgcaa
gaagagaaaaatgcagcattaaacgaattaacacaagcaacgaaccacgctttagagcaa
attaaccaagcaacaacaaatgctgatgtcgataatgcaaaaggtgatggtttgaatgcc
attaatccaattgctccggtaacagttgttaagcaagctgcaagggatgctgtttcacac
gatgcgcaacaacaaattgcaacaattaatgcaaatgctgatgcgactcaagaagaaaga
caagcagcgattgataaggttaatgcagctgtagcagcagcaaatacaaacattttaaat
gccaatacaaatgcagatgttgagcaagtacagacaaatgcgattcaaggaatacaggcg
attgaaccagctacaaaggttaaaactgatgctaaaaatgctattgaccaaagtgcagca
acacaacataatattatttttaataacaatgatgctacgcttgaagaacaacaagcagcc
caacaattacttgatcaagctgttacaacggcgaaacaaaatattaatgcagcagatacg
aatcaagaagtagcgcaagctaaagaacaaggtacgcaaagcattactgtcattcaacca
gcaacacaagttaaaacggatgctcgtaatgctgtaaatgaaaaggcaagagaagcaatt
acaaatattaatgcaacaccaggtgcaacaagagaagaaaagcaagaagcaatagatcgt
gttaatacccttaaaaatagagcgttgaatgatatcggtgttacttctacaacagcgatg
gtttatagtataagagatgacgcaataaatcaaattggtgcggttcaaccacatgtaacg
aaaaagcaaacagctacaggtgtattaaatgatctagcaactgctaagaagcaagaaatt
aatcaaaatacaaatgcaaccactgaagaaaaacaagtagcgttaaatcaagtagatcaa
gaattagcaactgtaattaataacattaatctagcagatacaaatgcagaagtagatcag
gcgcaacaagcagggacacaagcgattaatgctatacagcccaatatcgtaaaaaaacct
gcagcattagaacaaattaaccaacattataatgctaaattagctgaaatcaatcaaaca
ccagatgctacagatgatgagaaaaatgcagcaattaatactttaaatcaagagagacaa
caagcaattgaaagcattaaacaagcaaatacaaatgcagaagttgaccaagctgccaca
acagctgagaataatattgatgctgttcaagtagatgtagttaaaaagcaaacggctaga
aataaaattaatgtagaagcggctaaacgaatagaagttgttaaacaaacgcctaatgca
acagaagaagaaaaacaagctgcagtgaacaaaattaatcaatttaaagatcaagcgctc
aatcaaattaatcaagatcatacaaatgaccaagtagatgctactacaaaccaaatgata
aatgctatagataatgttgaagcagatgttgttgtgaaaccaaaagcaattgccgatatt
gaaaaagcttttaaagaaaaacaacaacaaattgataatagtattgattctactgataac
gaaaaagaagttgctactcaagcacttgctagggaaaaagaaaaagctctagcagcaatt
gatcaagcacaaactaataatcaagtaaatcaagtagcaacagatggattatctgcaatt
aaaattgtacaacctgaaactaaggtaaaaccagccgcacgtgaacaaattaatcaaaaa
gctaatgaactacgagctcaaattaatcaagataaagaagcgacagcagaagaaaaacaa
gctgcacttaataaaattaatgacttcgttaatcaagctatgtctgatattagtaataat
agaacaaatcaacaagttactgatacaaaaactcaagcacttgataacattgctcaagta
aatcctgaacatattgttcgagcggcagcaagagatgcagttaatcagcaatacgaagct
aaaaaacaagaaattgagcaagcagaacatgcgacggatgaggaaaaacaagtagcttta
aatcaattaactaataataaagaacgtgcattacaaaatattaatcaagctgtaactaat
gataatgtaaaacatgttgaaacaaatggtattgctactttaaaaggtgtagaaccgcat
attgtggttaaactagaagcacaacaggcaataaaggcgagtgcagataaacaagtagat
tctataaaagacacgcctgacgcaacagtagatgaaataaatgaagcgaatcagcttata
aaagatacacttcaacaaggtcaacagcaaattgataacacaaatcaagatgctgctgtt
acaggtgttagaaatcaaacgattaaagcaatagaagaaattaaaccaaaagagagacgt
aagcgtgcagcactcgataatattgaccaaacttcagacaatcaaatgaatactatacaa
aatactttagatactactgaagatgagcgaaatgatgctatccatgctttaaataaaatt
gtaaactcacttaaagaggctattgcacataatagtacgaatgctgaagttgatcaaaca
gagacatcgggacaagaaaacattaaagtgattataccaaaggttcaggttaaaccagaa
gcacgtcaagcggttaatgtgaaagcagtatctcaaaatgcacttatcgatcaaagcgat
ttatctacagaagaagaacgtcttgaagccaagcatttagttgaacaagcgttaattaaa
gctaaacaacagattgttagtgcagtgactaatgctgatgttgcatatttattacatgat
ggtaagaatgaaattcgtgaaattgaacctattattaatagaaaagcatctgctcgagaa
ctattaacaacattgctaaacgaaaagaaacaggcaatagaatcaaatgttcaagcaaca
gtggaagaaagaaatagtgtattagcagagttacaaaatatttatgatgcagcaatatta
caaattgaccatgatcgcagtaatgcccaagttgataaaacgacatcattaaatttacaa
gcaatacaagatttagatgtatatcctgttaaaaagccaaatgctgaaaaggaaatcaac
caagaagttgtacgtgtaaccaatttagtacaaagttatcgtaaagttagtgatcgtaat
aaatctgaagctttaaaagcgatagatgcactaaaattacaaatggaagaagaattaaaa
gcagcacataccaatgcagatgttgatgaagttttaaaacgatttaatgttgcactagtt
aatattgaagcagtcattacagaaaaggaaaatggattaatacgcattgaaaacatagcg
caacaaacttttaaaaaattcaaagctattgcaacgcctgaacaactcgctaaagtaaaa
gctttaattgatcaatatgttaaagatggcactcgtatgattgatgaagatacgacgttg
aatgatatcaaacaacatactcaatttattattgatgaaattttagcaataaaattacca
gctgaagcgaaagtggaattgccaaaagcaagaaagtcagcgccaaaagtatgtgagcca
aacaaaaaagaaggtaaggatgaagcacgaaaaattgaaaaagaacttccaaatacaggt
tttgaaggaatggagttacctttaaaagaaatggcactaattacaggtgcagcattgtta
gctagaagacgttctaaaaaagaaaaagaatcgtaa
DBGET
integrated database retrieval system