Staphylococcus pseudintermedius HKU10-03: SPSINT_0590
Help
Entry
SPSINT_0590 CDS
T01396
Name
(GenBank) Phage tail length tape-measure protein
Organism
ssd
Staphylococcus pseudintermedius HKU10-03
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Baculo_PEP_C
Ins_allergen_rp
AAA_lid_7
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADV05119
LinkDB
All DBs
Position
609746..612865
Genome browser
AA seq
1039 aa
AA seq
DB search
MSNKDYTVSADLKANTGKFKKAIKTAIQTLQRYEKTIARIKDVELKADDKLIEEKVKQAE
LALERIDGKKANATIDASTKIAETKLKNYEKALQFLDNKSVKTAIDLQDRLFVTKFNKTK
AEINKLDGKTVNTELEVKNSVANNKIRLFKALLRSIPNRRKVRVDVDGKGSKNPFSKMLD
YLNKQSDEFVAHMDRIAKSIRTFGTIGANMIKGTLLSSFSALIPIIASLVPAIMAVGNAL
AVVGGGAIGLAGSFAIAGAGVVGFGAMAISAIKMLEAGTLQASAATYAYKRSLEGVTSEW
QKIIRLNADSIFGALSSALNGVQTTLKNLTPFLKGVSEAVNSSAQSFEKWVTSSSTAKKA
FESMNTSGVKVFSSLLSAAGRFADGFVNILTQFTPLFEFVANGLNNMGASFQKWANKVST
QNGIQKFIDYVKVNLPIIGKIFGDTFIGIFNLFKAFGSNSQSIFESLAQMASRFRTWSEQ
IAQSDGFKKFIDYVQQNGPTIMSLIGNIIMVLVNFGTAMAPIASVVLNVVTAITGFVAKL
FETHPIVAQIIGLAITFAGVLMTWYPVLSGIVKFLGPLISKLGFLRAVLPLIGKAFSLLS
GPIGLVARLLPLLGAAIGFLTSPIGLVIGAIIALIAIFVILWNKNEAFRNFIINLWNSIK
DFFINLWTTLATIASVLWQLLLTTIVNIVISIQTWLTTTWQNILTFLSTLWNTLIVIATT
IWNLLVTVIVTVITTILTVQQTIWNSILSFLQTIWNTVVSVATTVWNTLVTVITTVLNAI
NSFVTTIWNAIYSFFASILSRISSTVSQKFSEVYRWISTKIQQAYSILSSILSNMWSVVS
SKFSQIVSTVISKMVEFYNAIKQKVQDSLNAVVNFVGEFMDAGRNLIMGLVNGVKNAAGA
LIDAVTGAVSGAIDKAKSLLGIKSPSRVFKQIGVYTMQGLGIGVDQEGQNAVGSVVDVAR
QLTKAFNPVLSLPSISDATSGLNGLSGLSANLTTQIQHTHSFETSPRMKTVRIEMRLDND
AIYGIVNDKQAEKHSIFEM
NT seq
3120 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgtctaacaaagattatactgtttcagcggatttaaaagcgaatacaggtaagtttaaa
aaagctatcaaaacggctattcaaacgttacaacggtatgaaaaaacaatagctaggatt
aaagatgttgaattgaaagctgatgacaagctaattgaagaaaaagttaaacaagcggaa
ttagctttggaaagaattgacggcaaaaaagcaaatgccacaatagacgcaagcacaaaa
atagctgaaactaaactaaaaaattatgaaaaagccttacaatttttagataataaatca
gttaaaacagctatcgatttgcaagatagactttttgtaactaaattcaataaaacaaaa
gctgaaattaataaattggatggtaaaacagtcaatacagaattagaagttaaaaacagt
gttgctaataacaagattagactatttaaagcgttgctacgaagcataccgaatcgaaga
aaagttcgagtcgatgtagatggaaaaggttcaaaaaatcctttttctaaaatgttagat
tacctcaacaaacaaagtgatgaattcgtagcgcatatggatcgtatcgctaaatcaatc
cgaacatttgggactattggcgctaatatgattaaaggcacgttgttgtcatcgtttagt
gcgttgattccaataattgcaagcttagtgccagcgattatggcggttggtaacgctttg
gctgttgtcggtggtggtgctatcggtttagcgggctcttttgctattgcaggggctggc
gtagttggatttggtgcgatggctatatctgcaattaaaatgcttgaagctggaacattg
