Spironucleus salmonicida: 94297393
Help
Entry
94297393 CDS
T10465
Symbol
SS50377_23370
Name
(RefSeq) SMC4-like protein
Organism
ssao Spironucleus salmonicida
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SMC_N
SMC_hinge
AAA_21
AAA_29
AAA_23
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
94297393
NCBI-ProteinID:
XP_067766503
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(1741340..1745452)
Genome browser
AA seq
1370 aa
AA seq
DB search
MLRIEELVLHNFKSWYGEHLIALNTQGLACIVGANGSGKSNIIDALLFVFGWRAKQLRQD
KLVDLIHQSQYKVPFAKVQVNFSNNGQYFSIGRVIQATGSQHYEVNGIKSTLSNVTQILL
DNGLDIAHNRFLILQGEVESISMMKAVGDDILSQMTTVETENLLTFQSIIQNLNIEFQPQ
NIYNKIAELIISDIPDNYKKLLQKIQPSSIQQSSDVGLLEFIEQVVGTQKFLPLLSQQMA
LMEYYSNQKQEIRISLSAAVQFRDALIDNKNDSLSKIQTVGIQITEDLSKNMYQASQSRL
GLSQKQQQIVQLQQQQQELEKSINMIDNELQQQKEIQDQAQYKIQETTNDLVNITTNIKE
NQIGFHILEEKNHTILKELQEQLTIKSKITVDQKNIQQENLLFPQQKQLIESQIEQNIII
LNSKNEQLDQLQQADVKDQNQINNIQQQMHQIEIQIQPISSQRAQQQSIQQSINKQIDQK
LMQFVDLSNQTIDQMILLTRDIQYQNTDTLDIRDELFQLKQKQANVDMKKLQSQHKELNT
QIANYNLQITTLNLKIKEGNQQKQEFATNNKLLSAVLDAQKQGLLSGIYGRLGSLGIIDK
SLNIAAISAFGPQLDYIVVESMEQVQQCLQFIRTNNLGIASFIDLSQVKSRYSQYYKQFD
NDQVLRNQNSHLFLSLVNTKENYIPAFWHVMQETIVTESVQDALIINKNNNRQKLRVVTL
NGELFEKSGSLTGGGSSLNSRYKGFRQDVSQDLNITEIQKEINSIEIQKNNSDAQISQIQ
ILLNEQDIITQKIILKNQEFMVQQYEVSCQHQKVQQKIDQIMQIGDNILFQQHQAQINPT
IIQEIQQLSSVIQQNSQIWQQNLYQQQISSIIELTTYYEKQGFSNYSSLVKYTQKNDPQF
LLESEESLIANIILFPNNLSQLFGQIESQKISLVIEQLKQQEKILNAQTLILQEQIDNLG
NSKQYKIVRKEIQQLQQNKMDLDKHLQKLEISNMKYDQIMLQFDLEIQETNTKEKMLNEQ
QQQISQEQLHINQYLQQLQNSQKQLQAKKQQLLQENIQFEQQFSQVINDQKFRKEKLAQH
QANKTQLNQQIFQSQDIILSSETHITNNLMLVNFLNEILTPLQEQLNYQVPLLSSHQNIE
ELFEYDNYIIANYTIGQSKKQTNYSLNQLKSALQQDLAILEEYIQRTDKLNNVQTIFTNI
SAQSDIIFNNLNELKDQRQQEFLTAFNDINQKLREIYRIFSMGGDAILELVNHFDPFEGI
QFSVMPPKKAWRQIQNLSGGEKTLSSLSLIFALHQFRKNFIYVVDEIDAALDFRNVSLVA
NYLKEQTKECQFVIISLRNNTFEIADRLIGVYKVDNVSQNVSLDINVSDQ
NT seq
4113 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttagaatcgaagaacttgttctacacaactttaaatcttggtatggagaacattta
atagccttaaatacataaggattagcatgcatagttggtgcaaatggctcagggaaatct
aatataatagatgctcttttatttgtttttggttggagagcaaagtaattaagataagat
aaattagtagatttaattcatcaatcataatacaaagttccatttgctaaagtttaagtt
aacttttcaaacaatggacaatacttttcaataggtagagttatttaagcaactggatct
cagcattatgaggtaaacggcattaaatctactctgtctaatgttacttaaattttatta
gataatggactagatattgcacataacagatttctcattttatagggtgaagtagaatca
atttctatgatgaaagctgttggtgatgatattttatcatagatgacaactgttgaaaca
gaaaatttattgacatttcaatcaatcatataaaatttaaatattgagttttagccacaa
aatatatataataaaattgcagagttaattatttctgatattccagacaattataaaaaa
ctactataaaaaatttaaccaagtagcatataataatcttcagatgttgggctattagag
tttattgaataagtagttggtacctaaaaatttctgccgctattgtcgcagtagatggct
ctaatggaatattatagtaattaaaaataagagattcgaatttcattgtctgcagctgtt
taatttagagatgctttaattgacaataaaaatgattcgttatctaaaatttaaactgtt
ggaatttaaataacagaagatttatctaaaaatatgtattaagctagttaaagcagatta
gggttgtcataaaaataataataaattgttcaattataataatagtaataagaattggag
aaatctattaatatgatagataatgaattgtagtaataaaaagaaatttaggattaagca
taatataaaatttaagaaactactaacgatttagtaaatatcactacaaatattaaagaa
aatcaaattggttttcatattttagaagaaaaaaaccatacgattctaaaagaactataa
