Spironucleus salmonicida: 94297561
Help
Entry
94297561 CDS
T10465
Symbol
SS50377_23538
Name
(RefSeq) hypothetical protein
Organism
ssao Spironucleus salmonicida
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CFA20_dom
Beta-prop_EML_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
94297561
NCBI-ProteinID:
XP_067764376
LinkDB
All DBs
Position
4:192500..197014
Genome browser
AA seq
1504 aa
AA seq
DB search
MSAAGSNKVSYPNVADLKYSNTLDLFKVLSIPRMNFSKTGQVSQELDHVIKKSVVYVRGP
VSSANRFLVPSKISQQFCLPQRYLFIQISPDISFHTAKDINTQTHTSLTLQTQSISGQTV
RFQLTTLTQIPKVSASSVILPLRLQRWSTLVIDFHQLYKLAYNNTFTYRGLLQFEATATC
VVKGVYMSNLKYSPFDQIEMLRLQAPSGFAGAPISNLLEHYDWIEYGIREFDVVKRQNLQ
YISQRDIFSQNISHAMPFICDLTDFQSELIEFQQKEQQIKEIKNQSRNKPLNNQNNRLSQ
TLSTYKAAKIQKPNMPKSKFNNENLLQGQQETQEINSTSENSLCQIINNQDTSEFDTELE
DVNVINQDPSMDTYDEKVNQISDLQESAVLNSQQQHDLSGLQSTMQKSIKINTDIQVLQS
AQQQNDYDLGIFQNTNADLPSQIIEQMIIEQAKSNQQQVTVSELQELKEAFQEGKQHLDD
NFQTLNQTVSSIKVVKNDFSKVYKQKMQELHSLFVPNLQLNTVNSALNVRGIIGCEVTPR
FQFQNQDALEIEQPNLKSIATLDPRDSMSQAINWMNFHIGGKIMFQVDQDVKVNLTEIVG
DKPIIIPNQYLTLLLNHKIAASVVIPQKEIQLFISHDLVISLLFKIQQNNKDTSLYKEID
VFILQSKKSNIQFLASAKNQHFIVVFESYSAIFELTDKLTLSLRCLFNNSTTGIYKIELA
QFSKMNNRLFLIGTNQAKSSVAIAVFSLDNVITLGNGWLNESQSKFVFLKSPLILEQLSN
QQRHECVSSLIEINQEQYILLTNQNIRQLRLKDGIELRMSAVSLDFTKYKNQLIKIMQNI
LITENSMYNSCKMKSQLFEENLNKLIQLFIFSTGLTSAGIVPSSHNQLLFLVLSNVAIVQ
IKLEDLFNNNTPDIDGFLPHGFISLLSVACSDNNFIVSSDIAGNIHCHREICGQQNMSAK
FNQPVIHIDNVRFITTQENYNETENQSSQLFNNSNLETSVSSQKLNVQQFVSFQQSGELA
VFEINENGAQEYTKYYHTTVYNIHDFAFDPNHFDEMMILTACDANVVNVDKIYERKIQYS
ITVNSKYKDISSIKYQNLIRYHPTSYVTAIFYPEEQEFILTDLNNSDMLFCSKRLFKSIG
GVYDINFTQNGNYLLISSSINGLKIYSIEKQIQQQIHIKTDLISFKTTQILNKTTKKMTE
IVVGITPQNQILLASMENLIQDQGFRPLNIQKQSMEFVLDKKSKQKFISEEHLSSSFYQN
QIKFIRNMLQQGIIQGSKTNFGLIQQIPLTPDMDISNFKFIERKVLSIQISHCIPNLLGA
VIADTYFISSMNPQSKLNFFITAYSLETFSLSNGMQVQSFHFTTVITNQIEYSTPILLQS
RVHGTYCVFLPYPERTLLYSLNILVPQICSQFRVSELPFEVLNAKISYNEDKIALCHKGS
SVFIFDWNCTDFCDSEEQVLLQKEELQKAILELRLEKIVMGSGICEYGNQSSMSGSIKSG
IVII
NT seq
4515 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcagctgctggttcgaataaggtttcttatcctaatgtagcagatcttaagtactct
aatacattagatttatttaaagtactatcaattccacgtatgaatttttccaaaacagga
taggtttcttaagaattagatcatgttatcaaaaaatcagttgtttatgtaagaggtcct
gtctcttcagcgaatagatttttagttccctctaaaatttcataataattttgtcttcca
tagagatatctttttatttaaatttcccctgacatctcttttcatactgctaaagatata
aatacataaactcacacttcattgacactttaaacttagtctatttcaggttaaacagta
cgattttagcttacaactttaacttaaatcccaaaggtttcagcatcttcggttattctt
cctctaagactttaaagatggtccactttagttattgactttcaccaattatataaactt
gcatataataatacttttacttatagaggtctcctataatttgaagcaacagctacttgt
gtggtaaaaggtgtttatatgtcaaatttaaaatattcaccatttgatcaaatcgaaatg
ttgaggttataagctccatctggatttgctggagcaccaatttctaatcttttagagcat
tatgactggatagaatatggaattagagaatttgatgttgtaaaaagacaaaacctataa
tatataagctaaagggatatttttagttaaaatatatcacatgcaatgccatttatttgc
gatttaactgatttttaatctgagttaattgaattttaataaaaagaacagtagataaaa
gaaattaaaaactaaagcaggaataagcctcttaataatcaaaataatagattaagttaa
actttaagcacttataaagcagcaaagatttaaaagccaaacatgccaaaaagcaaattt
aataacgagaatttactgtaaggttaataagaaacttaagagatcaattcaaccagcgaa
aattcattatgtcagataattaataactaagacacctctgaatttgatacagaattagaa
gatgtaaatgtaatcaattaagatccatctatggatacctatgatgaaaaagttaactaa
atatctgatttacaggaatcagccgtactcaattctcagtagtaacatgatttgtctggt
ttataatctacaatgtagaaatcaattaaaattaatacagatatttaagtcctttaaagt
gcctaatagtaaaatgattatgatcttggtatattttagaatacaaatgcagatttacca