caagcaagtgctgcaacttatgcatacaagcgtagtcttgaaggtgtaacaagtgagtgg
cagaaaatcattagattgaatgctgattcgatttttggtgctttatcatcagctttgaat
ggtgtacaaaccactttaaaaaacttaactccatttttaaaaggtgtttcagaagctgta
aattctagcgcgcaaagttttgagaaatgggtgacatcatctagtacagctaaaaaagct
tttgaatctatgaatacgtcaggtgttaaagtcttttcaagtttattgagtgcagcaggc
cgttttgctgatgggttcgttaatatactaacgcaatttacgccactttttgagtttgta
gcaaacggattgaataacatgggtgcatcattccaaaaatgggcaaacaaagtctcaacc
caaaatggtattcaaaaatttatcgattatgtgaaagtgaatttaccgattataggtaaa
attttcggcgatacatttataggtatctttaatctattcaaagcatttggttcaaattct
caatctatatttgaatcgctagcacaaatggctagtagatttagaacgtggtctgaacaa
attgctcaatcagatggatttaaaaagtttattgattatgtacaacaaaatggcccgaca
attatgagcttgattggcaacatcataatggtgttggtcaattttggtacagcaatggca
cctatagcgagcgttgtactaaatgttgttactgcgataaccggttttgttgcaaagtta
tttgaaactcaccctatcgttgctcaaatcataggcttagccattacttttgccggtgtc
ttaatgacttggtatcctgttttatcgggtattgttaagtttttaggtcctttaatatca
aaattaggtttcttaagagcggtattaccattaataggtaaagctttttctttattaagc
ggtcctattggtttagtagcgaggttattaccgttacttggcgctgcaatcgggttttta
acttctccaatcggattagttatcggtgcaattatcgcattaattgcgattttcgttatt
ttgtggaacaaaaacgaggcatttagaaatttcatcatcaatttatggaattcaattaaa
gatttctttataaatctgtggacaactttagcaacgatagcatctgttttatggcaatta
ttacttacaacaatcgtgaatattgttataagtatacaaacgtggttaacaacaacatgg
caaaatatactaacgtttttatcaactttatggaatacgttaatcgtgattgcaacaaca
atttggaatttgcttgtgactgttattgtaactgttatcactacgatactaaccgttcaa
caaacgatatggaattcaattttaagttttttacaaacgatatggaacaccgttgtttcg
gtagcaacaactgtttggaacacattagtaactgttatcacaactgttttaaatgctata
aattcatttgtaacaacaatttggaatgctatatacagtttcttcgcttcaattttaagt
agaatctcatctactgtaagtcaaaaatttagtgaagtttatagatggatttcaacaaaa
attcaacaagcgtatagcattttaagctctattttatcgaacatgtggtcggtcgtatca
agtaaattcagtcaaattgtgtctactgtaatttcaaaaatggtagaattttacaatgcc
attaaacaaaaagtacaggattcgcttaatgcggtagtcaattttgttggtgaatttatg
gacgccggtaggaatctcataatgggattagttaacggagtgaaaaatgcagcaggtgcc
ttaattgacgcggtaactggcgcagttagtggtgctattgataaagcgaaatctttatta
ggtatcaaatcgccttcacgtgtctttaagcagattggtgtgtacacaatgcaaggttta
ggaattggtgttgatcaagagggacaaaatgcagttggtagcgttgtcgacgtcgctaga
caattaacgaaagcgtttaatccagttttaagtttgcctagcatatctgatgctacaagt
ggtttaaatggattatcaggattaagtgcaaacctcacaacacaaatccaacacacacat
tcgtttgaaactagccctagaatgaaaacggtaagaattgaaatgagattagacaatgat
gcaatttacggcattgttaacgataaacaggcagaaaaacattcaatctttgaaatgtag
DBGET
integrated database retrieval system
