Spironucleus salmonicida: 94294824 Help Entry 94294824          CDS       T10465                                  Symbol SS50377_20801 Name (RefSeq) Beta adaptin   KO K12392   AP-1 complex subunit beta-1 Organism ssao  Spironucleus salmonicida Pathway ssao04142   Lysosome Brite KEGG Orthology (KO) [BR:ssao00001]  09140 Cellular Processes   09141 Transport and catabolism    04142 Lysosome     94294824 (SS50377_20801)  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    04131 Membrane trafficking [BR:ssao04131]     94294824 (SS50377_20801) Membrane trafficking [BR:ssao04131]  Endosome - Golgi transport   Others    AP-1 complex     94294824 (SS50377_20801) BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  Adaptin_N Cnd1 HEAT_2 PDS5 INTS1_R4 Motif Other DBs NCBI-GeneID:  94294824 NCBI-ProteinID:  XP_067768221 LinkDB All DBs Position 1:1176211..1179150 Genome browser AA seq 979 aa AA seqDB search MVKSEPVPQEIIDWREALSNPKSIEKTMQEIVKAMSNGFDVSPLFSDVLKHMQTTNLKLK KLIYIFLTSNAYQNSNYTLLVVNGVENDSHNESPFIRALAIRAMGAIVTADVAEHFCQSF TRFASDLDPFVRKTTCPAIAKLYKVNPQLCTDTNLVQVLRSLIFDSNTAVVSAATASLVT VYSSTHQTIFSAEETNQLLLALSTANEWSAQTILSAISQFSQISEPQIAIQQITPFLQHA NPAVSLSAINLMNKFGQNSESSIVSLISQASSSEVQFVAMRALRLAMVHKESFSRNLKLF YVNFKDEIYVKLEKIELLASFATLEVVQDIINELTEYCQDVNDQIVRKSLYALAKIACNV PQSADMVVQTFILLLTGKNAQKDIQFRLQPYAAQELLVQIQMIFRAFPDRYEGVIGELTE AIVQYDDYRAKSALIWILGEYSDRIEGVEEVILDLFDQDVKTVKNEHCDVQFSLLNASAK VYLSNQKDATQTLFLDLVDEMKKSDEPGVRQRANYLSKLFKMDPTLQLAKSVIYVQKSIP VFTDGISPVLQSKLVQRLGSVEATMRQVIVLNNVVGVHDADDVVDQFQNAENEQPTPTSM QQQIPSQISQPPMQVPTPPMQQQDPAPAIVSKPVDLLDDVMGGPPPKQAQQKVDLVDDIF GFDSPTVSAPATASAVAPVFNAPNAQQQVQQAAPVQQQSSEHPNTQTPQGNYMFANCPVR PKDQSYPLKLVVGFTRINDSPVMLVQIKNTAQTPIMKPTFVFQSNAFGIQAQELNIPVIP ALNMFNQGKPVQINFVAESPSNTLANKFNMPDLKLQSQLNVLTFQVNTSQGTSYFYQVKL PISIVFNSSGFWHKSRLLTDFNGAQNVLSQSNQWPEFIEIQNVFFGQLQATDFSTSISSA LMKLQEANFLLIQTTNESADLVINSTILGQQVIAVTNVSWQLSHNLQSVDFRVVSKVQAS QSLVGQFVVNAAAQVVSGK NT seq 2940 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atggttaaatctgagccagtaccttaagaaattattgattggcgtgaagcactatcaaat cctaaatcaattgaaaaaacgatgcaggagattgtgaaagctatgtctaacggctttgat gtttccccacttttttcagatgtcctgaaacacatgcagactactaatttgaagctcaaa aagctcatttacatcttcttaacttcaaatgcgtattaaaactcaaattacacactgctt gtagtcaacggtgtcgaaaatgactcccacaacgaatcaccctttatccgcgctcttgca atccgcgcaatgggcgcaatcgtgacagctgatgttgcagaacatttctgccagtcattt acccgtttcgcatccgatttggacccgttcgtccgcaaaacaacatgccccgctatcgcg aagctctacaaggtcaacccccagctctgtacggacaccaacttggtccaggtcctcaga tctctaattttcgactcaaatactgccgtcgtctcagccgcaacggcgtctctagtgacc