Streptococcus ruminantium: SR187_6170
Help
Entry
SR187_6170 CDS
T05916
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
srq
Streptococcus ruminantium
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
DUF6531
TEN_YD-shell
LysM
SAM_Ribosomal_mS41
LysM1_NFP_LYK
WDR55
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBA92839
UniProt:
A0A2Z5TNK6
LinkDB
All DBs
Position
complement(1259154..1268675)
Genome browser
AA seq
3173 aa
AA seq
DB search
MMNMKKIRKLVSWLMLSTLLLTNSPLIYAREIQEIVETSQRQTYYNESVEEARKTTVGNE
NTITPSSTTQEQEETADDAGDAIQQPKVSEDSQSAEEAALRERYGAPILENGREQLYKVD
ETRFVTHIGSQAKTYLDHEGKEVPIDLSLYSYHADGKHYYLPKESPVNVVLPSQVNNETP
IDVVSQEKKISIYPLDKTYGHATVQDNAILYNNVDGTTDVQYTVQSNGVKEEIVLAKWEE
KNRFTYILDAGDYDVSLEVNQVLVRQRGKKDILFVLTAPMMVDAAGETSQDLKLELVKKE
GRYQITVVAGKEWLADSARQYPVRIDPTITVPRENILDSVTSTVHGQYQGLAYGYVGYMT
VDLMGMTGVPYVKDIGRSRMYFKVNYDFKQHIPSEAKIDSATLNLYEYTAPGNQGTQFGA
YRMTEDFDINTVTWNSSVNLGREIAGENAISTKKVGMHNFDIRDAVNGWVQGLYPNYGLV
VAATDEDADGGAFYTTEATASNAGQIGFTSDKAPSLTIHWSVPDPADVHYAIGDTTINLR
TMVKTDRSGKLQFQGVLADGLTSPAAQVSYQLSDPAKNYSGQSTASFSYKYPDTSSFISA
FEKGTTQYKDKLSNWQTLVPFTEPDLNTLYTIDAESQKEGQTSGKKTSDSFIIYKVTQYD
TLPKIASYYGVSLDQIAFDNRIQDMLLVKNNTLFIRNPKQNAKTPYNPPVLNDKTKADVD
MLLMGRGLHCEFGFEPINLNTGNFFLERTDVAISDLGGDFAIIRHYNSKAAGMNSLFGRG
WSFAFNEQLSLDEEGNLYYTRMDGSILIFTKEGDTYKAPEGYDLTLTVKELETKKADFGN
GEEEYAVKEYHIKDSNQKEKIFNFHGQLIRQIDEKGNKTDLEYNEQAQLRKIVSPTGITY
GIILNDSGYIGAIQLPNGATLAYEYDEAGNLIAYTDAAGAKTRYDYDDKGRMTAWYDANG
TKIVENVYDDQNRVTQQTDGTGAVSTLSYSDGQTVTTDANGQQTTYTYDTFYRTKGISYP
DGSSVSKTYDSNNRLASKTNELGQTTSYTYDSQGNILTETRFDGAVKTSTYDRNNHLLSV
TDFAGHTTSHTYDNKGNLLSTTLADGSTIAYTVDEQGRILSTKDARGNTVQLAYDGAKLV
KVTNSAGGVTTLAYNAHNQVTTITNPRGGVTTFTYDAEGRKLSEKDADGVGTSQTFDPAG
QVITVTEGNGNISTFSYDALGRKIAANNGEGGNYSYSYDGVGNLLSQTDAEGHTTTYSYD
SRGRLLTETNAGGQTVTYSRDALGRVLTRTNEAGQTRTYTYDEAVNQIATVTDALGQVTT
YSYDKAGNQVRTKYPIGTSTSSSYDSLGRLLNHTDQAGQTVTYTYDAVGNKLTESLGERT
TSYVYDALGNVTTIHYPDQTSISYSYDAMGNVLERVDAKGLKTSYAYTAAGRLTSTTNAL
GQTTNMTYDANGNQNSLTDAAGYTASSRYTGQNKVAQVVDALGHTTNFAYDQMERLIEKT
DALGGKTVYRYNELGYVTQVINPNGHATQLTYTPTAQVKEIIRADGTSTLNEYDALDRLV
KQSQSSGLITEYSYDAANRVITAKDNQSLNETYTYDAAGNRLTTTNSLGQTTSRTYDAYN
QLTTVTYADGRSESYTYDEVGHLVTKTDVEGHKTSYHYDENGNLNKTVDHLGRTTSYAYD
PLNRVVTKIDPEGHKTRYEYDVLGHVASVTDANGHQTTYGYDANENLILYKDPNGQETVL