tctcagattattgaataaatgataatagaataagcaaaaagcaactaataataagttaca
gtttctgaattataagaacttaaagaagcattttaggaaggtaaataacacttagatgat
aacttttagacattaaattaaactgttagctctattaaagtggttaaaaatgatttttca
aaagtttacaaataaaaaatgtaagaattacactcattatttgttcctaatttataacta
aatactgttaattcagcattaaatgttagaggaattatcggatgtgaagtaacacctaga
ttttaattttaaaatcaagatgctttagaaatagaacagccaaatttaaaaagtatagca
actttagaccccagggattcaatgagttaagctataaattggatgaacttccacataggt
ggtaaaattatgttttaagtagatcaagatgtaaaagttaatttgacagaaattgtaggt
gataaacctatcatcattccaaactagtatttaacattacttttaaaccataaaattgct
gctagtgttgttattccataaaaagagatttaattatttatttctcatgatttagtcata
agtttgctattcaaaatttaataaaataataaagacactagtttatacaaggaaattgat
gtatttatattgtaatcaaaaaagtcaaatatataattcttagcctctgctaaaaattaa
cattttatagttgtttttgaatcatatagtgctatttttgaattaactgataaattaaca
ctatctttacgttgtctttttaataattctactacaggtatttataaaattgaattagcg
tagttttctaaaatgaacaatcgtctatttttaattggtactaattaagctaaatcatct
gttgctatagcagtattttccttagataatgtgattactttaggtaatggatggttaaat
gaatcttaatctaagtttgtatttttgaagtcacctttaattttagaataactaagtaac
taataaagacatgaatgtgtgtctagtttaattgaaattaactaggaataatatattctt
cttacaaattaaaatattagataattaagactaaaagatggaatcgagcttagaatgtct
gcagtttcattagattttactaaatataaaaattagctcattaaaattatgcaaaatatt
cttataacagaaaattcaatgtataattcatgtaaaatgaaatcatagctttttgaggaa
aatcttaataagttaattcaacttttcatattttcaacaggtcttactagtgcaggaatt
gtacctagtagtcataattaacttctttttttagtactctcaaatgtagccattgtgtag
ataaaattagaggatttatttaataataacacgccggatatagatgggtttttaccacat
ggtttcatttcacttctttctgttgcttgtagcgataataatttcatagtatcttcagat
attgctggaaatatacactgtcatcgcgaaatttgtggctaataaaatatgtctgcaaaa
tttaaccagccggtaatccatattgataatgtccgctttataacaacataagaaaactat
aatgaaacagaaaactaaagttcataattatttaataactctaacttagaaacttctgtt
tcgtcgtaaaaattaaatgtctaataattcgtgtcattttaacaatcaggtgagttagca
gtgtttgaaattaatgaaaatggagctcaagaatacactaaatactaccacacgaccgtt
tataatattcacgattttgcatttgatccaaatcattttgatgaaatgatgattcttact
gcatgtgatgctaatgtggtgaatgtagataaaatttacgaaagaaaaatttagtatagt
atcacagttaatagtaaatataaagatatatcatctattaagtatcagaacttgattaga
tatcatcctactagctatgttactgccatattttaccctgaagagtaagaattcatatta
acagatttgaacaattctgatatgttattttgtagtaaaaggttatttaaatcgatcgga
ggtgtatatgacataaattttactcaaaatggtaattatttattgatttcaagctctatt
aacggattaaaaatatattctatcgaaaaataaatataataataaatacatataaaaact
gatttaatttcatttaagacaacccaaattttaaacaaaactacaaaaaagatgaccgaa
atagttgttggaataactccttaaaaccaaatcctattggcttctatggaaaatttgatt
taagatcagggatttaggcctctaaatattcaaaaataatctatggaatttgttttagac
aaaaaatctaaataaaaattcatttcagaggaacatttaagctcaagtttctatcaaaat
caaattaaatttatcagaaatatgttataataaggtattatttaaggctctaaaactaat
tttggactaatttagtaaataccacttactcctgatatggacataagtaatttcaaattt
atcgaaagaaaagttttatcaatttaaatctctcattgcatacctaatcttctaggcgca
gttatagccgatacttattttatttcatcaatgaacccttaatctaagcttaatttcttt
attaccgcttattctttagaaactttctcgttatcaaatggaatgcaagtttaatctttc
cattttacgactgtaattactaatcaaatcgagtattctacaccaatcttgctccaatct
agagttcatgggacatattgtgtattcttaccatatcctgaaagaacgttactatattcg
cttaatattttagtaccttaaatatgtagttaatttagggtttctgaacttccatttgaa
gttttaaatgccaaaatttcatataatgaggataaaattgctttatgtcataaaggtagt
tctgtatttatttttgattggaattgcaccgatttttgtgactctgaagaataagttctt
ctatagaaagaagaactataaaaagcaatcttggagctccgacttgaaaaaattgttatg
ggaagtggaatttgtgaatatggtaattaatcaagcatgagtggaagtattaaaagtggg
atagttattatatga
DBGET
integrated database retrieval system