gtctactcgtcgactcaccagacgattttttcggccgaagagaccaaccagcttcttctc gcgctttctaccgctaacgagtggtcagcccagacaattttgtctgcaatttcgcaattt tcgcaaatcagcgaaccacaaatcgcaattcagcaaattacaccgtttctacagcatgca aatcctgccgtctcgttgagcgctattaacctcatgaacaaatttggtcagaacagcgag agctctatcgtcagtttgatcagtcaggcaagctccagcgaggtgtagttcgttgcaatg cgcgcgttacgccttgcgatggtccacaaggaaagtttcagcagaaatttgaagctcttt tacgttaatttcaaggacgaaatttacgttaagttggagaaaattgagcttttggcgagt tttgcgactttggaggtcgttcaggacatcataaacgagcttactgagtattgtcaggat gttaacgattagatcgtcagaaagagcctttacgcgcttgcaaaaattgcgtgtaacgtg cctcagtctgccgatatggtcgtgcagacgtttattttactactgaccggtaaaaatgct caaaaagatatttaatttagattgtagccttatgctgcttaggaattgctggttcagatc caaatgatctttagagcgttccctgatagatatgaaggcgttataggtgagttgaccgaa gcaatcgtctaatatgatgattacagagctaaaagcgctttaatttggattttaggcgaa tacagtgacagaatcgaaggcgttgaagaagttattttggatttgttcgactaagacgta aaaactgttaaaaatgagcactgcgatgtttagttcagcttattgaatgcatctgccaaa gtttatcttagcaaccaaaaggatgctacttaaaccttgtttttagaccttgttgatgaa atgaaaaaatctgacgagcctggtgttagacagagagctaattatctttctaagttattt aagatggatcctactctttagcttgctaagagtgttatttatgtttaaaaatctattcca gtattcactgacggtattagtccagttttgcaaagcaagcttgtttagagattagggtca gttgaggcgactatgcgctaggttattgttttaaataacgttgtaggcgttcatgatgcg gatgatgttgttgattaattctaaaatgctgaaaatgagcagccaacaccaacgagcatg caatagtagataccttcacaaatttcctaaccacctatgtaagtacctactccacccatg taataataggatccagcacctgcaattgtctcaaaaccagttgatcttctcgatgacgta atgggcggtcctcctcctaaacaggctcagtagaaagtagatctagttgatgatatcttt ggatttgatagcccaacagtttctgcacctgctactgcttccgcagttgcacctgttttt aatgctcctaatgcatagtagtaagtttagtaagctgctccagtataatagtagtcatct gagcacccaaatacgtaaactccctaaggaaattacatgtttgctaactgcccagttcgt cccaaagattaatcctatcctttaaaattagtagttggtttcactagaattaacgattcc ccagttatgttagtttaaattaaaaatactgcttagactcctattatgaaacctactttc gtattttagtctaatgcttttggtatataagcataagagttaaatatcccagttatccct gcattaaacatgttcaactaaggtaaaccagtataaattaactttgtagcagaatctcca tctaatactcttgctaataaatttaacatgcctgacctcaagttatagtctcagcttaac gttctcaccttctaagtcaatacttcttagggaacatcttacttctattaggttaagctt ccaatttctatagtattcaactcttctggcttttggcataaatctcgtcttcttactgat ttcaatggtgctcaaaacgttctttcttaatcaaactaatggcctgaatttatcgaaatt caaaacgttttctttggctaacttcaagccacagatttttcaacttctatcagctcagct cttatgaaactttaggaagctaacttcttgcttatttaaactacgaacgagtctgctgat ttagttatcaactcgactattcttgggtaacaggtcattgcggtcactaatgtttcttgg taactgagccataacctctaaagtgtcgatttcagagttgtttctaaggtttaggctagc cagtctcttgttggttaatttgttgtcaatgctgctgcttaagttgtctctggtaagtga

DBGET integrated database retrieval system