KYDPLGRLTETIAPTGASQTYTYDAVGNRLSETTGEGNTTIYSYDALNRLASMTKPTGGK
TSYTYDKTGSIATETDPNGGVTTYVNDLYGRATRRTLSNQATFSYAYDALGRLEKQTAPQ
GLSKSYTYDVSGNLITETDQSNRTTKYTYDIAGRLLSEKNTLDLETKYSYDASGNLASIT
APSGAKTSLSYTKLDQLKTITTPTGRETEQSYDPVGQVTKRTINGKRKETYTYDPNGNLQ
EVVNALGQVSKRSYDVGNRLIAETDTGGKITLYSYDKDNRLTKVTSPTGASSSLSYDGNG
NLTSVLSGSKRISSYTYDLKDQLLTATKGSGDKASTSSYTYDSVGNLTSVTNGNGQVTKY
SYDQLGNVIKKMTALGDVESYTYDLNNQLSQVKKADGQTIRYDYNKLDQLLTKKTSVKSE
GQVLYAYDADGRRVAMSDLTGQTRYAYNEEGELIGVRQGDGSLIAYTYDDYGNVTKLTYP
DGSEVTYSYDALDRLTKVTNRDGNVTTYTYDKSGDMVKIERGDGTTSKLTYDAAHRVKEM
IHRDKKHKVISSYAYEYDDGNYIAKETITQDGETLIQAYSYDSLGQISTMMISNKAGKEL
SKFSYTYDQAGNKLTSTEEVEGKSTRTSYTYDANNRLLEMKTGDKTTTYQYDKNGNRTAS
GEGDAKLNYIYDTENRLLAVKDKEGLLFAALYDGDHNRVFTASRTQATHHYQLFKRKPAD
KKRKSPYTASSGKEHSLFWYGFTQNVIQFFSSFATSEGYDWIATFDTVSNAYHQKVAKDR
ASKEGLVVHPPSADHLPGESPVVYSSEVQEVLIPYTTKKDTYHYYETRNYVNDVNRQHTQ
VLQTYDAQLKKRETYTYGRERSNYRNESTGKSYFYLTNQSASVTGLTEHGEAVASSSYGL
YGATKQTTDQTGQPFAYNGEARDVTGLDYLRARYYDSQTGTFLTADSYQGSRTDPLSHNL
YTYVQNNPANYTDPSGHYGSPFAMMEGGGGRPVRGYSQPKPLMNPTDGTLYAPSTPEHRA
HQVRQQQTQIYSYNYTPSPNAPRTSYQQTLWQQAQAQRSISNAWEQAKTIGQSVYDWGAS
RTREATNIVRNWTKSLEETITHVCTTAERWVEAGVNFLRNVDWKAVGITAAATVVAVAAT
AATAGAAAPVIAGVVGAGGLGLTGATATVTTGMAVGAVSGAVGGGSYAFTSGVLSGKQAG
SIVKDVGSSILGGATTGLFTGGLLSGLGGATSGIGNALGRQAADTVIETAVDTVVDAAQG
GNISPASIGTSLAINAITEGVSSKTVKGQKGDVSSHKDALLTQQIPNLGKNTPKTDFYVA
PDSIVRSPQHQTIQNIIEDLPDISINTYGFKNYQSKGGYEQVLKDFDNINLTDIKEFTIP
GNKGMGKVGYMEDGTKVVARSWSSNASSNSPTLEIQYEDSSIPDRGIKIRYWE
NT seq
9522 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgaatatgaaaaagataagaaaactagttagttggctgatgctatcaaccctcctg
ctgactaacagcccgctaatctatgcgagggaaattcaggaaattgttgaaacttcgcaa
cgccagacttattacaatgagtcggtggaagaagcacgtaagacgacagttggtaatgaa
aatacgataactccttcatctacgactcaagaacaggaagaaacagcggacgatgcaggg
gatgccatccaacagcctaaagttagtgaggatagtcagagtgcagaagaagcggctctg
cgtgagcggtatggtgctccaatcctcgaaaatgggagagaacagctctacaaggtggat
gaaactcgctttgtgacccatatcggtagtcaggctaagacctacttggatcacgaaggg
aaagaggttccgattgatttgagtctttactcttatcatgcagacgggaagcactactac
ctaccaaaagaatccccagtcaatgtggtcttaccttctcaagtgaataatgaaacaccg
attgatgtggtcagtcaggagaaaaagatttctatttaccctttggataaaacttacgga
catgcaactgtgcaggataatgctatcctttacaataatgttgatgggacaacagatgtt
cagtatactgtccaatcaaatggggtcaaggaagaaattgttctcgccaaatgggaagaa
