Candidatus Profftella armatura DC: SSDC_01195
Help
Entry
SSDC_01195 CDS
T02777
Symbol
miaB
Name
(GenBank) (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase
KO
K06168
tRNA-2-methylthio-N6-dimethylallyladenosine synthase [EC:
2.8.4.3
]
Organism
ssdc
Candidatus Profftella armatura DC
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ssdc00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
ssdc03016
]
SSDC_01195 (miaB)
Enzymes [BR:
ssdc01000
]
2. Transferases
2.8 Transferring sulfur-containing groups
2.8.4 Transferring alkylthio groups
2.8.4.3 tRNA-2-methylthio-N6-dimethylallyladenosine synthase
SSDC_01195 (miaB)
Transfer RNA biogenesis [BR:
ssdc03016
]
Prokaryotic type
tRNA modification factors
Methylthiotransferases
SSDC_01195 (miaB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UPF0004
Radical_SAM
TRAM
B12-binding
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGS06928
UniProt:
S5RPX8
LinkDB
All DBs
Position
complement(299260..300603)
Genome browser
AA seq
447 aa
AA seq
DB search
MQKKLFIKTFGCQMNEYDSNKIFDILNYSNNIIKTNDPEEADIILLNTCSVRIKAQEKIF
SNLGRLYKLKLKKPNLLIGVGGCVASQEGQAILKRAPYVDIIFGPKTLHRLPQMIYKRKI
SGKTQIDINFPEIEKFDYMPPAKINGITAFVSIIEGCSKYCSYCIIPYTRGEEVSRKFNS
IINEIYELISQGVKEITLLGQNVNAYKDTIIDNNGFTQIIDFPLLIEYIANISDIKRIRF
ITSHPKEFTQRLIDTYSKTSKLVNHLYLPAQHGSDRILSKMKRGYTINEYKLILKNLREI
RPDISISSDFIVGFPGETDEDFNELIKLVKNIGYDKSFSFIFSPRPGTPAANLIDNVSHE
IKLKRLKYLQEIIKKNVNKINFKMIGSTQKILVESRSKKNIFEMQGRTENNRIVNFNIGS
NNLNLIGKLIDVKILKICSNSLKAKII
NT seq
1344 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaaaaaaattatttattaaaacttttggatgtcaaatgaatgaatatgattcaaat
aaaatttttgacatattaaactattcgaataatattattaaaactaatgatccagaagaa
gctgacattattttgcttaatacatgctctgtacgtattaaagctcaagaaaaaattttt
tctaacttaggtagattatataaactgaaattaaaaaaacctaatttattgattggtgtt
ggtggatgtgttgcatcgcaagaaggtcaagctattttaaaaagagcaccatatgttgat
ataatatttggaccaaaaactttacatagattacctcaaatgatctataaacgtaaaatt
agtggtaaaacacaaattgatattaattttccagaaattgaaaaatttgactatatgcct
ccagctaaaattaatggaattactgcttttgtatctattatagaaggttgcagcaaatac
tgtagttattgtataattccttacactagaggcgaagaagtttctagaaaatttaatagt
ataataaacgaaatatatgaacttatttcacagggagtaaaagaaattacattacttggg
caaaatgtaaatgcttataaagatacaataattgataataatggatttactcaaatcata
gattttcctttattaattgaatatattgcaaatatttctgatataaaacgtattcgtttt
attactagtcatccaaaagaatttactcaacgtttaatcgatacttactccaaaacatca
aaattagttaatcatttatatttaccagcacaacatggttcagatagaattttatcaaaa
atgaaaagaggttatactattaatgaatataaattaatattaaaaaatttacgtgaaata
cgaccagatatttctatttctagcgattttattgttgggtttccaggggaaactgatgaa
gattttaatgaattaattaaattagtaaaaaatatcggatatgataaaagttttagtttt
atttttagtccaagaccaggaactccagctgcaaatttaatagataatgtatctcatgaa
ataaaattaaaacgtttaaaatatttacaagaaataataaaaaaaaatgtaaataaaatt
aattttaaaatgattggtagtacacaaaaaattttagtcgaatctagatctaaaaaaaat
atttttgaaatgcaaggtcgaactgaaaacaatcgtattgtgaattttaatatcggatca
aataatcttaatttaattggtaaattaattgatgttaaaattttaaaaatttgctcaaat
tcattaaaagcaaaaattatataa
DBGET
integrated database retrieval system
