Spiroplasma sabaudiense: SSABA_v1c00800
Help
Entry
SSABA_v1c00800 CDS
T03048
Name
(GenBank) ribose/galactose ABC transporter permease
KO
K23535
general nucleoside transport system permease protein
Organism
ssab
Spiroplasma sabaudiense
Pathway
ssab02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ssab00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
SSABA_v1c00800
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ssab02000
]
SSABA_v1c00800
Transporters [BR:
ssab02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
Saccharide, polyol, and lipid transporters
General nucleoside transporter
SSABA_v1c00800
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
BPD_transp_2
Ntox1
PEX14-like_2nd
T3SS_basalb_I
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHI53492
UniProt:
W6A902
LinkDB
All DBs
Position
92613..94676
Genome browser
AA seq
687 aa
AA seq
DB search
MDFKIDSWLMREKLKISLKSDKTKTKLKYIKASALALTFGIVLGIIIIFANGYNGIGYFF
ELFKVSFNTIKFGNGQSDFDRMMSHFSSYIILALGLAMAFKLGLFNIGGSGQAVLGAGLS
IILVAEMEKSTGISFATVGGSYIVVIFLIFVLSAATVSALAGVLKVFFNIHEVVTTVMMN
WTIWYFIRWIIMRNSEDYISTNQETKAFDHNWISIGGNQWILGIILAIVCVGIVFFVLTF
TTFGYKYNVVGKQHEAAKYAGINNKSFVIVATAISGALIGIAAFIYYISIEKKIGYATNT
LPTFGFDGISIALVAFNNIFGIIPISFLWAVIKSSATAATGNPLYNGLSNEAASLMFGAV
IYGAAIYSVFYRFVPIQKIKFRIYQAMDFKTKIEYKKNLATIKDYKQEINSIKNERNAAL
KLVPKVEKKLEKNQNDISYLLTPKEIAAAPFNDRISIIKSKINSLKVLNKIIWEEGYQIY
LNNGLRGIKTWKQKNDNLILGTTLDELTEFVIERNHKVLQSKKTFKQFLKHSEQMNDSKL
DDAILKQNAKQKHGVENAEQELLDKTIAINTDFKESLMDYKLRRDLEIKNAKQEAAVAGE
KSVIAYNKVIKVNNENYKLMLESVKKEYEVIEENLKSQLQELKSIYQKDLEIAKGDNQKI
KDLKDNYEKNLMNLKAQSFEKKMEVKY
NT seq
2064 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattttaaaattgatagctggctaatgcgagaaaaactaaaaatttcgctaaagtca
gataaaacaaaaaccaaactaaagtacattaaggcttctgcccttgctttaacttttggt
atcgttcttggaattattatcatttttgcaaatggttataacggaatcggttactttttt
gagttattcaaagtttcttttaacacaatcaaatttggaaatgggcaatctgatttcgac
cgaatgatgagtcacttttcatcttatatcattttggcattaggattagccatggcattt
aaactaggactatttaatattggtggttctgggcaagctgttttgggtgctggtctttca
atcatccttgtagctgaaatggaaaaatcaactggaatttcttttgccacagttggggga
agttatattgtagtaattttcctaatctttgtattatctgcggcgacagtgtctgctctt
gctggagttttaaaagtatttttcaacattcatgaagttgtaacaactgttatgatgaac
tgaacaatatgatactttattcgctgaatcatcatgagaaattcagaagattatattagt
acaaatcaagaaaccaaagcttttgatcacaattgaataagcattgggggtaaccaatga
attcttgggataatcctagcgattgtttgtgttggaatagtattctttgttttaacattt
acaacttttggttataaatacaacgttgtaggaaagcaacatgaagcggctaaatatgct
ggtattaataacaaatcttttgttattgtagcaacagctatttcaggggctttgatcgga
atcgctgcttttatctattacatttcaatcgagaaaaaaattggttatgcaactaacacg
cttcccacatttggttttgatggaatatccattgcacttgtggcctttaataatattttt
ggaataattccaatttcattcttatgggctgtgattaagagttctgcaacagcagcaacg
gggaatccattatataatggactttcaaatgaggcagcatcactgatgtttggagctgta
atttatggggcagccatttactcagtcttctaccgctttgtaccgattcaaaaaattaag
tttagaatatatcaagcaatggatttcaaaactaagatcgagtacaaaaaaaaccttgca
acaatcaaggattataaacaagaaattaacagtattaaaaatgaacgtaacgcagcttta
aaattagtacctaaagttgaaaaaaaattagaaaaaaatcaaaatgatatcagctactta
ttaactccaaaagaaattgccgcagcaccatttaatgatcgtataagtatcattaaaagc
aaaatcaattctctaaaagttttaaacaaaattatttgagaagaaggatatcaaatttac
ttaaataatggactacgcggcataaaaacttgaaaacaaaaaaatgacaatttaatctta
gggacaacattagacgagttaactgaatttgtaattgaaagaaaccataaggttttgcaa
agcaagaaaacctttaaacaatttttaaaacattcagaacaaatgaatgattcaaaactt
gatgatgctattttaaaacaaaacgccaaacaaaaacatggggttgaaaatgcagaacaa
gaattgttggataagacaattgccattaacaccgactttaaagaatcgcttatggattat
aaattacgtcgcgatttagaaattaaaaatgctaagcaagaagctgcagttgcgggggaa
aaatcagttatcgcctacaacaaagttattaaagtcaataatgaaaattataaattaatg
ttagaatcggtaaaaaaagagtatgaagtaattgaagaaaatttgaaaagccaattgcaa
gaattaaaaagtatttatcaaaaagatttagaaattgcaaaaggtgacaatcaaaaaatt
aaagatctcaaagataactatgaaaaaaatcttatgaacttaaaagcccaaagctttgag
aaaaaaatggaggtgaaatattaa
DBGET
integrated database retrieval system