Shewanella sediminis: Ssed_2036
Help
Entry
Ssed_2036 CDS
T00596
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
sse
Shewanella sediminis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sse00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sse02000
]
Ssed_2036
Transporters [BR:
sse02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Ssed_2036
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABV36645
UniProt:
A8FUX2
LinkDB
All DBs
Position
2464419..2466944
Genome browser
AA seq
841 aa
AA seq
DB search
MIRTSQHSRSKLASAIKFGLIASVSTTAFTVSTSAVAEEAKVERIAVTGSRIQRQDMETA
SPVTVIDAATIKAEGFTSVDQMLQAQTSMAGAAMGSSTNNGSDGVAQVDLRGMGSQRTLV
LLNGRRMVNSGSGADSAVDLNSIPVAMIARVEILKDGASAVYGSDAIAGVVNIITKKDFE
GFQIDVTGGMTDKSDGENGEISALYGFNTDTGNYTFGAAYSERRGVVQSDRDWTDPGASS
FIPNGSLGGMVKDENGNWVDREEGYDYTQDSFYQTPSKRYSLFANMTQELGDDLVLTGDI
LYTKRKSNQQLAPQPANLDLDVCEAGDDPTKCVELDQDMIDAGITPNDKGQVNYRKRMSD
VGPRIYTQDTDTLRVSAGLAGSIDVNTGMDWDLAYTYGKNKAKTAVENSINASIMTDAIY
ADQDPWLTGQPMTDQDLLNSVAYTEEADGGNEQHVFSAGLTGELFDLDAGAVAYAIGAEY
RYESGYYNPDPIVVAGESTAAQQDPTDGNYNVISVFQEVSVPFTDKLTGEFALRFDDYST
FGNASTWKIGLTYEATDDLMIRTVAATGFRAPSVSELYGGNSGSFDYLDDPWGNEQDPQI
LVIRTSDEDLKPEESESYTAGLVYSPSYVDGMSLTVDYWRFKVKNAIARMDTQNGLNNCF
AGDQAACEAFNIGPNGDLDNLTNSLTNVGYQDTSGIDFNLAYSFEALSLDWTISNDTTYL
LNFEQDGVDYTNTIDGNFGAYAQVRNNFSIKAGQDDWSVMYFNRYIGEMDDLGEGTKVDA
ILYHNVSASYYFNDTWMVSAGVKNLTDEEPSNVSNGSAGGTVPEVYDTIGRQYYAGVTVK
F
NT seq
2526 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataagaacatcgcagcattctcgtagtaaattagcctcagcaattaaatttggttta
attgcttcagtatcaaccacagcatttaccgtatcaacaagtgcggtggcagaagaagct
aaagtcgaacgtattgcagtaaccggctcccgtattcaacgacaagatatggaaacagca
tctcctgtaacagtgattgatgctgcgactatcaaagctgaaggtttcacttcagtagac
caaatgctacaagcacaaacttctatggctggtgccgcaatgggttcaagcaccaacaat
ggctcagacggtgttgctcaggttgaccttcgtggtatgggctcgcagcgtacgctggta
ttgttaaatggtcgccgcatggtgaactcaggttctggtgctgacagcgctgtggatctg
aactctattcctgtcgctatgattgcacgtgtcgagatccttaaagacggcgcttcagcg
gtatatggttcagacgccattgccggtgttgtaaacattatcactaagaaagattttgaa
ggcttccagattgatgttactggtggcatgactgataagagcgacggtgaaaacggcgaa
atcagtgccctttacggttttaatactgatacgggtaactacacattcggtgcggcttac
tccgagcgtcgtggtgtggttcagtctgaccgtgactggacagatcctggtgccagctca
ttcattccaaacgggtcattgggcggaatggttaaagatgagaatggtaactgggttgac
cgtgaagaaggctacgattatacacaagacagcttttatcaaacgccgagtaagcgttat
agcttgttcgctaacatgacgcaagaacttggcgatgatctggtgctaacgggtgatatc
ctttacaccaagcgtaagtcaaaccagcagttggcgccacaaccagctaatctcgacctt
gatgtttgtgaagcaggtgacgatcctactaagtgtgtagagcttgaccaagatatgatc
gatgcaggcatcacgccaaacgacaaaggccaagttaactacagaaaacgcatgagtgac
gttggtcctcgtatctatactcaggacactgatacattacgcgtctctgcaggtctagca
ggttcaattgatgttaataccggtatggattgggatcttgcgtacacttacggtaaaaac
aaagctaaaacagcggtagaaaactcaatcaatgcatcaatcatgacggatgcaatctat
gcagatcaagatccttggttgacaggtcagccgatgacagaccaggatttgctgaacagt
gttgcttacactgaagaagctgatggtggtaatgagcaacatgtattctctgcgggtcta
acgggtgagttatttgaccttgatgccggtgctgtggcatatgcaatcggtgctgaatac
cgttacgaaagcggttactacaacccagaccctattgtggttgcgggtgaaagtactgct
gcacagcaagatccaacagatggtaactacaatgtaatttctgtattccaggaagtcagc
gtgccatttacggataagctgaccggtgaattcgcacttcgttttgacgattactcaaca
tttggtaatgcgtcaacctggaaaattggtctaacatacgaagcgacagatgatttgatg
atccgcaccgtagcagcgacgggcttccgtgctcctagcgttagcgagctatacggcgga
aactcaggttcattcgattacctggatgatccatggggtaatgagcaagacccacagatc
ttagtgattcgtacctctgatgaagatcttaaacctgaagagtctgagtcatatactgcg
ggcttagtgtattcgcctagctatgtggatggcatgtcgttaactgtagattactggcgc
tttaaagttaaaaacgcgattgctcgcatggatacacaaaatggcctaaacaactgtttt
gcaggtgatcaggcggcatgtgaagcgttcaacattggaccaaacggcgatctagataac
ctaacaaactcgctaactaacgtaggctaccaagatacaagcggtatcgattttaactta
gcctatagctttgaagcgttgagcttagattggacaataagcaatgataccacctatttg
ctgaactttgagcaagatggcgttgattacacaaataccatcgatggtaatttcggtgct
tatgctcaagttcgtaacaacttcagcattaaagcgggtcaagatgattggagcgtcatg
tacttcaaccgttatattggtgaaatggatgacttaggtgaaggtactaaggttgatgct
attctatatcacaacgtatcagcatcttattacttcaatgatacttggatggtgagtgcg
ggcgttaagaacctgactgacgaagagccatcaaatgtgtctaacggtagtgccggtggt
actgtaccagaagtgtatgacaccattggtcgccaatattacgctggcgtaaccgtcaag
ttctag
DBGET
integrated database retrieval system