Scomber scombrus (Atlantic mackerel): 133984535
Help
Entry
133984535 CDS
T10651
Symbol
fbn2b
Name
(RefSeq) fibrillin-2b
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
ssco Scomber scombrus (Atlantic mackerel)
Pathway
ssco04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
ssco00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
133984535 (fbn2b)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
133984535
NCBI-ProteinID:
XP_062279913
LinkDB
All DBs
Position
8:16367469..16437606
Genome browser
AA seq
2889 aa
AA seq
DB search
MGSGKLAQVLLGWVAVCSAAVHVVCGQTGNGPYQANRFTGTVDQREAQRVRRRGQETLRG
PNVCGSRFHSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRNSCGDGFCSRPNMCTCSNGQLSPSCGAGA
GVQSCNVRCMNGGSCAEDSCSCTKGYTGNHCGQPVCENGCQNGGRCIGPNRCACVYGFTG
PQCERDYRTGPCFTQVNNQMCQGQLSGIVCTKTLCCATIGRAWGHPCEQCPAQPHPCRRG
FIPNIRTGACQDVDECQAVPGLCAGGNCINTVGSYECKCPAGHRQSETSHKCEDIDECST
IPGVCDGGECTNTAGSYVCTCPRGYISSTDGSRCVDQRVGTCFSALANGRCAAELTGQYT
KMQCCCDTGRCWALGQIPEMCPVRGSDEFRRLCIVGVPQGHGFPHGYPNGQFPNNNGNGF
NYGYKFPSLPNGNGNGGAGGNGGFGGNGGSFGGNGGGLSTHQNIGTVSVNDSIDVCKHFT
NLCLNGRCIPTISSYRCECNMGYKQDVRGECIDVDECVSNPCINGDCVNTAGSYHCKCHE
GYQGTSTKQACIDIDECIVNGVMCRNGRCVNTEGSFQCICNAGFELTPDGKNCIDHDECA
TTNMCLNGMCINEDGSFKCICKPGFALAANGRYCTDIDECQTPGICMNGRCINSEGSFRC
ECPPGLAIDVDGRVCVDTHMRTTCYGAIKMGTCSRPFPGAVTKSECCCANPEHGFGEPCH
PCPSRNSAEFQAVCSSGIGITADGRDINECALDPDICQNGICENLRGSYRCICNIGYESD
TSGKNCVDVNECLVNRLLCDNGLCRNTPGSYTCSCPKGYVFKPDSETCEDINECESSPCI
NGACRNVAGSFNCECTHGSKLDSTNTICVDSMKSTCWLTIQDNRCEVNINGATLKSECCS
TLGAAWGSPCDPCEIDTACSRGFARMKGLVCEDINECEVFPGVCTNGRCVNSQGSFRCEC
AEGLTLDSTGRTCVDMRSEQCYMKWHEDECGEPLPGRYRVDMCCCSVGSAWGIDCEECPK
AGSPEYRSICPRGPGFANRGDILTGRPFYKDVNECKVFQGLCTYGTCRNTIGSFKCRCNS
GFALNAEERNCTDIDECRISPDLCGHGSCVNTPGSFECECFEGYESGFMMMKNCMDIDEC
ERNPLLCRGGTCLNTEGSYECECPTGHSLSTDGSACEDVNECQLSDNLCKNGQCVNMPGT
YQCSCDTGYQATPDRQGCVDIDECTIMNGGCETHCTNSEGSYECSCSEGYALMPDLRTCA
DIDECEETPDICDGGQCTNIPGEYRCLCYDGFMASMDMRTCIDVNECDLNPNICLHGDCE
NTKGSFICHCQLGYFVKKGSTGCTDIDECEIGAHNCDMHAACINVPGSFKCRCRDGWIGD
GIKCVDQDECSAEDHNCNPNADCVNTPGSYRCTCKDGFNGDGFSCSDMDECADNVNLCEN
GQCLNAPGGYRCECEMGFTPTEDSKACQDIDECNFQNICVFGTCQNLPGMFRCVCDDGYE
LDRSGGNCTDINECADPVNCINGLCVNTPGSYLCNCPPDFELNPTGVGCVDTRVGNCFLD
ILARGDGGISCSAEIGVGVTRASCCCSLGGAWGNPCELCPAPNSTEYKTLCPGGEGFRPN
PITVILEDIDECQELPGLCQGGNCVNTFGSFQCECPGGYYLNEETRICEDIDECTTHIGI
CGPGTCYNTLGNYTCVCPPEYMQVNGGNNCMDMRKSVCYRNFNDTCENELSFNMTKKMCC
CAYNVGKAWNKPCEACPTPATSEYQLLCGNQAPGFIIDIHTGKPIDIDECREIPGICASG
VCINQIGSFRCECPMGFSYNNILLICEDIDECNSGDNLCQRNANCINIPGSYRCECSPGF