gaataattaactattaaaagcaaaataacagtcgattaaaaaaacatttagtaagaaaat
ttattatttccataatagaaataactaattgaaagttaaattgaacaaaatataattatt
ttaaatagtaaaaacgagtagttggactaattacagtaagcagatgtaaaagatcaaaac
tagattaataatatttaataataaatgcattaaattgaaatccaaatctaacctatttca
tctcagagagcatagtaataatcaatttaataatcaataaacaaataaattgaccaaaaa
ttaatgcaatttgttgatctttctaattaaactattgattagatgattttacttaccaga
gatatataatattaaaatacggatacgcttgatattagagatgaattattttaattaaaa
taaaaataagctaatgtagatatgaaaaaattatagagttagcataaagagttaaatact
taaatcgcgaattataatttataaataacaacgctaaacttaaaaattaaagagggaaat
taatagaagtaagaatttgctacaaataataagttactatcagctgtgttagatgcataa
aaatagggtttgctaagtggaatatatggaagattgggatcccttggaattattgataaa
tctttaaatattgccgcgatctcagcattcggacctcaacttgattatatagttgtggag
tcaatggagtaagttcaataatgcttataatttatacgaactaataacctaggaatagct
tcatttattgatttatcataagtcaaatctcgatattcttagtattataaataatttgat
aatgactaagtattaagaaatcaaaattctcacttatttctatctttagtaaatactaaa
gaaaattatataccagctttttggcatgttatgtaagaaactatagttactgaatctgta
taagatgcattaataattaataaaaataataatagataaaaattacgtgtggtcacttta
aatggagagctctttgaaaaatctggatctttaacaggcggtgggtcaagtctaaattca
aggtataaaggatttagataagatgtttcataggatttaaacataacagaaatacaaaag
gaaattaatagtatagaaatttagaaaaataattcagatgcatagatttcctagatttaa
atattactaaatgaataagatataattacttagaaaatcatattaaaaaattaagaattt
atggtttaatagtatgaagtatcttgttagcattaaaaagtttagtaaaaaatagattaa
ataatgtaaattggtgataatatactattttaacaacatcaagcataaataaatcctaca
attatttaggaaatttaataattaagttctgttatttagtaaaattctcaaatctggcaa
taaaatttatatcaacaataaatttcttcaattattgaattaactacatattacgaaaaa
taaggttttagtaactactcgtctttagtgaaatatactcagaaaaacgatccataattc
ttacttgaatcagaagaatctcttatagcaaatattattctatttccaaataatttaagc
caattattcgggtaaatagaatcataaaaaatttcgttagtaattgaataactaaaataa
taagaaaaaatattgaatgcataaaccttaatattataagaataaatagataatttagga
aattccaaatagtataaaatagtcaggaaagaaatttagtagttatagcaaaataaaatg
gatttagacaaacatttataaaaattagagatctcaaatatgaaatatgactaaataatg
ttacaatttgatctagaaatacaggaaactaatactaaagaaaaaatgctaaatgaatag
taatagtaaatctcttaagaatagctgcatattaactaatatcttcaatagctttaaaat
tcataaaaataactataggctaaaaagcaacagttattataagaaaatattcagtttgaa
taataatttagctaggttataaatgattaaaagtttaggaaagaaaaactcgcgtaacat
taagcaaacaaaacttagttaaattaataaattttttaatcttaagatataatacttagt
tcagaaactcatattactaacaatcttatgttagttaactttcttaatgagattttaact
cctctttaggaatagttgaattatcaagtacctttgctttcttcacatcaaaatatagag
gaactttttgaatatgataattatattattgctaattatacaattggttaatccaaaaag
taaacaaattactctttaaatcaactgaaatcagcattataacaagatttagcaattttg
gaagaatatatatagagaactgataagcttaataatgtataaactattttcactaatatt
tcagcttaatctgatattattttcaataatcttaatgaacttaaagattaacgtcaataa
gaatttttaacggcttttaatgatattaattaaaaattaagagaaatttatcgaatattt
tcaatgggtggagatgctattttagagcttgttaatcattttgatccctttgagggaata
taattttcagttatgccaccaaaaaaagcatggcgttaaatataaaacttaagtggaggt
gagaaaacgttaagcagcttaagtttaatctttgctttacattaatttagaaagaatttc
atttatgtcgttgatgaaattgatgcggcactagacttcagaaatgttagcttagttgca
aattatttaaaggaataaacaaaagaatgctaatttgtcattataagcctcaggaataat
acttttgaaattgccgatagattaatcggtgtatataaagtcgataatgtgagctaaaac
gtcagtttagatataaatgtttctgatcagtga
DBGET
integrated database retrieval system