aagaaccgattcacctatattttagatgcgggagactatgatgtgtctctggaagtcaat
caagtcttggttcgtcaaagggggaagaaagatatcctttttgttctgactgcacctatg
atggtagatgcggctggtgagactagtcaagatttgaaactggaattagtaaaaaaagag
ggacgctatcagattactgtcgttgctggaaaagagtggttggcagacagtgctcgtcaa
taccctgtacggattgatccgactatcacagttcctcgtgaaaacattcttgactctgtt
actagtactgttcatggtcaataccaaggtctggcctatgggtatgtaggatatatgacg
gtcgacttgatggggatgacaggtgtaccttatgtcaaagatatcggccgtagtcggatg
tattttaaagtaaactatgactttaaacaacatattccatcagaagctaagattgatagt
gctacactaaatctctatgagtacacggctccaggaaatcaaggaacgcaatttggtgcc
tatcgtatgacagaagacttcgatatcaatacagtgacatggaattcttctgttaatcta
ggtcgagaaattgcgggcgagaatgctatttcaactaaaaaagtggggatgcacaacttt
gatattcgcgatgcggttaacggatgggtacagggactctatcctaactatggtttggtc
gttgcagctacagatgaagatgcagatggtggtgctttttatacgacagaagcaactgcc
tccaatgcgggacagattggttttacctctgacaaggctccaagtttgacgattcattgg
tcagtacccgatccagcagatgttcattatgctatcggtgatacgacaattaacctgcga
acgatggtcaaaacagataggtctgggaagctccagtttcaaggagtccttgcggatggt
ctgactagtcctgcagcacaagttagttaccaattgagcgatcctgctaagaattatagt
ggccagagtacagctagtttctcgtataagtatcctgataccagctcttttatctccgct
tttgaaaaaggaaccactcagtacaaagataagttatcaaactggcagaccttggtacct
tttacagagccagatctcaatactttgtatactattgatgcagaaagtcagaaggaggga
caaactagcgggaaaaaaactagtgattctttcattatttacaaggtcactcaatatgat
accttgcccaagatagcgagttactacggagtttctctcgatcagattgcctttgacaat
cggattcaagatatgttgctggttaaaaataataccctctttatccgtaatcctaagcaa
aatgctaagactccctacaacccgcctgtcctaaatgataagacaaaggctgatgtagat
atgcttttgatgggacggggactgcactgtgagtttggttttgaaccgattaacctcaat
acggggaactttttcctagagcggacagatgtagctatttctgacctaggtggagatttt
gccattattcgtcattataactccaaagccgcaggaatgaatagcctctttggtcgtggc
tggtcttttgccttcaacgaacagctatcccttgatgaggaaggtaatctttactataca
cgcatggatggttcaatcctgatattcactaaagaaggtgatacatacaaggctccagaa
ggatatgatttgaccctgactgtcaaagagttagaaactaaaaaagctgattttggcaat
ggcgaggaagaatatgcagtcaaggaataccatatcaaagatagcaaccagaaagaaaaa
atctttaatttccatggtcaactgattcgtcagatagatgaaaaaggaaataaaaccgat
ctagaatacaatgaacaggcacagctaagaaagattgtatctccaacaggcatcacatat
ggtatcatcctgaatgactctggttatatcggagctatccagttacccaatggtgcaacg
ttagcctatgaatatgatgaggccggtaatctgattgcctacacagatgcagcaggagct
aagactcgctacgattatgatgacaagggacgcatgacagcctggtatgatgcaaatggt
accaaaatcgtcgagaatgtctatgatgatcaaaaccgtgtaacccaacaaacagatggt
