Candidatus Profftella armatura: SSDC_00255
Help
Entry
SSDC_00255 CDS
T02777
Symbol
secY
Name
(GenBank) preprotein translocase membrane subunit
KO
K03076
preprotein translocase subunit SecY
Organism
ssdc
Candidatus Profftella armatura
Pathway
ssdc02024
Quorum sensing
ssdc03060
Protein export
ssdc03070
Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ssdc00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03060 Protein export
SSDC_00255 (secY)
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
03070 Bacterial secretion system
SSDC_00255 (secY)
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
SSDC_00255 (secY)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
ssdc02044
]
SSDC_00255 (secY)
Secretion system [BR:
ssdc02044
]
Sec (secretion) system
Prokaryotic Sec-SRP core components
SSDC_00255 (secY)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SecY
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGS06746
UniProt:
S5RLD2
LinkDB
All DBs
Position
41052..42374
Genome browser
AA seq
440 aa
AA seq
DB search
MPKFSKTTIRGFPWNRLWFLFCALFIYRLGAHIPIPSINYSQLTKLFEKNQNNILGMFNM
FSGGALSRLTIFSLGIMPYISSSIIMQLLSSIMPKFENLKKEGELGKYKIAQYTRFSTLI
LAILQGSGISLILKFQKNLVLDTSFYFHFTTVLTLVSGTIFLMWLSEQITEYGLGNGTSI
IICSGIISSFPNILINLLKLVKIDLVNVLLTILISLLLLIITYFVIFIECGQRKILINYI
RKEANNKIYSNKRSYLPLKLNIAGVIPAIFASYIILFPITIIGWFLSFYNKNNFFTIFLK
NLISLVAPGKLIHSILYTIAIIFFSFFYATLIFNSKETADNLKKSGAFIPGIRPGYQTIR
YINNIIMRLTLAGSIYIAFICLIPEFFIYKFNVPFYCGGTSLLIVIIVTIDFLTQIQNHI
LSQKYKSLFRKINFKKNIFY
NT seq
1323 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccaaaattctcaaagacaactataagaggttttccatggaatcgtttatggttctta
ttttgtgcattatttatataccgtttaggtgcgcatattcctattccttcaattaattat
agtcagctaacaaaattatttgagaaaaatcaaaataatattttaggaatgtttaatatg
ttttctgggggggctctttctcgtttaactatattttcattaggtattatgccttatatt
tcttcatcaataattatgcaattattatcaagtataatgcctaaatttgagaatttaaaa
aaagagggtgaattaggaaaatataaaattgctcaatatactagatttagtacattaatt
ctagcgatattacagggatctggaatttctttaatacttaagtttcaaaaaaatttagta
ttagatactagtttttattttcattttacaactgtactaacattagtatctggtacaatt
tttttaatgtggttaagtgaacaaataacagaatatggattaggaaatggtacttctatt
attatttgttctggaattatttcaagttttcctaatattttaattaatttactaaaatta
gttaagatcgatttagtaaatgtattattaacaattttaatttctttattattattaatt
attacatattttgttatatttattgaatgtggtcaacgtaaaattttaataaattatatt
agaaaagaagcaaataataaaatttattctaataaaagaagttatttaccattaaaatta
aatatagcaggcgttattccagcaatatttgcgtcatatattatattatttccaattact
attattggttggtttctttctttctacaataaaaataatttttttacaatttttttaaaa
aatttaataagtttagttgctcctggtaaattaattcattctatattatatacaatagca
attatatttttttcttttttttatgctactttaatatttaatagtaaagaaacagcggat
aatttaaaaaaaagtggtgcttttattcccggtattcgtccaggttatcaaactatacgt
tatattaataatataattatgcgtttaacattagctggatctatttatatagcttttatt
tgtttaataccagagttttttatttataaatttaatgttcctttttactgtggggggaca
tcgttattaattgttataattgttactatagattttttaacacaaattcagaatcatatt
ttatcacaaaaatataaatcactttttcgtaaaataaattttaaaaaaaatatattttat
tag
DBGET
integrated database retrieval system