KLSPSGACVDRNECQEIPNVCSHGECIDTQGSYRCLCHNGFKATADQTMCMDIDECDRQP
CGNGTCKNTVGSYNCLCFPGFELTHNNDCMDIDECSALQGQVCRNGQCINGLGSFQCLCH
EGYENTPDGKNCVDINECVSLPGTCSPGTCQNLDGSFRCICPPGYEVQNDQCIDINECEV
EPNICQYGTCTNTPGSFQCSCQTGFVLSDNKRRCYDTRESFCFTKFDAGKCSVPKAFNTT
KAKCCCSKMPGEGWGLPCELCPRENEAAFDTLCPYGHGALPGPDNAREDMNECLDNPGIC
QNGICINTDGSFRCECPFGYNLDYTGVNCVDTDECSIGNPCGNGTCTNVVGGFECSCQEG
FEPGSMMTCEDINECSQNPLLCAFRCVNTFGSYECMCPAGYVLRDDQRMCRDQDECSEGL
DDCDSKGMTCKNLIGTFMCICPPGMQRRPDGEGCMDLNECRSKPGICKNGRCVNTVGSYR
CECNDGFESSSTGTECIDNRKGFCYIEVLQTMCQQSSTNRNSVTKSECCCNTGRGWGSQC
ELCPLPGTIQYKKMCPLGPGYTTDGRDINECQVMPDLCRNGQCINTIGSFRCHCNVGYKT
DFTATSCVDMDECALSPKPCNFLCKNTEGSYLCSCPRGYSLQPDGKTCKDLDECSTKQHN
CQFLCVNTIGGFTCKCPPGFTQHQTACIDNNECTGQTTACGSQASCINTPGSFNCECSKG
FSLDTTGIECEDVDECSSNHRCQHGCQNMMGGFRCGCPQGYVQHYQWNQCVDENECQGGS
MCGSASCYNTLGSYKCVCPSGFDFEQGAGGCQDVNECGMGSNPCIYGCSNTDGGYLCGCP
GGFYRAGQGHCITGSGFPGQFGGGDGGDDDDSLSPEACYECKINGGGGKKGRHRRNADEN
DLNQEPAVSMASLDTHTSIPMNLSLASLLNKEPVLELLPALQPLENHVRYVITHGNTNEH
FRLLERRDGKSVLRLGKKPPPPGSYRLDIASLPLFGPRKRQQLEEKHDNDYLQGEIGDAL
RIKLHIHLH
NT seq
8670 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggatcagggaagctggctcaggtgctgctgggatgggtggcggtgtgttctgcggcg
gtccatgtggtgtgtggtcaaactgggaatggaccgtaccaagctaaccgcttcaccggc
actgtggaccagagagaggcgcaacgggttcgacgccgtggccaggagacactgagaggg
cccaatgtgtgtggctctcgcttccattcatactgctgtccaggctggaaaactctgcca
ggagggaaccagtgtattgttccaatttgcaggaattcatgtggcgatggcttctgctcc
agacccaacatgtgtacctgttcaaatggtcaactctctcccagctgtggtgcaggagca
ggagttcagtcctgtaacgtcaggtgtatgaatggaggctcctgcgcagaggactcttgc
tcctgcacgaagggctacacaggcaaccactgtggacagcctgtgtgtgagaatggttgc
cagaacggtgggcgctgcattggacccaacagatgtgcctgcgtctatggtttcactggc
ccgcagtgcgagagagactacaggactgggccatgtttcacgcaggtgaacaaccagatg
tgtcagggccagctcagtggaatcgtctgcaccaagaccctttgctgcgctaccattgga
cgagcatggggccacccctgcgagcagtgcccagcccagccacacccctgcagacgaggc
ttcatccccaacattcgcactggtgcctgtcaagatgttgatgagtgccaggcagtgcca
ggtctttgcgccggaggtaactgcatcaacactgtgggatcctacgagtgtaaatgtccc
gctggccaccgtcagagtgaaaccagccacaaatgtgaagatattgatgaatgcagcact
attcctggtgtgtgtgatggaggagaatgcaccaacactgctggtagctacgtctgcacc
tgtccacgaggctacatctccagcacagatggctcccgatgtgtggatcaacgtgtgggc
acctgtttctctgctctggctaatggccgctgtgctgcagagctgactggacaatacacc
aagatgcagtgctgctgtgacacaggccgctgctgggctctgggacagattcctgagatg
tgccctgtcagagggtctgatgaattcaggcgtctgtgtattgtgggtgttccccaggga
catggtttccctcatggctaccccaacggacagttccccaataacaatggcaatgggttc
aactatggatacaagtttcccagtctacctaatggtaatggtaacggaggtgctggtggc
aacggaggctttggaggtaacggagggagctttggaggcaatggagggggactttctacc
