KEGG   Candidatus Profftella armatura DC: SSDC_01555
Entry
SSDC_01555        CDS       T02777                                 
Symbol
trmE
Name
(GenBank) tRNA modification GTPase TrmE
  KO
K03650  tRNA modification GTPase [EC:3.6.-.-]
Organism
ssdc  Candidatus Profftella armatura DC
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ssdc00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03016 Transfer RNA biogenesis [BR:ssdc03016]
    SSDC_01555 (trmE)
Transfer RNA biogenesis [BR:ssdc03016]
 Eukaryotic type
  tRNA modification factors
   Other tRNA modification factors
    SSDC_01555 (trmE)
 Prokaryotic type
   Methyltransferases
    SSDC_01555 (trmE)
SSDB
Motif
Pfam: MnmE_helical TrmE_N MMR_HSR1 FeoB_N Roc Ras AIG1 Dynamin_N RsgA_GTPase MCM MMR_HSR1_Xtn Septin
Other DBs
NCBI-ProteinID: AGS06996
UniProt: S5RM26
LinkDB
Position
380814..382232
AA seq 472 aa
MLTKNSPIIGIATPPGRGGVGIIRLSGKNLWSIVEIVCKKTKKQLKPRFATYSSFFCKNN
NIIDKGLVIYFKAPHSYTGEDVIELHGHGGPIILHMLLSSCLEIGKSIGLRLAMPGEFTK
RAFLNNKLDLIQVEAIIDLINASTESAAKSAMISLSGKFSKLINILLDKLINLRTLIEFS
FDFPEENQELILNKNDFFNELIKIKKKLLKIIQQGKKRALIRNGLNVVLIGQPNVGKSSL
FNSLVGSDVAIVTSIAGTTRDKITKTIQINKFLFKITDTAGIPDINSKIKKNINEVEKIG
IERTWVELKNSDIIIYVQDARYDKHTDFDKKIIKNFPMNIPVIYVWNKIDYSGHQKNINY
KNNIANIYLSASKGIGINLLRNTLLDLIEKTQTIESSPYLARERHIHSLNEANYYLSCAI
KIINQSEKNFEKNLELIAEDLRFCHEKLSSIIGKSTTNDLLDNIFSQFCIGK
NT seq 1419 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgttaacaaaaaattctcctattattggaatagccactcctccaggaagagggggagta
ggtattattcgtttatctggaaaaaatctttggtcaattgttgaaatagtttgtaaaaaa
acaaaaaaacaattaaaaccacgttttgctacttattcatcttttttttgtaaaaataat
aatattattgataaaggtttagttatttattttaaagctccacattcttatacaggagag
gatgtaatagaattacatggacatggcggaccaattatattacatatgttattatcttct
tgtttagaaataggtaaaagtattggattaagattagctatgccaggtgaatttactaaa
cgagcttttttaaataataaattagatttaattcaagtagaagcaataattgatttaatt
aatgcctctacagagtccgcagctaaatcagcaatgatttctttatctggaaaattttct
aaattaattaatatattattagacaaattaattaatttacgtactttaattgaattttct
tttgattttccagaagaaaatcaagaattgattttaaataaaaatgatttttttaatgag
ttaattaaaatcaaaaaaaaattattaaaaataatacaacaaggtaaaaaaagagcatta
attcgtaatggacttaatgtagttttaattggacaaccgaatgtaggaaaatcttcatta
tttaattctttagttggttctgatgttgcaattgtaacttctattgcaggaactacacga
gacaaaatcactaaaactattcaaattaataaatttttattcaaaattactgataccgcg
ggtattcctgatattaatagtaaaataaaaaaaaatattaatgaagttgaaaaaattggt
attgaacgtacttgggttgagttaaaaaattctgatattattatttatgtgcaagatgca
cgttatgataaacataccgattttgacaaaaaaataataaaaaattttccaatgaacatt
ccagtaatttatgtttggaataaaattgattattctggacatcaaaaaaatattaattat
aaaaataatatagctaatatttatttatcagcaagtaagggtattggaattaatttatta
cgaaatactttactagatttaattgaaaaaactcaaactattgaatcatccccttattta
gcgcgtgaacgtcatatacactctcttaatgaagctaattattatttatcttgcgcaata
aaaattatcaatcaatcagaaaaaaattttgaaaaaaatttagagttaattgctgaggat
ttacgattttgtcatgaaaaattaagtagtattattggtaaatctacaacaaatgattta
ttagataatatattttcacaattttgtattggaaaataa

DBGET integrated database retrieval system