Candidatus Profftella armatura: SSDC_00350 Help Entry SSDC_00350        CDS       T02777                                  Name (GenBank) ribonuclease II   KO K01147   exoribonuclease II [EC:3.1.13.1] Organism ssdc  Candidatus Profftella armatura Brite KEGG Orthology (KO) [BR:ssdc00001]  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    03016 Transfer RNA biogenesis [BR:ssdc03016]     SSDC_00350 Enzymes [BR:ssdc01000]  3. Hydrolases   3.1  Acting on ester bonds    3.1.13  Exoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters     3.1.13.1  exoribonuclease II      SSDC_00350 Transfer RNA biogenesis [BR:ssdc03016]  Prokaryotic type   3'processing and CCA adding factors    3'processing factors     SSDC_00350 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  RNB Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  AGS06764 UniProt:  S5R3J0 LinkDB All DBs Position 57981..59855 Genome browser AA seq 624 aa AA seqDB search MNLLFEKYGTFKVGTIFSQNGNFYQVKIISGRHIKVKNSDILLRFSTPNPDQLIKKAKLL ANEIDLNFLWEIVGTKKFYFFDLGIEYFGHTPLSYEAASLLFCLHNSPIYFYKKGKGYYK AVPRELLKTTKIHLEKKKLQIKLQNEYISKLKNKEIPDRIQDLALQLLFKPDKNSIEYKA LNIVSRELQISPERLMIDYGIIKSTEQLHYKNFLFHFFPNGITFPDLIISNLPKLPVADN IRAFSIDDASTTEIDDALSVVKLSCGKIQIGIHIAAPGLCIKRNDLIDNFIRERMSSIYI PGNKITMLPSNIINKFSLNEGKTRAALSLYSILNPIDWSLISTETRVEMVYIVSNLRNNY LNSLTEEILNSGEGNYPHKNDISILWKWAKVLEKKRMIKRKYFGLQSKKSDQIDFNFSIK NNIVTITSYKRDKSINKIISELMIFANTNWGKLISNHNIPGVYRAQGESEYTSKTQVRMI THPAPHKELGVNQYAWSTSPLRRYIDLVNQWQILSCIKYKKIPIQASFEFGDTDLFDIIS SFDKLNSSYSYFQKKMERYWCLRWLLQNKIKLIQATVIKNEIVQLLNLPLVIRLPGQKLI QGAQVKLNLLYIDEINLTIEAKLL NT seq 1875 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgaatttactttttgaaaaatatggtacctttaaagttggtacaattttttctcagaat ggtaatttttatcaagttaaaataatttctggtcgacatattaaagtaaaaaatagtgat attttgttacgattttccaccccaaatccagatcaattaattaaaaaagcaaaattatta gctaatgaaattgatcttaattttttatgggaaattgttggaacaaagaaattttacttt tttgatctaggtatagaatatttcgggcatactccattatcatatgaggcagctagttta ttattttgtttacataattctcctatttatttttataaaaaagggaaaggatattataaa gcggtacctagagaattattaaagacaactaaaattcatttagaaaaaaaaaaattacaa ataaaattacaaaatgaatatattagtaaattaaaaaataaggaaataccagatagaata caagatctggctttacagttgctatttaaaccagataaaaatagtatagaatataaggca ttaaatattgtgagtagagaattacaaatatctccagaacgtttgatgattgattatgga ataattaaatcaactgaacaattacattataaaaattttttatttcatttttttccaaac ggtattacatttccagatttaattatatctaatttaccaaaattacctgtagctgataat atacgcgcattttctattgatgatgcttcaactactgaaattgatgatgctttgtcagtt gttaaactttcgtgtggaaaaattcaaataggaatacatattgctgctccaggtttatgt ataaaacgtaacgatttaatcgataattttatacgagaacgcatgtcaagtatatatatt cctggaaataaaatcactatgttacccagtaatataattaataaatttagtttaaatgag ggaaaaactcgtgccgcattatctctttattcaatattaaatccaatagattggtcatta atttctacagaaactcgagtagaaatggtttatattgtatctaatttgaggaataattat ttaaactcattaacagaagaaatattaaattctggtgaaggtaattatccacataaaaat gatatttcaatattatggaaatgggcaaaagttcttgaaaagaaacgaatgattaaacga aaatattttggtttacaatcaaaaaaaagtgatcaaattgattttaatttttctattaaa aataatatagtaaccattacttcttataaaagagacaaatcaattaataaaattatatca gaattaatgatttttgctaataccaattggggtaaattaatttctaatcataatattcct ggagtttatcgcgcacaaggagaaagcgagtatacatcaaaaacacaagttcgtatgata acgcatcctgctcctcataaagaactgggtgttaatcaatatgcctggagtacttcacca ttaagaagatatatagatttagttaatcaatggcaaatattgtcatgtataaaatataaa aaaatacctatacaagcatcctttgaatttggtgatacagatttatttgatattatatca tcatttgataaattaaattctagttattcttattttcaaaaaaaaatggaacgttattgg tgtttacgttggttattacaaaataaaattaaattaattcaagcaactgttattaaaaat gaaattgttcagttattaaatttacctttagtaattcgtttacctggtcaaaagttgata caaggcgcgcaagttaagttgaatttattatatatagatgaaattaatttaactattgag gctaaattattatga

DBGET integrated database retrieval system