acaggtgcagtttctaccctttcttacagtgatggacagacagtgacgactgatgctaat
gggcaacagacgacttatacttatgatacattttatcggacaaaagggatttcctatccg
gatggaagtagtgtaagcaaaacttatgatagcaataatcgtttggcaagtaagaccaat
gagttgggacaaaccactagctacacctatgatagtcaaggaaatattctcacagagacc
cgttttgatggtgccgttaagacctctacatatgatcgaaacaaccatctgctttctgtc
acagattttgcagggcatacgactagtcatacctacgataataagggcaaccttctttct
acgactttagcagatggctcaaccatcgcctataccgttgatgagcagggacgaattctt
tctacaaaagatgctcgtggcaatacggttcaactagcttatgatggtgctaaattagtc
aaagtgaccaattcagctggtggtgtcaccacacttgcttataatgctcacaatcaagtc
accaccattaccaatccacgtggtggagtgactacttttacctacgatgccgaagggcgt
aaactgagtgaaaaagatgcggatggtgttggtactagtcagacttttgacccagcaggg
caggtcattactgtgacggaaggtaatgggaatatcagtacctttagctatgatgcgctt
ggtcgtaagattgcggccaataatggtgaaggaggtaattatagttacagctacgatggg
gtgggcaatctccttagccagacggatgcggaagggcatacgactacctatagctatgac
agtagaggacggttattaacagagacgaatgctggtggacagaccgtgacctacagtcga
gatgcgctggggcgagtcttgacacgaaccaatgaagcgggtcagacaagaacctacacc
tatgatgaagctgttaaccaaattgcgactgttacagatgcccttggtcaagtgaccacc
tatagctatgataaggcgggcaatcaggttcgtaccaagtaccctatcggcactagcacc
tctagcagctatgactcacttggacgcctcctcaaccatacggaccaagccggtcaaaca
gtaacctatacctatgatgcagtgggcaataaactcacagaaagtctgggagagcgtacg
accagctatgtttatgatgcgcttggcaatgtgacgaccatccactatccagatcaaacg
agtatttcttacagctacgatgccatgggcaacgttctggaacgagtggatgccaaaggt
cttaaaaccagctatgcctatactgccgcaggccgtttgaccagtacgacaaatgcactc
gggcaaacaacaaacatgacctacgatgccaatggaaatcagaatagcttgaccgatgct
gcaggttataccgctagttcccgttatactggtcagaataaagtggcacaggttgtagat
gcccttggtcacacaaccaactttgcctacgatcagatggagcgcttgatagagaaaaca
gatgctctaggaggaaagactgtctatcggtacaatgaattaggctacgtaactcaagtt
attaatccaaatggacatgcgactcagctaacctatacaccgactgctcaagttaaagag
attattcgagcggatggtacaagcaccctcaatgaatatgatgccctagaccgcttggtg
aagcaaagtcaatctagtggactcatcaccgagtatagttacgatgctgccaaccgtgtt
attacagctaaggataaccagtccttaaatgaaacctatacttatgatgctgcaggtaac
cgtctcacaacgaccaatagtctcggtcagacgacaagtaggacctatgatgcttataat
cagttgactacagtcacctatgcagatggtcgtagcgaaagctatacctatgatgaggtc
ggtcatctggtgacaaagacagatgtagaaggtcataagaccagctatcattatgatgaa
aacggtaatctaaataagacagtggaccatctcggtcggacaaccagctacgcctatgat
ccgctcaaccgtgttgtcaccaaaatagatcctgaaggacacaaaactcgttacgaatac
gatgtgttgggacatgtcgcaagtgtaacggatgccaacgggcatcaaactacctacggt
