Candidatus Profftella armatura: SSDC_00970
Help
Entry
SSDC_00970 CDS
T02777
Symbol
mutY
Name
(GenBank) A/G-specific adenine glycosylase
KO
K03575
A/G-specific adenine glycosylase [EC:
3.2.2.31
]
Organism
ssdc
Candidatus Profftella armatura
Pathway
ssdc03410
Base excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ssdc00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03410 Base excision repair
SSDC_00970 (mutY)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
ssdc03400
]
SSDC_00970 (mutY)
Enzymes [BR:
ssdc01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.2 Hydrolysing N-glycosyl compounds
3.2.2.31 adenine glycosylase
SSDC_00970 (mutY)
DNA repair and recombination proteins [BR:
ssdc03400
]
Eukaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
BER (base exicision repair)
DNA glycosylases
SSDC_00970 (mutY)
Prokaryotic type
SSDC_00970 (mutY)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HhH-GPD
NUDIX_4
HHH
HHH_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGS06884
UniProt:
S5R3V7
LinkDB
All DBs
Position
227093..228187
Genome browser
AA seq
364 aa
AA seq
DB search
MKKFDKIFFSNTIISWQKKYGRHMLPWQNTKNTYYIWLSEIMLQQTQVNTVIPYYQRFLK
KFPNIMSLAQAKLENVMELWSGLGYYSRARNLHICAKLVFFKYNGIFPKNFISLINLPGI
GQSTASAIRVFAYGKRNAILDGNVKRILIRVLGINCSLNIKFIEKKLWRYAIDLLPKKNI
EIYTQGLMDFGSIICKKIKPKCKVCPLQLCCISYKTNKINNFLIKNKKNIKNCSIIMFIV
IDDDYVLFQKRSNKGIWGGLLSFPEWILKDKIINFVDNNLKNLIELEIKKFISSFGFIKN
YLILPIISHKLTHLQFKIVPCHIFLKKCFLKENKNNFIWYPIKKIKNSPIPAPVRKILFQ
IIQR
NT seq
1095 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaatttgataaaatttttttttctaatactatcatttcttggcaaaaaaaatat
ggtagacatatgttaccatggcaaaatacaaaaaatacatattatatatggttatctgaa
attatgttacaacaaacccaagttaatactgttattccatattatcaacgttttttaaaa
aaatttccaaatataatgtccttagcacaagctaaattagaaaatgttatggaattatgg
agtggacttggttattattccagggctagaaatttacatatttgtgctaaacttgttttt
tttaagtataatggaatttttccaaaaaattttatttcattaataaatttaccaggaatt
ggacaatcaaccgcttccgctattagagtatttgcttatggaaaaagaaatgctatttta
gatggaaatgttaagcgtatccttataagagtgttaggaattaattgttctttaaatatt
aaatttatcgaaaaaaaattatggcgatatgctattgatttattaccaaaaaaaaatata
gaaatatatactcaaggtttgatggattttggttcaataatttgtaaaaaaataaaacct
aaatgtaaagtttgtcctttgcaactatgttgtataagctataaaactaacaaaatcaat
aattttttgattaaaaataaaaaaaatatcaaaaattgttctataataatgtttatagtg
attgatgatgattatgtactttttcaaaaaagatcaaataaaggtatttggggtggatta
ttatcttttccagaatggatattaaaagataaaattattaattttgtagataataattta
aaaaatttaattgaacttgaaattaaaaaatttatatcatcatttggatttataaaaaat
tatttaatattacctataatttctcataaattaacacatttacaatttaaaattgtacct
tgtcatatttttttaaaaaaatgctttttaaaagaaaacaaaaataattttatatggtat
ccaataaaaaaaataaaaaattctcctattcctgctccagtaagaaaaatattatttcaa
ataatacaaagataa
DBGET
integrated database retrieval system