Spiroplasma sabaudiense: SSABA_v1c04520
Help
Entry
SSABA_v1c04520 CDS
T03048
Symbol
pepF2
Name
(GenBank) oligoendopeptidase F
KO
K08602
oligoendopeptidase F [EC:3.4.24.-]
Organism
ssab
Spiroplasma sabaudiense
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ssab00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01002 Peptidases and inhibitors [BR:
ssab01002
]
SSABA_v1c04520 (pepF2)
Peptidases and inhibitors [BR:
ssab01002
]
Metallo peptidases
Family M3
SSABA_v1c04520 (pepF2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_M3
Peptidase_M3_N
DUF7748
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHI53859
UniProt:
W6AJG3
LinkDB
All DBs
Position
510652..512451
Genome browser
AA seq
599 aa
AA seq
DB search
MNRNKAAKKYKWDFSKLYKTKPEFLEDLEFLSLNYRTQTLFKGLLKNYEDFRDFDVVSEQ
GNKISARLEQYLKILEVEPHNKLALELQAAYEKELEVFDGQFAWIEEEIKAIGETQIMEW
LKTDPKWIPYAKSYQKFFKNLKYLLPESQRILLSKVSKSSELAYEMYETLKWKDNDVKYF
FHNQKKYLLTQNNLTNILEESRPIEDQEVRALAIRKFHENDYNNKHALAKIYENIVKEET
ESLKLIGMKHFSEQFFDDENITETEFLNLVDFASKNSDVYFEYYKMIKDVLGFQDKFYGS
DASLTLVKTKGNKIKLKSGIKIIKQALLPLGKEYGEALANCFKENRIDYFESPHKSSGAF
TTFSYDYGSLISINWQDNFSSLMTLTHELGHAVHSELAKQSQPKPLNCFNNIIAEVASTL
NEQILLDFWLKKNKSSAVRINLLKERVEFIFNNFFSGIEESYFEYLCFQAVDKEEVLTSE
KLIEIQKIAVKKVFNKNSFDSYDDKIKAISWSFSSHIFEQPFYLYKYALSLVMSLKLFQE
YENSNFEIINNFLKEGGNLPPQELFKKYGVDIKDSKSYEPLISYLKKLVDEIKTYFDAN
NT seq
1800 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatagaaacaaagcggcaaaaaaatacaaatgagacttttcaaaattatataaaaca
aaacctgaatttttagaagatttagaatttttgtcgttaaactatcgcacacaaactctt
tttaaaggcctactaaaaaattatgaagattttcgtgattttgatgtggtttctgaacaa
ggaaataaaatcagtgctcgattagaacaatacttaaaaattttggaagttgaacctcat
aataaattagcattagaacttcaagcagcatatgaaaaagagcttgaagtatttgatggg
caatttgcatggattgaagaagaaattaaagctattggtgaaactcaaattatggaatgg
ctaaaaactgatccaaaatgaattccttacgctaagtcttatcaaaaattttttaaaaat
ttaaaatatttattacctgagtctcaaagaatattactttcaaaagttagtaagagcagc
gaactggcatatgaaatgtatgaaactttgaaatgaaaagataatgatgttaaatatttt
tttcacaaccaaaaaaaatatttgcttacccaaaataatctaacaaatattttagaagaa
agtcgcccaatagaagatcaagaagttagagcattagcgattcgcaagtttcatgaaaat
gattataacaataaacatgctttggcaaaaatttatgagaacattgtcaaggaagaaact
gaatcgcttaaattaatcggtatgaaacatttctctgaacaattttttgatgatgaaaat
attacagaaaccgaatttttaaacttggttgactttgcaagtaaaaacagcgatgtttac
tttgaatattataaaatgataaaagatgttctaggctttcaagataagttctatggtagc
gatgcatctttgactcttgtcaaaacaaagggcaataaaataaaattaaagtcgggaata
aaaatcattaaacaagcactgttgcctttaggaaaagaatatggggaagctttagctaat
tgttttaaagaaaataggattgattactttgagagtccacataaatcaagtggggcgttt
acaactttctcatatgattatggttctttaatttcaataaattgacaagataacttttca
agtttaatgaccttgacccatgaactaggtcatgctgttcatagtgagttggctaagcaa
tcacaaccaaagccattaaattgttttaacaatattattgcagaagttgctagtacttta
aatgagcaaattttgctagatttttgacttaaaaaaaataaatcaagtgcggtaagaatt
aatttattaaaagaacgagttgaatttatttttaataatttctttagtggaattgaagaa
tcatattttgagtatctctgttttcaagcggttgacaaagaagaggtcctaacatctgaa
aaacttattgaaatacaaaaaattgctgtcaaaaaagtgtttaataaaaattccttcgat
agttatgatgataaaattaaagcgatttcttgatcttttagcagtcacatttttgaacaa
ccattttatctatataaatacgccttaagtttagtaatgagtctaaaattatttcaagaa
tatgaaaatagtaattttgaaataattaacaactttttaaaggaaggtggcaacttgccc
cctcaagaactatttaaaaaatatggggtcgatattaaggattctaaaagttatgaacca
ttaataagttatttaaaaaaactcgtagacgaaataaaaacttacttcgatgctaactaa
DBGET
integrated database retrieval system