tatgatgccaatgaaaatctgattctttataaggatccaaatggtcaagagacggtattg
aaatacgatccactcggtcgcttgacagaaacaattgcaccaacaggtgccagccaaacc
tatacttacgatgcagtgggtaatcgtctatctgaaacaacaggcgagggtaacaccacc
atctatagttacgatgcactcaatcgtctggctagtatgaccaagccaacaggtggaaaa
accagttatacctatgataaaacaggaagtattgccacagagaccgatccaaacggtgga
gtgacaacctatgtcaatgacctctatggccgtgcgactcgtcgtactctatccaatcaa
gccacatttagctatgcctatgatgctcttggtcgtttggagaagcagaccgctccacaa
ggactttctaagtcttatacttatgatgtttcaggtaacctcatcacagagactgaccag
tcaaacagaacgactaaatacacctatgatatagctggtcgtctcctatctgaaaagaat
acactggaccttgaaacgaagtatagctatgatgcttctgggaatctagcaagcattact
gcaccaagtggtgctaagactagcctatcctatactaagttggaccaactcaagaccatc
acaacaccgacaggtcgtgagacggaacaaagctatgaccctgtaggtcaagtgaccaaa
cgtactatcaatggcaaacggaaggaaacctacacctacgatccaaacggtaacttgcag
gaagtcgtcaatgctttgggacaagtgagtaagcgtagctatgatgtaggcaatcgcttg
atagctgaaactgatacgggagggaaaatcactctctacagctatgataaggataatcgt
ctgactaaggtcacaagcccgacaggagcaagcagcagcctgtcttacgatggcaatggc
aacttgaccagtgttctatccggaagcaaacgcatctctagctatacctatgacctgaaa
gaccagctcttgacagcgaccaagggaagtggagataaggcctcaacgagtagctatacc
tacgacagtgtgggcaaccttacctctgttaccaatggcaatggtcaagtgaccaaatac
agctacgaccaattaggcaatgttatcaagaagatgacagcgttgggagatgttgaaagc
tacacctatgacctcaataatcaactctctcaagtcaagaaagcggatggacagactatc
cgttatgattataataagctagaccaactcctaaccaaaaagacatctgtcaagtcggaa
ggtcaggttctctatgcctatgatgcggatggtcgcagagtagctatgagcgacttgacg
ggtcagactagatacgcttataatgaagagggcgagttgataggagttcgtcagggagat
ggcagcctcattgcctacacctacgacgactatggtaatgttactaaactaacctatcca
gatggtagtgaggtaacttacagttatgatgctcttgatcgtttgactaaggttaccaat
cgtgatggtaacgtcactacctacacctatgataagtctggggacatggtcaagatagag
cgtggagatgggacgactagcaagttgacctacgatgcggcacatcgggtgaaggaaatg
atccatcgggataagaagcataaggtcatctccagctatgcttacgagtatgatgatggt
aattatatcgccaaggagaccatcacacaggatggggaaacactcattcaagcctatagc
tacgacagtttggggcaaatctccaccatgatgatttcaaacaaggctggtaaggagtta
agtaagttcagctacacctacgaccaagcaggaaacaagctgacaagcacagaagaagta
gagggcaagtcaactaggacgagctatacctatgatgccaataatcgtctgcttgaaatg
aagacgggcgataagaccactacctatcagtatgataaaaatggcaaccgcacagcttct
ggcgaaggggatgccaagctgaactacatctacgatacggagaatcgtctccttgcggtc
aaggataaggaaggtctcctctttgcggctctctatgatggagatcataatcgtgtcttc
actgctagtcgaacacaggctacccatcactaccaacttttcaagcgtaagcctgcggat
