Staphylococcus roterodami: ML435_09225
Help
Entry
ML435_09225 CDS
T09562
Name
(GenBank) SAV1866 family putative multidrug efflux ABC transporter
KO
K24708
ATP-binding cassette, subfamily B, putative efflux pump [EC:7.6.2.-]
Organism
srot
Staphylococcus roterodami
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
srot00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
srot02000
]
ML435_09225
Transporters [BR:
srot02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
ML435_09225
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
RsgA_GTPase
ABC_ATPase
DUF2207_C
MMR_HSR1
NTPase_1
AAA_22
AAA_29
HUTI_composite_bact
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UMT75031
LinkDB
All DBs
Position
complement(1903282..1905018)
Genome browser
AA seq
578 aa
AA seq
DB search
MIRRYLQFVKPYKYRIIATIIVGIIKFGIPMLIPLLIKYAIDGVINNHALSANEKVHHLT
IAIGIALFIFVIVRPPIEFIRQYLAQWTSNKILYDIRKKLYDHLQALSARFYANNQVGQV
ISRVINDVEQTKDFILTGLMNIWLDCITIIIALSIMFFLDVKLTLAALIIFPFYILTVYV
FFGRLRKLTRKRSQALAEVQGFLHERVQGISVVKSFAIEDNEAKTFDKKNTNFLTRALQH
TRWNAYSFAAINTVTDIGPIIVIGVGAYLAISGSITVGTLAAFVGYLELLFGPLRRLVAS
FTTLTQSFASMDRVFQLIDEDYDIKNGIGAQPIEIKQGRIDIDHVSFQYNDNEAPILKDI
NLSIEKGETVAFVGMSGGGKSTLINLIPRFYDVTEGQILIDGHNIKDFLTGSLRNQIGLV
QQDNILFSDTVKENILLGRPTATDAEVVEAAKMANAHDFIMNLPNGYDTEVGERGVKLSG
GQKQRLSIARIFLNDPPILILDEATSALDLESESIIQDALEVLSKDRTTLIVAHRLSTIT
HADKIVVIENGHIVETGTHRELIAKQGAYEHLYSIQNL
NT seq
1737 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatcagacgatatttgcaatttgttaaaccttacaaatatcgtattattgcaacaatt
atcgttgggataattaagtttggaattccgatgttaattccattattaattaaatacgca
attgatggtgttataaataatcacgcattatcagcgaacgaaaaagttcatcatttaacc
attgcgattggaattgcactatttatttttgtaatagtgagaccaccaattgaatttata
cgtcaatatttagcacagtggactagtaataaaattttatatgacattcgtaaaaagtta
tatgatcatttgcaggctttaagtgccagattttatgctaacaatcaagttggccaggtg
atatcaagagtcatcaatgacgttgaacaaacgaaagattttattttaacaggattaatg
aatatatggttagattgcatcacaattattattgcgctatccatcatgttctttttagat
gttaaattaactttagcggcattaattatattcccattttatattttaacggtgtatgta
ttctttggaagattgagaaaattaactcgcaaaagatcacaagcattagcggaggtacaa
ggttttcttcatgagcgtgtacaaggcatatctgttgttaaaagttttgctattgaagac
aatgaagcgaaaacttttgataaaaagaatactaatttcttaacgcgtgcattgcaacat
acaagatggaatgcttattcatttgctgcaattaatacagtaacggatattggaccaatt
attgtaattggtgtaggtgcatatcttgctatttctggatcaattacagttggtacactt
gcagcatttgttggctatttggagttattgttcgggcctttacgtcgtttagttgcatca
tttacaactttaacgcaaagttttgcttcaatggaccgtgtattccaattaattgacgaa
gattatgacattaaaaatggtattggtgcgcagccaattgaaattaaacaaggtcgcatt
gatattgatcatgtcagttttcaatataacgataacgaagctccaattttaaaagatatt
aatttgagtattgaaaaaggtgaaactgttgcatttgttggtatgagtggtggtggaaaa
tcaacattgattaacttgataccaagattttatgatgtgacagaagggcaaattttgata
gatggtcataatattaaagactttttaacaggaagtttaagaaatcaaattggattagta
caacaagataatattttgttctctgatacagtaaaagaaaatattttactaggtcgtcca
actgcaacggatgcagaagtagtagaagcggcaaaaatggcgaatgcacatgattttatc
atgaacttgcctaatggttacgacacagaagttggtgaacgtggtgtgaaattatcaggt
ggacaaaaacaaaggttatcgattgcaagaattttcttaaacgacccaccaattcttata
ttagatgaagcaacaagtgctttagatttagaaagtgaatctattattcaagatgcatta
gaagtattgagtaaagatagaacgacacttattgtagcgcatcgcttgtccactattaca
catgctgacaaaattgtcgtaattgaaaatggacatattgttgaaacaggtacgcatcgt
gaattgattgcaaaacaaggtgcttacgagcatttatatagcattcaaaacttataa
DBGET
integrated database retrieval system