caccaaaacataggcactgtttccgtgaacgactccattgatgtgtgcaaacatttcacc
aacttgtgcctaaatggacgttgcattcccacaatctcaagctatcgttgtgagtgcaac
atgggctacaaacaggatgttcgtggggagtgtatcgatgtggatgagtgtgtgagcaat
ccatgcatcaatggagactgtgtcaacacagctggatcataccattgcaagtgccatgag
ggctaccaaggaacctctaccaaacaagcctgcattgatattgatgagtgtattgtgaat
ggagtgatgtgccgcaacggtcgctgtgtcaacactgagggaagctttcagtgtatctgc
aatgctggctttgagctcactcctgacggaaaaaattgcattgatcatgatgaatgcgcg
accaccaatatgtgtctcaatggcatgtgtatcaatgaggacggcagctttaagtgtatc
tgcaaacctggctttgccttagcagccaatggacgctactgcaccgacattgatgaatgt
cagacacctggcatttgtatgaatggacgctgcatcaactctgaaggctcctttcggtgc
gagtgcccaccaggcctggctattgatgtcgatgggagagtgtgtgtggacacacacatg
aggaccacctgttatggtgctataaagatgggcacatgctctcggccattccctggtgca
gtgaccaagtcagagtgctgctgtgccaatcctgaacatggctttggagagccttgccac
ccctgcccctccagaaattcagctgagttccaggctgtgtgcagcagtggtattggcatt
acagctgatggcagagacatcaatgagtgtgccctggatccagacatttgtcaaaatggc
atatgtgagaacctgagaggaagttaccgctgcatctgtaacattggctacgagtctgac
accagtggcaaaaactgtgtcgatgtcaatgagtgtctggtgaaccgtctgctctgtgat
aacggtctgtgcagaaatactcctggctcctacacttgctcctgccccaaaggctatgtc
ttcaaacccgactcagagacatgtgaagatatcaatgagtgcgagtctagcccgtgtatc
aatggagcgtgtcgcaacgtggctggttccttcaactgtgagtgcacccacggcagcaag
ctggactccaccaacaccatttgcgtggatagcatgaaaagtacttgttggctgaccata
caagacaaccgctgcgaggtaaacatcaacggagccacactgaagtctgagtgctgttcc
acactgggagccgcctggggcagcccatgtgatccctgcgagattgacacagcctgctct
cgaggatttgctcgtatgaagggccttgtctgtgaagacattaatgagtgtgaggtgttc
cctggagtgtgtacaaacggccgctgtgtgaactcccagggctctttccgttgtgagtgt
gccgaaggactcactttggacagcactggacgcacatgtgttgatatgcgtagtgagcag
tgttacatgaagtggcacgaggatgagtgtggcgagcccctgccagggagataccgtgtg
gacatgtgctgctgttcagtgggttctgcatggggtatcgactgtgaggagtgtcccaaa
gcaggctcacctgagtacagatccatctgtcccagagggcctggctttgccaacagagga
gatatcttgaccggcaggcctttctataaagatgtgaatgagtgtaaggttttccagggt
ctgtgtacttacggaacttgccgcaacaccattggcagtttcaagtgtcgctgcaacagc
ggcttcgctttgaacgctgaggaaaggaattgcacagacattgatgagtgccgcatctct
ccggacttgtgtggtcatggttcctgtgtcaacacacctggcagctttgagtgtgaatgc
tttgagggctatgagagcggtttcatgatgatgaagaactgcatggacattgatgagtgt
gagagaaatcctctgctgtgtcgtggaggaacctgtttgaacacagaagggagttatgag
tgtgaatgtcccaccggacactcactcagcacagatggatctgcctgtgaagatgtgaat
gagtgccagctgagtgacaacttgtgcaagaacggccaatgtgtcaacatgccgggaacc
taccagtgctcatgtgacactggttaccaggccacaccagaccgtcagggctgcgttgat
attgatgagtgcaccattatgaatggaggctgtgaaacccactgcaccaactcagagggc
agctacgagtgcagctgtagtgagggctatgctctcatgcctgacctcaggacctgtgca
gatattgatgagtgtgaggagactccagacatctgtgatggaggccagtgtaccaatatt
