Spiroplasma sabaudiense: SSABA_v1c03290
Help
Entry
SSABA_v1c03290 CDS
T03048
Name
(GenBank) ATP-dependent RNA helicase
KO
K18692
ATP-dependent RNA helicase CshB [EC:
5.6.2.7
]
Organism
ssab
Spiroplasma sabaudiense
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ssab00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
ssab03019
]
SSABA_v1c03290
03009 Ribosome biogenesis [BR:
ssab03009
]
SSABA_v1c03290
Enzymes [BR:
ssab01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.7 DEAD-box RNA helicase
SSABA_v1c03290
Messenger RNA biogenesis [BR:
ssab03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Helicases
SSABA_v1c03290
Ribosome biogenesis [BR:
ssab03009
]
Prokaryotic type
rRNA helicases
SSABA_v1c03290
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
Helicase_C
ResIII
Flavi_DEAD
AAA_19
PhoH
AAA_22
Cas3-like_C_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHI53740
UniProt:
W6AA77
LinkDB
All DBs
Position
361239..362606
Genome browser
AA seq
455 aa
AA seq
DB search
MSFEKFGFKKFINDALKSINFLEPTSIQDKVIPKIKKYNNIVAQAHTGTGKTHAFLLPIL
NNIDILEKKVQAVIITPTRELARQIYANVNEILNFNSEITKACFIGGQDITKQQESLSKV
QPMVVVGTPSRLKELYENGSLKITTTKFLVIDEFDMIFDLGFIEEIDLLLSRINENVNIS
LFSATLPNELKPFLVKYLNNALFIDDSKNKPSNKNIEHALIWTKNRENQTVFNNLISSIN
PFIVMIFVNRKDQVKNVVSWLKELDITNVGELHAGLDPRMRSSMQKRIQNNEFKYIVATD
IAARGLDINGVSHVISIDLPNDLSYYIHRSGRTGRNNFNGQSFVLHNSDNQNSIDDLRKI
GVEFVNYKFIENKLVETTIKTKKPKFYNPNSPGEIASKKVVAKYKKDKVKPGYKKKRKAE
LAEIKRKIRRDHIKENISKIKKAKYQKRREEIFED
NT seq
1368 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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DBGET
integrated database retrieval system