aagaagcgtaagtctccatataccgcatcaagcgggaaagagcacagtctcttctggtat
ggtttcacacaaaatgttatccagttcttctctagctttgcgactagcgagggctatgac
tggattgcgactttcgatacggtatcgaacgcctatcatcagaaggtggcaaaggatcgg
gcaagcaaggaaggtttagtagttcatccaccgagtgcagaccatctgccgggagagtct
ccagtggtctactcaagcgaggttcaagaggttctgattccttacacgaccaagaaagac
acttatcactactacgagactcgaaactatgtcaatgatgtcaaccgccagcacacacag
gtcctccagacctatgatgcacaactcaagaagcgggagacctatacctatggtagggaa
agaagcaactataggaatgaaagtacaggcaagagctatttctacctaaccaatcaatct
gcttctgtgactggtctgactgagcacggggaggcagtcgcttccagcagctatggtctc
tatggtgccaccaagcagaccaccgatcagactgggcaaccgttcgcctacaatggtgag
gctagggatgtcacgggcttggattacctaagggccagatattacgatagtcagacgggg
actttcctgacagcggacagttatcagggcagtcggacagacccactcagtcacaacctc
tacacctatgtgcagaataaccctgcaaactatactgacccgagtgggcattatggttca
ccgtttgccatgatggaaggtggtgggggtcgccctgtcagggggtacagccaaccgaaa
cctctgatgaaccctacagatggcaccttatatgctccatccacaccggagcatagggct
catcaggttcgccaacaacagacccagatttattcctacaactacacaccatctcctaac
gctcctagaaccagctaccagcagaccttatggcaacaggctcaagcccaaaggagtatt
tccaatgcttgggaacaagccaagaccatagggcaatcggtctatgactggggagcttca
aggacaagagaggccaccaatattgtgcgcaactggaccaaatccctagaggagaccata
acgcatgtctgtacaacagccgagcgctgggtggaagcgggcgttaacttcctgaggaat
gtcgattggaaagctgtggggattaccgcagccgccacggttgtcgcagtcgcagcgacc
gccgcaactgctggagcagctgccccagttattgctggggtagttggtgcaggaggttta
ggcttgacgggtgccacagcgactgttacgacaggtatggctgttggagcagtcagtggc
gcagtgggtggaggttcctatgcctttacctcaggcgttctttcaggtaaacaagccggt
agtatcgtgaaggatgtaggcagcagtatactcggaggagctacaacaggcctatttacc
ggtggtctgctaagcggtctaggaggagctacctcaggcattgggaatgcgctaggccgc
caagcagcagatactgtcattgaaaccgcagtggatactgttgtggatgcggcccaaggt
ggcaacatcagcccagccagcattggaacaagcctagctatcaatgccataacagaaggt
gtctccagcaaaactgttaagggacagaagggggatgtgtcttcacacaaggatgcgctc
cttactcagcaaatacctaaccttggtaaaaatacgcccaagacagatttttatgtagca
cctgatagtatcgttaggtcgccgcagcatcagactatacagaatattatagaggacttg
ccagatatctcgattaatacatatggttttaaaaactatcaatctaaaggaggatatgag
caagttctaaaagattttgataatatcaatttgactgatatcaaagaatttacaattccg
gggaataaagggatgggtaaggtaggatatatggaagatggtaccaaagtagtcgctcgt
tcttggagttcaaatgcatcatccaattctccaacattagaaattcagtatgaagatagt
tcaattccagataggggaataaaaattagatattgggagtag
DBGET
integrated database retrieval system