cctggggagtatcgttgtctctgttacgatggtttcatggcttctatggatatgaggacc
tgtattgatgtcaacgagtgtgatttgaacccaaacatctgtctccatggtgactgtgag
aacaccaaagggtccttcatctgccactgtcagctgggatactttgtcaagaagggatcc
acgggctgcacagatattgatgagtgtgagatcggggctcacaactgtgacatgcatgct
gcctgtatcaacgtgcctggaagctttaaatgtcgctgtcgagatggttggattggggat
ggcatcaagtgtgtggatcaggatgagtgctctgccgaggaccacaactgcaatccgaac
gcagactgtgttaacacaccaggatcctacaggtgcacatgcaaagatggctttaatgga
gacggcttttcctgctctgatatggatgagtgtgcagacaatgtgaacttgtgtgaaaat
ggccagtgtctgaatgctccgggcggctaccgttgcgagtgtgaaatgggcttcactcct
actgaagacagcaaggcttgtcaagacatcgatgagtgtaatttccagaatatctgtgtg
tttggcacatgccagaaccttccagggatgttccgctgtgtgtgtgatgatggttacgaa
ctggaccgcagcggaggaaactgcactgacatcaatgagtgtgcagaccctgtgaactgc
atcaacggactgtgtgtgaacactccggggagctacctgtgtaactgcccacctgacttt
gagctcaaccccaccggagtgggctgcgtggatacccgtgttggcaactgcttccttgat
atccttgctcgtggcgatggaggaatctcctgcagtgcagagatcggagtgggcgtgacc
agagcttcctgttgctgctccctaggaggggcctggggaaacccctgtgaactttgccct
gcccccaactccacggaatataagactctctgtccaggaggagagggattcagacccaac
cctattactgtcatcctggaagatatcgacgagtgccaggagctgccaggtctctgccag
ggtggaaactgtgtgaacacctttggcagtttccagtgtgaatgtccaggaggttactat
ctcaatgaggagactcgcatctgtgaggatatcgatgaatgcacaacccacattggaatc
tgtgggccgggtacctgctataacactctgggcaactatacctgtgtttgtccccctgaa
tacatgcaggtcaatggaggaaacaattgcatggacatgaggaaaagtgtgtgttaccgt
aacttcaatgacacatgtgagaatgagctctccttcaacatgaccaaaaagatgtgctgc
tgtgcctataatgttggaaaagcctggaacaagccgtgcgaggcctgtcctactcctgct
acctctgagtaccaattactgtgtgggaaccaggctcctggcttcattattgacatccac
actggcaagccaattgatattgatgagtgcagagagattcctggtatctgtgctagcgga
gtgtgcatcaatcagatcgggagcttccgttgtgaatgtccgatgggcttcagctacaac
aacatactgctcatttgtgaagacattgatgagtgtaacagtggggacaacctgtgccag
cgcaacgccaactgtatcaacattccaggcagctaccgctgcgagtgctcgccaggcttc
aaactgtcccccagtggggcctgtgtggaccgtaatgagtgccaggagattcctaatgtg
tgcagccatggagagtgtattgacacgcagggaagttaccgctgtctctgccacaacggc
ttcaaggccactgctgaccagaccatgtgcatggatattgacgagtgtgacagacagcca
tgtggtaacggtacctgtaaaaacacagtgggatcctacaactgtctctgcttccccggc
ttcgagctcacacacaacaatgactgcatggacatagatgagtgcagcgccctccagggc
caagtgtgcaggaacggacagtgcatcaacggacttggttccttccagtgtctctgtcat
gagggttatgagaatacgcctgatgggaagaactgtgttgatatcaatgagtgtgtgagt
ctgcccggcacttgctctccaggaacttgtcagaatcttgatggatcctttagatgtatc
tgcccccctggctatgaggtgcaaaatgaccagtgcatagatatcaacgagtgtgaggtg
gaacctaacatctgccagtatggcacctgcaccaacacccctggaagcttccaatgctcc
tgccagacaggcttcgttctctctgataacaaacggcgctgctatgataccagagagagt
ttctgtttcaccaagtttgatgcaggaaaatgttccgtccccaaagccttcaacaccacc
aaggctaagtgctgctgcagcaaaatgcccggagagggctgggggcttccctgtgagctg
tgcccacgagagaatgaggctgcttttgacactctgtgtccgtatggccatggagccctg
cctggaccagataatgctcgtgaagatatgaatgagtgtctggataacccaggcatttgc
cagaatggtatctgcatcaacacagacggttcattccgctgtgaatgcccctttggatac
aacctggattacactggagttaactgtgttgacactgatgagtgttccatcggaaaccca
tgtggaaatggaacctgcaccaatgtggtgggaggttttgaatgttcgtgccaggagggc
tttgaacctggatccatgatgacctgtgaagacatcaacgagtgctcccagaatcctttg
ctgtgtgccttccgttgtgtcaacacgttcggctcctatgagtgtatgtgccctgctggc
tacgtgctgcgagatgaccaacgcatgtgtagagatcaagacgagtgttcggagggtctg
gatgactgtgactccaagggtatgacttgtaagaacctgattggtacctttatgtgtatc
tgcccccctggcatgcagcgccgaccagatggagagggatgtatggacctgaacgaatgc
cgcagcaaacctggcatctgtaagaatggccgctgtgttaatacagtgggaagctaccgc
tgcgagtgtaacgatggctttgagtcgagctccactggaactgaatgtattgacaaccga
aagggtttctgttacatcgaggttctgcagactatgtgccagcagtcgtccaccaacagg
aacagtgtgaccaaatcagagtgctgctgcaacacgggccgaggctgggggtcccagtgt
gagctctgcccattgcctggcaccatacagtacaagaagatgtgcccacttggacctggc
tacaccacagacggtagagacatcaacgagtgccaggtgatgccagatttgtgtcgcaat
ggtcagtgcatcaacaccattggatccttccgctgccactgtaatgttggatacaaaaca
gacttcactgcaacctcctgtgttgatatggatgagtgcgctctgtctcccaagccctgt
aacttcctgtgtaaaaacacagagggcagctacctctgctcctgccccagaggatacagc
ttgcagccagatgggaagacctgcaaagatttggatgagtgttcaacaaagcagcataac
tgccagttcctctgtgtcaacaccatcggaggcttcacctgcaagtgccctcctggcttc
acccaacaccagactgcctgcattgataacaatgaatgcacaggtcagaccactgcgtgt
ggttcacaggcctcttgtatcaacacacctggtagcttcaactgtgaatgctctaagggt
ttctctttggacaccacaggaatcgagtgtgaggatgtagatgagtgtagcagtaaccac
cgctgccagcacggctgtcagaacatgatgggaggtttccgctgtggctgtcctcagggc
tacgtgcagcactaccagtggaaccagtgtgtggatgagaatgagtgtcagggtggatca
atgtgtggctctgcctcctgctacaatacactgggcagctacaagtgtgtgtgtccctct
ggctttgactttgagcagggtgctggtggctgccaagatgtgaatgagtgtggcatgggc
agcaacccctgtatttatggctgctccaacacggacggaggctacctgtgtggctgtcct
ggaggtttctacagagcgggacaaggtcattgcataacaggctcaggtttcccgggtcag
tttggtggtggtgatggtggtgatgatgatgatagtctgtctcctgaggcctgttatgag
tgtaagatcaatggaggaggaggaaagaaaggacgacacagacgcaatgctgatgaaaat
gacctcaaccaggaaccagcagtgagtatggccagcttggacacccacacttccatcccc
atgaacctttctctggcctcactactcaacaaggagcctgtactagagcttctgccggcc
ctgcagcccctggagaaccatgtacgctatgtcatcacccacggcaacactaatgaacac
ttccgcctactggaacgccgcgatggaaagagtgtgctccggcttggcaagaagccgcct
ccaccgggatcctaccggctggatatcgccagcctgccactgttcgggccccgaaaacga
cagcagctggaggagaagcatgacaatgactacctacaaggggaaataggagatgccctg
cgcatcaagctccacatccacctgcactga
DBGET
integrated database retrieval system
